CTCF

CTCF (англ. CCCTC-binding factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 82 785[5].

CTCF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1X6H, 2CT1
Ідентифікатори
Символи	CTCF, MRD21, CCCTC-binding factor, FAP108, CFAP108
Зовнішні ІД	OMIM: 604167 MGI: 109447 HomoloGene: 4786 GeneCards: CTCF
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 21, syndromic intellectual disability[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • chromatin insulator sequence binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding Клітинна компонента • Нуклеоплазма • хромосома • Ядерце • центромера • condensed chromosome • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of transcription, DNA-templated • Епігенетичне успадкування • regulation of centromeric sister chromatid cohesion • chromosome segregation • nucleosome positioning • transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of transcription, DNA-templated • protein localization to chromosome, centromeric region • negative regulation of cell population proliferation • chromatin organization • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of gene expression • Метилювання ДНК • regulation of gene expression by genetic imprinting • maintenance of DNA methylation • negative regulation of gene expression • regulation of histone methylation • regulation of histone acetylation • positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10664	13018
Ensembl	ENSG00000102974	ENSMUSG00000005698
UniProt	P49711	Q61164
RefSeq (мРНК)	NM_001191022 NM_006565 NM_001363916	NM_181322 NM_001358924
RefSeq (білок)	NP_001177951 NP_006556 NP_001350845	NP_851839 NP_001345853
Локус (UCSC)	Хр. 16: 67.56 – 67.64 Mb	Хр. 8: 105.64 – 105.68 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, розходження хромосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.