CDH1

CDH1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y, 4ZT1, 4ZTE
Ідентифікатори
Символи	CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1
Зовнішні ІД	OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • GO:0001948 protein binding; • ankyrin binding; • gamma-catenin binding; • beta-catenin binding; • GTPase activating protein binding; • зв'язування з іоном металу; • cell adhesion molecule binding; • cadherin binding; • identical protein binding; • cytoskeletal protein binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• apical junction complex; • trans-Golgi network; • extracellular region; • perinuclear region of cytoplasm; • cortical actin cytoskeleton; • комплекс Ґольджі; • lamellipodium; • cytoplasmic side of plasma membrane; • ендосома; • lateral plasma membrane; • catenin complex; • actin cytoskeleton; • flotillin complex; • мембрана; • Екзосома; • integral component of membrane; • Міжклітинні контакти; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • cell surface; • postsynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• negative regulation of cell-cell adhesion; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to lithium ion; • адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • cellular response to indole-3-methanol; • extracellular matrix disassembly; • synapse assembly; • pituitary gland development; • response to toxic substance; • response to organic substance; • neuron projection development; • adherens junction organization; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • entry of bacterium into host cell; • protein localization to plasma membrane; • cell-cell adhesion; • cell morphogenesis; • cell-cell junction assembly; • Регуляція експресії генів; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • negative regulation of cell migration; • positive regulation of protein import into nucleus; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	999
	12550
	ENSG00000039068
	ENSMUSG00000000303
	P12830
	P09803
	NM_004360; NM_001317184; NM_001317185; NM_001317186
	NM_009864
	NP_001304113; NP_001304114; NP_001304115; NP_004351
	NP_033994
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPWSRSLSA	LLLLLQVSSW	LCQEPEPCHP	GFDAESYTFT	VPRRHLERGR
VLGRVNFEDC	TGRQRTAYFS	LDTRFKVGTD	GVITVKRPLR	FHNPQIHFLV
YAWDSTYRKF	STKVTLNTVG	HHHRPPPHQA	SVSGIQAELL	TFPNSSPGLR
RQKRDWVIPP	ISCPENEKGP	FPKNLVQIKS	NKDKEGKVFY	SITGQGADTP
PVGVFIIERE	TGWLKVTEPL	DRERIATYTL	FSHAVSSNGN	AVEDPMEILI
TVTDQNDNKP	EFTQEVFKGS	VMEGALPGTS	VMEVTATDAD	DDVNTYNAAI
AYTILSQDPE	LPDKNMFTIN	RNTGVISVVT	TGLDRESFPT	YTLVVQAADL
QGEGLSTTAT	AVITVTDTND	NPPIFNPTTY	KGQVPENEAN	VVITTLKVTD
ADAPNTPAWE	AVYTILNDDG	GQFVVTTNPV	NNDGILKTAK	GLDFEAKQQY
ILHVAVTNVV	PFEVSLTTST	ATVTVDVLDV	NEAPIFVPPE	KRVEVSEDFG
VGQEITSYTA	QEPDTFMEQK	ITYRIWRDTA	NWLEINPDTG	AISTRAELDR
EDFEHVKNST	YTALIIATDN	GSPVATGTGT	LLLILSDVND	NAPIPEPRTI
FFCERNPKPQ	VINIIDADLP	PNTSPFTAEL	THGASANWTI	QYNDPTQESI
ILKPKMALEV	GDYKINLKLM	DNQNKDQVTT	LEVSVCDCEG	AAGVCRKAQP
VEAGLQIPAI	LGILGGILAL	LILILLLLLF	LRRRAVVKEP	LLPPEDDTRD
NVYYYDEEGG	GEEDQDFDLS	QLHRGLDARP	EVTRNDVAPT	LMSVPRYLPR
PANPDEIGNF	IDENLKAADT	DPTAPPYDSL	LVFDYEGSGS	EAASLSSLNS
SESDKDQDYD	YLNEWGNRFK	KLADMYGGGE	DD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA.. Mol. Biol. Rep. 17: 123 — 128. PubMed DOI:10.1007/BF00996219
Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754 — 1761. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1994.1656
Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284 — 1290. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1994.2321
Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin.. Differentiation 38: 67 — 71. PubMed DOI:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246 — 4250. PubMed DOI:10.1073/pnas.87.11.4246
Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion.. FEBS Lett. 355: 195 — 200. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(94)01205-9

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P12830 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P12830 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.