EFCAB6
EFCAB6 (англ. EF-hand calcium binding domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 501 амінокислот, а молекулярна маса — 172 930[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MCKMAIIPDW | LRSHPHTRKF | THSRPHSSPC | RVYSRNGSPN | KFRSSSTTAV | ||||
| ANPTLSSLDV | KRILFQKITD | RGDELQKAFQ | LLDTGQNLTV | SKSELRRIIT | ||||
| DFLMPLTREQ | FQDVLAQIPL | STSGTVPYLA | FLSRFGGIDL | YINGIKRGGG | ||||
| NEMNCCRTLR | ELEIQVGEKV | FKNIKTVMKA | FELIDVNKTG | LVRPQELRRV | ||||
| LETFCMKLRD | EEYEKFSKHY | NIHKDTAVDY | NVFLKNLSIN | NDLNLRYCMG | ||||
| NQEVSLENQQ | AKNSKKERLL | GSASSEDIWR | NYSLDEIERN | FCLQLSKSYE | ||||
| KVEKALSAGD | PCKGGYVSFN | YLKIVLDTFV | YQIPRRIFIQ | LMKRFGLKAT | ||||
| TKINWKQFLT | SFHEPQGLQV | SSKGPLTKRN | SINSRNESHK | ENIITKLFRH | ||||
| TEDHSASLKK | ALLIINTKPD | GPITREEFRY | ILNCMAVKLS | DSEFKELMQM | ||||
| LDPGDTGVVN | TSMFIDLIEE | NCRMRKTSPC | TDAKTPFLLA | WDSVEEIVHD | ||||
| TITRNLQAFY | NMLRSYDLGD | TGRIGRNNFK | KIMHVFCPFL | TNAHFIKLCS | ||||
| KIQDIGSGRI | LYKKLLACIG | IDGPPTVSPV | LVPKDQLLSE | HLQKDEQQQP | ||||
| DLSERTKLTE | DKTTLTKKMT | TEEVIEKFKK | CIQQQDPAFK | KRFLDFSKEP | ||||
| NGKINVHDFK | KVLEDTGMPM | DDDQYALLTT | KIGFEKEGMS | YLDFAAGFED | ||||
| PPMRGPETTP | PQPPTPSKSY | VNSHFITAEE | CLKLFPRRLK | ESFRDPYSAF | ||||
| FKTDADRDGI | INMHDLHRLL | LHLLLNLKDD | EFERFLGLLG | LRLSVTLNFR | ||||
| EFQNLCEKRP | WRTDEAPQRL | IRPKQKVADS | ELACEQAHQY | LVTKAKNRWS | ||||
| DLSKNFLETD | NEGNGILRRR | DIKNALYGFD | IPLTPREFEK | LWARYDTEGK | ||||
| GHITYQEFLQ | KLGINYSPAV | HRPCAEDYFN | FMGHFTKPQQ | LQEEMKELQQ | ||||
| STEKAVAARD | KLMDRHQDIS | KAFTKTDQSK | TNYISICKMQ | EVLEECGCSL | ||||
| TEGELTHLLN | SWGVSRHDNA | INYLDFLRAV | ENSKSTGAQP | KEKEESMPIN | ||||
| FATLNPQEAV | RKIQEVVESS | QLALSTAFSA | LDKEDTGFVK | ATEFGQVLKD | ||||
| FCYKLTDNQY | HYFLRKLRIH | LTPYINWKYF | LQNFSCFLEE | TADEWAEKMP | ||||
| KGPPPTSPKA | TADRDILARL | HKAVTSHYHA | ITQEFENFDT | MKTNTISREE | ||||
| FRAICNRRVQ | ILTDEQFDRL | WNEMPVNAKG | RLKYPDFLSR | FSSETAATPM | ||||
| ATGDSAVAQR | GSSVPDVSEG | TRSALSLPTQ | ELRPGSKSQS | HPCTPASTTV | ||||
| IPGTPPLQNC | DPIESRLRKR | IQGCWRQLLK | ECKEKDVARQ | GDINASDFLA | ||||
| LVEKFNLDIS | KEECQQLIIK | YDLKSNGKFA | YCDFIQSCVL | LLKAKESSLM | ||||
| HRMKIQNAHK | MKEAGAETPS | FYSALLRIQP | KIVHCWRPMR | RTFKSYDEAG | ||||
| TGLLSVADFR | TVLRQYSINL | SEEEFFHILE | YYDKTLSSKI | SYNDFLRAFL | ||||
| Q |
| EFCAB6 | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand calcium binding domain 6 | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | MGI: 1924877 HomoloGene: 11259 GeneCards: EFCAB6 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
 | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 22: 43.53 – 43.81 Mb | Хр. 15: 83.87 – 84.07 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping.. DNA Res. 8: 1 — 9. PubMed DOI:10.1093/dnares/8.1.1
- Niki T., Takahashi-Niki K., Taira T., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (2003). DJBP: a novel DJ-1-binding protein, negatively regulates the androgen receptor by recruiting histone deacetylase complex, and DJ-1 antagonizes this inhibition by abrogation of this complex.. Mol. Cancer Res. 1: 247 — 261. PubMed
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24204 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, Q5THR3 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.