CYBA

CYBA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WLP
Ідентифікатори
Символи	CYBA, p22-PHOX, Cytochrome b-245, alpha polypeptide, cytochrome b-245 alpha chain, CGD4
Зовнішні ІД	OMIM: 608508 MGI: 1316658 HomoloGene: 80 GeneCards: CYBA
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • heme binding; • protein heterodimerization activity; • electron transfer activity; • oxidoreductase activity; • superoxide-generating NAD(P)H oxidase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • phagocytic vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана; • клітинна мембрана; • perinuclear endoplasmic reticulum; • secretory granule; • neuronal cell body; • НАДФН-оксидаза; • Дендрит (нейробіологія); • apical plasma membrane; • мітохондрія; • клітинне ядро; • endoplasmic reticulum membrane; • stress fiber; • focal adhesion; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process; • cellular response to organic substance; • positive regulation of phagocytosis; • cytochrome complex assembly; • response to interleukin-1; • positive regulation of endothelial cell proliferation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • cellular response to tumor necrosis factor; • cellular response to organic cyclic compound; • negative regulation of glomerular filtration by angiotensin; • smooth muscle hypertrophy; • positive regulation of defense response to bacterium; • cell redox homeostasis; • reactive oxygen species metabolic process; • superoxide anion generation; • respiratory burst; • regulation of blood pressure; • cellular response to mechanical stimulus; • positive regulation of cell growth; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • response to nutrient levels; • cellular response to gamma radiation; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • cellular response to amino acid stimulus; • hydrogen peroxide biosynthetic process; • positive regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway; • positive regulation of superoxide anion generation; • Вроджений імунітет; • inflammatory response; • positive regulation of mucus secretion; • cellular response to glucose stimulus; • superoxide metabolic process; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • response to aldosterone; • positive regulation of NAD(P)H oxidase activity; • cellular response to L-glutamine; • response to hypoxia; • cellular response to angiotensin; • response to activity; • neutrophil degranulation; • cellular response to oxidative stress; • Електронтранспортний ланцюг; • positive regulation of blood pressure;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1535
	13057
	ENSG00000051523
	ENSMUSG00000006519
	P13498
	Q61462
	NM_000101
	NM_001301284; NM_007806
	NP_000092
	NP_001288213; NP_031832
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CYBA (англ. Cytochrome b-245 alpha chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 21 013[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGQIEWAMWA	NEQALASGLI	LITGGIVATA	GRFTQWYFGA	YSIVAGVFVC
LLEYPRGKRK	KGSTMERWGQ	KYMTAVVKLF	GPFTRNYYVR	AVLHLLLSVP
AGFLLATILG	TACLAIASGI	YLLAAVRGEQ	WTPIEPKPRE	RPQIGGTIKQ
PPSNPPPRPP	AEARKKPSEE	EAAVAAGGPP	GGPQVNPIPV	TDEVV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт електронів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом, НАДФ. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Dinauer M.C., Pierce E.A., Bruns G.A.P., Curnutte J.T., Orkin S.H. (1990). Human neutrophil cytochrome b light chain (p22-phox). Gene structure, chromosomal location, and mutations in cytochrome-negative autosomal recessive chronic granulomatous disease.. J. Clin. Invest. 86: 1729 — 1737. PubMed DOI:10.1172/JCI114898
Ueno N., Takeya R., Miyano K., Kikuchi H., Sumimoto H. (2005). The NADPH oxidase Nox3 constitutively produces superoxide in a p22phox-dependent manner: its regulation by oxidase organizers and activators.. J. Biol. Chem. 280: 23328 — 23339. PubMed DOI:10.1074/jbc.M414548200
Martyn K.D., Frederick L.M., von Loehneysen K., Dinauer M.C., Knaus U.G. (2006). Functional analysis of Nox4 reveals unique characteristics compared to other NADPH oxidases.. Cell. Signal. 18: 69 — 82. PubMed DOI:10.1016/j.cellsig.2005.03.023
Hossle J.-P., de Boer M., Seger R.A., Roos D. (1994). Identification of allele-specific p22-phox mutations in a compound heterozygous patient with chronic granulomatous disease by mismatch PCR and restriction enzyme analysis.. Hum. Genet. 93: 437 — 442. PubMed DOI:10.1007/BF00201671
Ishibashi F., Nunoi H., Endo F., Matsuda I., Kanegasaki S. (2000). Statistical and mutational analysis of chronic granulomatous disease in Japan with special reference to gp91-phox and p22-phox deficiency.. Hum. Genet. 106: 473 — 481. PubMed DOI:10.1007/s004390000288

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2577 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P13498 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2577 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P13498 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.