CSF2

CSF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CSG, 2GMF, 4NKQ, 5C7X, 5D70, 5D71, 5D72, 4RS1
Ідентифікатори
Символи	CSF2, GMCSF, colony stimulating factor 2, CSF
Зовнішні ІД	OMIM: 138960 MGI: 1339752 HomoloGene: 600 GeneCards: CSF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity; • granulocyte macrophage colony-stimulating factor receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • protein tyrosine kinase activity; • cytokine activity;
Клітинна компонента	• extracellular region; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • extracellular space;
Біологічний процес	• negative regulation of cytolysis; • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • regulation of cell population proliferation; • MAPK cascade; • positive regulation of podosome assembly; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • positive regulation of interleukin-23 production; • positive regulation of gene expression; • embryonic placenta development; • epithelial fluid transport; • Регуляція експресії генів; • dendritic cell differentiation; • myeloid dendritic cell differentiation; • macrophage activation; • cellular response to lipopolysaccharide; • Імунна відповідь; • monocyte differentiation; • response to fluid shear stress; • response to silicon dioxide; • neutrophil differentiation; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep; • histamine secretion; • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein; • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus; • regulation of myeloid cell differentiation; • regulation of signaling receptor activity; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of cell population proliferation; • macrophage differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1437
	12981
	ENSG00000164400
	ENSMUSG00000018916
	P04141
	P01587
	NM_000758
	NM_009969
	NP_000749
	NP_034099
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CSF2 (англ. Colony stimulating factor 2) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 144 амінокислот, а молекулярна маса — 16 295[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLQSLLLLG	TVACSISAPA	RSPSPSTQPW	EHVNAIQEAR	RLLNLSRDTA
AEMNETVEVI	SEMFDLQEPT	CLQTRLELYK	QGLRGSLTKL	KGPLTMMASH
YKQHCPPTPE	TSCATQIITF	ESFKENLKDF	LLVIPFDCWE	PVQE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як поліморфізм. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kaushansky K., Lopez J.A., Brown C.B. (1992). Role of carbohydrate modification in the production and secretion of human granulocyte macrophage colony-stimulating factor in genetically engineered and normal mesenchymal cells.. Biochemistry 31: 1881 — 1886. PubMed DOI:10.1021/bi00121a042
Diederichs K., Boone T., Karplus P.A. (1991). Novel fold and putative receptor binding site of granulocyte-macrophage colony-stimulating factor.. Science 254: 1779 — 1782. PubMed DOI:10.1126/science.1837174
Miyatake S., Otsuka T., Yokota T., Lee F., Arai K. (1985). Structure of the chromosomal gene for granulocyte-macrophage colony stimulating factor: comparison of the mouse and human genes.. EMBO J. 4: 2561 — 2568. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2434 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P04141 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2434 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04141 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.