DNMT3B

DNMT3B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QKJ, 3FLG, 5CIU
Ідентифікатори
Символи	DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta, FSHD4
Зовнішні ІД	OMIM: 602900 MGI: 1261819 HomoloGene: 56000 GeneCards: DNMT3B
Пов'язані генетичні захворювання
	inflammatory bowel diseases[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyltransferase activity; • transferase activity; • DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • DNA-methyltransferase activity; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to ionizing radiation; • C-5 methylation of cytosine; • response to estradiol; • response to hypoxia; • cellular response to hyperoxia; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to activity; • cellular response to dexamethasone stimulus; • response to vitamin A; • Метилювання ДНК; • Метилювання; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • positive regulation of histone H3-K4 methylation; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of histone H3-K9 methylation; • Регуляція експресії генів; • response to caffeine; • response to toxic substance; • response to cocaine;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1789
	13436
	ENSG00000088305
	ENSMUSG00000027478
	Q9UBC3
	O88509
NM_001207055; NM_001207056; NM_006892; NM_175848; NM_175849;
	NM_175850
NM_001003960; NM_001003961; NM_001003963; NM_001122997; NM_001271744;
	NM_001271745; NM_001271746; NM_001271747; NM_010068
NP_001193984; NP_001193985; NP_008823; NP_787044; NP_787045;
	NP_787046
NP_001003960; NP_001003961; NP_001003963; NP_001116469; NP_001258673;
	NP_001258674; NP_001258675; NP_001258676; NP_034198
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DNMT3B (англ. DNA methyltransferase 3 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 95 751[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGDTRHLNG	EEDAGGREDS	ILVNGACSDQ	SSDSPPILEA	IRTPEIRGRR
SSSRLSKREV	SSLLSYTQDL	TGDGDGEDGD	GSDTPVMPKL	FRETRTRSES
PAVRTRNNNS	VSSRERHRPS	PRSTRGRQGR	NHVDESPVEF	PATRSLRRRA
TASAGTPWPS	PPSSYLTIDL	TDDTEDTHGT	PQSSSTPYAR	LAQDSQQGGM
ESPQVEADSG	DGDSSEYQDG	KEFGIGDLVW	GKIKGFSWWP	AMVVSWKATS
KRQAMSGMRW	VQWFGDGKFS	EVSADKLVAL	GLFSQHFNLA	TFNKLVSYRK
AMYHALEKAR	VRAGKTFPSS	PGDSLEDQLK	PMLEWAHGGF	KPTGIEGLKP
NNTQPVVNKS	KVRRAGSRKL	ESRKYENKTR	RRTADDSATS	DYCPAPKRLK
TNCYNNGKDR	GDEDQSREQM	ASDVANNKSS	LEDGCLSCGR	KNPVSFHPLF
EGGLCQTCRD	RFLELFYMYD	DDGYQSYCTV	CCEGRELLLC	SNTSCCRCFC
VECLEVLVGT	GTAAEAKLQE	PWSCYMCLPQ	RCHGVLRRRK	DWNVRLQAFF
TSDTGLEYEA	PKLYPAIPAA	RRRPIRVLSL	FDGIATGYLV	LKELGIKVGK
YVASEVCEES	IAVGTVKHEG	NIKYVNDVRN	ITKKNIEEWG	PFDLVIGGSP
CNDLSNVNPA	RKGLYEGTGR	LFFEFYHLLN	YSRPKEGDDR	PFFWMFENVV
AMKVGDKRDI	SRFLECNPVM	IDAIKVSAAH	RARYFWGNLP	GMNRPVIASK
NDKLELQDCL	EYNRIAKLKK	VQTITTKSNS	IKQGKNQLFP	VVMNGKEDVL
WCTELERIFG	FPVHYTDVSN	MGRGARQKLL	GRSWSVPVIR	HLFAPLKDYF
ACE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

Kang E.S., Park C.W., Chung J.H. (2001). Dnmt3b, de novo DNA methyltransferase, interacts with SUMO-1 and Ubc9 through its N-terminal region and is subject to modification by SUMO-1.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289: 862 — 868. PubMed DOI:10.1006/bbrc.2001.6057
Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases.. EMBO J. 21: 4183 — 4195. PubMed DOI:10.1093/emboj/cdf401
Okano M., Bell D.W., Haber D.A., Li E. (1999). DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development.. Cell 99: 247 — 257. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)81656-6

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з DNMT3B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2979 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9UBC3 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DNMT3B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2979 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9UBC3 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.