DDR2 (ген)

DDR2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WUH, 2Z4F
Ідентифікатори
Символи	DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN
Зовнішні ІД	OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2
Пов'язані генетичні захворювання
	spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome[1]
Реагує на сполуку
	сорафеніб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase collagen receptor activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • collagen binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • focal adhesion; • integral component of plasma membrane; • Екзосома; • apical plasma membrane; • клітинна мембрана; • actin cytoskeleton; • receptor complex;
Біологічний процес	• collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; • ossification; • фосфорилювання; • collagen fibril organization; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • regulation of bone mineralization; • positive regulation of fibroblast proliferation; • biomineral tissue development; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • extracellular matrix organization; • regulation of extracellular matrix disassembly; • positive regulation of extracellular matrix disassembly; • protein phosphorylation; • Адгезія клітин; • positive regulation of osteoblast differentiation; • chondrocyte proliferation; • positive regulation of cell population proliferation; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • endochondral bone growth; • positive regulation of fibroblast migration; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of protein kinase activity; • protein autophosphorylation; • regulation of cell-matrix adhesion; • cell-matrix adhesion; • Диференціація клітин; • regulation of extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4921
	18214
	ENSG00000162733
	ENSMUSG00000026674
	Q16832
	Q62371
	NM_001014796; NM_006182; NM_001354982; NM_001354983
	NM_022563
	NP_001014796; NP_006173; NP_001341911; NP_001341912
	NP_072075
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MILIPRMLLV	LFLLLPILSS	AKAQVNPAIC	RYPLGMSGGQ	IPDEDITASS
QWSESTAAKY	GRLDSEEGDG	AWCPEIPVEP	DDLKEFLQID	LHTLHFITLV
GTQGRHAGGH	GIEFAPMYKI	NYSRDGTRWI	SWRNRHGKQV	LDGNSNPYDI
FLKDLEPPIV	ARFVRFIPVT	DHSMNVCMRV	ELYGCVWLDG	LVSYNAPAGQ
QFVLPGGSII	YLNDSVYDGA	VGYSMTEGLG	QLTDGVSGLD	DFTQTHEYHV
WPGYDYVGWR	NESATNGYIE	IMFEFDRIRN	FTTMKVHCNN	MFAKGVKIFK
EVQCYFRSEA	SEWEPNAISF	PLVLDDVNPS	ARFVTVPLHH	RMASAIKCQY
HFADTWMMFS	EITFQSDAAM	YNNSEALPTS	PMAPTTYDPM	LKVDDSNTRI
LIGCLVAIIF	ILLAIIVIIL	WRQFWQKMLE	KASRRMLDDE	MTVSLSLPSD
SSMFNNNRSS	SPSEQGSNST	YDRIFPLRPD	YQEPSRLIRK	LPEFAPGEEE
SGCSGVVKPV	QPSGPEGVPH	YAEADIVNLQ	GVTGGNTYSV	PAVTMDLLSG
KDVAVEEFPR	KLLTFKEKLG	EGQFGEVHLC	EVEGMEKFKD	KDFALDVSAN
QPVLVAVKML	RADANKNARN	DFLKEIKIMS	RLKDPNIIHL	LAVCITDDPL
CMITEYMENG	DLNQFLSRHE	PPNSSSSDVR	TVSYTNLKFM	ATQIASGMKY
LSSLNFVHRD	LATRNCLVGK	NYTIKIADFG	MSRNLYSGDY	YRIQGRAVLP
IRWMSWESIL	LGKFTTASDV	WAFGVTLWET	FTFCQEQPYS	QLSDEQVIEN
TGEFFRDQGR	QTYLPQPAIC	PDSVYKLMLS	CWRRDTKNRP	SFQEIHLLLL
QQGDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen.. Mol. Cell 1: 13 — 23. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen.. J. Biol. Chem. 280: 40187 — 40194. PubMed DOI:10.1074/jbc.M508226200
Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function.. Cell. Signal. 18: 1108 — 1116. PubMed DOI:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors.. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265 — 290. PubMed DOI:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, Q16832 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q16832 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.