CXCR4

CXCR4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4RWS, 2K03, 2K04, 2K05, 3ODU, 3OE0, 3OE6, 3OE8, 3OE9, 2N55
Ідентифікатори
Символи	CXCR4, CD184, D2S201E, FB22, HM89, HSY3RR, LAP-3, LAP3, LCR1, LESTR, NPY3R, NPYR, NPYRL, NPYY3R, WHIM, WHIMS, C-X-C motif chemokine receptor 4, WHIMS1
Зовнішні ІД	OMIM: 162643 MGI: 109563 HomoloGene: 20739 GeneCards: CXCR4
Пов'язані генетичні захворювання
	WHIM syndrome[1]
Реагує на сполуку
	plerixafor[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine binding; • coreceptor activity; • virus receptor activity; • signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • chemokine receptor activity; • myosin light chain binding; • actin binding; • ubiquitin protein ligase binding; • G protein-coupled receptor activity; • C-X-C chemokine receptor activity; • ubiquitin binding; • C-C chemokine binding; • C-C chemokine receptor activity; • chemokine binding; • C-X-C motif chemokine 12 receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • Ендосома; • мембрана; • cell surface; • Міжклітинні контакти; • cell leading edge; • Екзосома; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • early endosome; • late endosome; • Лізосома; • клітинна мембрана; • external side of plasma membrane; • protein-containing complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• myelin maintenance; • positive regulation of oligodendrocyte differentiation; • response to hypoxia; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • chemokine-mediated signaling pathway; • response to virus; • dendritic cell chemotaxis; • cellular response to cytokine stimulus; • хемотаксис; • inflammatory response; • calcium-mediated signaling; • Сигнальна трансдукція; • Апоптоз; • GO:0022415 viral process; • fusion of virus membrane with host plasma membrane; • regulation of chemotaxis; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • axon guidance; • Імунна відповідь; • brain development; • neurogenesis; • CXCL12-activated CXCR4 signaling pathway; • cell chemotaxis; • positive regulation of cold-induced thermogenesis; • regulation of cell adhesion; • neuron migration; • epithelial cell development; • neuron recognition; • response to activity; • cell migration; • telencephalon cell migration; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of vascular wound healing; • regulation of programmed cell death; • response to morphine; • endothelial cell differentiation; • positive regulation of neurogenesis; • regulation of viral process; • positive regulation of chemotaxis; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • regulation of calcium ion transport; • cardiac muscle contraction; • endothelial tube morphogenesis; • positive regulation of dendrite extension; • positive regulation of mesenchymal stem cell migration; • response to ultrasound;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7852
	12767
	ENSG00000121966
	ENSMUSG00000045382
	P61073
	P70658
	NM_003467; NM_001008540; NM_001348056; NM_001348059; NM_001348060
	NM_009911; NM_001356509
	NP_001008540; NP_003458; NP_001334985; NP_001334988; NP_001334989
	NP_034041; NP_001343438
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CXCR4 (англ. C-X-C motif chemokine receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 746[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGISIYTSD	NYTEEMGSGD	YDSMKEPCFR	EENANFNKIF	LPTIYSIIFL
TGIVGNGLVI	LVMGYQKKLR	SMTDKYRLHL	SVADLLFVIT	LPFWAVDAVA
NWYFGNFLCK	AVHVIYTVNL	YSSVLILAFI	SLDRYLAIVH	ATNSQRPRKL
LAEKVVYVGV	WIPALLLTIP	DFIFANVSEA	DDRYICDRFY	PNDLWVVVFQ
FQHIMVGLIL	PGIVILSCYC	IIISKLSHSK	GHQKRKALKT	TVILILAFFA
CWLPYYIGIS	IDSFILLEII	KQGCEFENTV	HKWISITEAL	AFFHCCLNPI
LYAFLGAKFK	TSAQHALTSV	SRGSSLKILS	KGKRGGHSSV	STESESSSFH
SS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, лізосомі, ендосомах.

Література

Herzog H., Hort Y.J., Shine J., Selbie L.A. (1993). Molecular cloning, characterization, and localization of the human homolog to the reported bovine NPY Y3 receptor: lack of NPY binding and activation.. DNA Cell Biol. 12: 465 — 471. PubMed DOI:10.1089/dna.1993.12.465
Nomura H., Nielsen B.W., Matsushima K. (1993). Molecular cloning of cDNAs encoding a LD78 receptor and putative leukocyte chemotactic peptide receptors.. Int. Immunol. 5: 1239 — 1249. PubMed DOI:10.1093/intimm/5.10.1239
Feng Y., Broder C.C., Kennedy P.E., Berger E.A. (1996). HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor.. Science 272: 872 — 877. PubMed DOI:10.1126/science.272.5263.872
Frodl R., Gierschik P., Moepps B. (1998). Genomic organization and expression of the CXCR4 gene in mouse and man: absence of a splice variant corresponding to mouse CXCR4-B in human tissues.. J. Recept. Signal Transduct. 18: 321 — 344. PubMed DOI:10.3109/10799899809047750
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Brelot A., Heveker N., Montes M., Alizon M. (2000). Identification of residues of CXCR4 critical for human immunodeficiency virus coreceptor and chemokine receptor activities.. J. Biol. Chem. 275: 23736 — 23744. PubMed DOI:10.1074/jbc.M000776200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P61073 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P61073 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.