DGCR8

DGCR8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16
Ідентифікатори
Символи	DGCR8, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, DGCR8 microprocessor complex subunit, microprocessor complex subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 609030 MGI: 2151114 HomoloGene: 11223 GeneCards: DGCR8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• primary miRNA binding; • ribonuclease III activity; • double-stranded RNA binding; • GO:0001948 protein binding; • heme binding; • protein homodimerization activity; • зв'язування з іоном металу; • RNA binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • microprocessor complex; • Ядерце; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення;
Біологічний процес	• regulation of stem cell proliferation; • primary miRNA processing; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • miRNA metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	54487
	94223
	ENSG00000128191
	ENSMUSG00000022718
	Q8WYQ5
	Q9EQM6
	NM_001190326; NM_022720
	NM_033324
	NP_001177255; NP_073557
	NP_201581
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DGCR8 (англ. DGCR8, microprocessor complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 773 амінокислот, а молекулярна маса — 86 045[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
METDESPSPL	PCGPAGEAVM	ESRARPFQAL	PREQSPPPPL	QTSSGAEVMD
VGSGGDGQSE	LPAEDPFNFY	GASLLSKGSF	SKGRLLIDPN	CSGHSPRTAR
HAPAVRKFSP	DLKLLKDVKI	SVSFTESCRS	KDRKVLYTGA	ERDVRAECGL
LLSPVSGDVH	ACPFGGSVGD	GVGIGGESAD	KKDEENELDQ	EKRVEYAVLD
ELEDFTDNLE	LDEEGAGGFT	AKAIVQRDRV	DEEALNFPYE	DDFDNDVDAL
LEEGLCAPKK	RRTEEKYGGD	SDHPSDGETS	VQPMMTKIKT	VLKSRGRPPT
EPLPDGWIMT	FHNSGVPVYL	HRESRVVTWS	RPYFLGTGSI	RKHDPPLSSI
PCLHYKKMKD	NEEREQSSDL	TPSGDVSPVK	PLSRSAELEF	PLDEPDSMGA
DPGPPDEKDP	LGAEAAPGAL	GQVKAKVEVC	KDESVDLEEF	RSYLEKRFDF
EQVTVKKFRT	WAERRQFNRE	MKRKQAESER	PILPANQKLI	TLSVQDAPTK
KEFVINPNGK	SEVCILHEYM	QRVLKVRPVY	NFFECENPSE	PFGASVTIDG
VTYGSGTASS	KKLAKNKAAR	ATLEILIPDF	VKQTSEEKPK	DSEELEYFNH
ISIEDSRVYE	LTSKAGLLSP	YQILHECLKR	NHGMGDTSIK	FEVVPGKNQK
SEYVMACGKH	TVRGWCKNKR	VGKQLASQKI	LQLLHPHVKN	WGSLLRMYGR
ESSKMVKQET	SDKSVIELQQ	YAKKNKPNLH	ILSKLQEEMK	RLAEEREETR
KKPKMSIVAS	AQPGGEPLCT	VDV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shiohama A., Sasaki T., Noda S., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Molecular cloning and expression analysis of a novel gene DGCR8 located in the DiGeorge syndrome chromosomal region.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 304: 184 — 190. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(03)00554-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis.. Curr. Biol. 14: 2162 — 2167. PubMed DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
Yeom K.-H., Lee Y., Han J., Suh M.R., Kim V.N. (2006). Characterization of DGCR8/Pasha, the essential cofactor for Drosha in primary miRNA processing.. Nucleic Acids Res. 34: 4622 — 4629. PubMed DOI:10.1093/nar/gkl458
Shiohama A., Sasaki T., Noda S., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Nucleolar localization of DGCR8 and identification of eleven DGCR8-associated proteins.. Exp. Cell Res. 313: 4196 — 4207. PubMed DOI:10.1016/j.yexcr.2007.07.020
Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing.. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23 — 29. PubMed DOI:10.1038/nsmb1182

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2847 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q8WYQ5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2847 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8WYQ5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.