EFCAB6

EFCAB6 (англ. EF-hand calcium binding domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 501 амінокислот, а молекулярна маса — 172 930[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MCKMAIIPDWLRSHPHTRKFTHSRPHSSPCRVYSRNGSPNKFRSSSTTAV
ANPTLSSLDVKRILFQKITDRGDELQKAFQLLDTGQNLTVSKSELRRIIT
DFLMPLTREQFQDVLAQIPLSTSGTVPYLAFLSRFGGIDLYINGIKRGGG
NEMNCCRTLRELEIQVGEKVFKNIKTVMKAFELIDVNKTGLVRPQELRRV
LETFCMKLRDEEYEKFSKHYNIHKDTAVDYNVFLKNLSINNDLNLRYCMG
NQEVSLENQQAKNSKKERLLGSASSEDIWRNYSLDEIERNFCLQLSKSYE
KVEKALSAGDPCKGGYVSFNYLKIVLDTFVYQIPRRIFIQLMKRFGLKAT
TKINWKQFLTSFHEPQGLQVSSKGPLTKRNSINSRNESHKENIITKLFRH
TEDHSASLKKALLIINTKPDGPITREEFRYILNCMAVKLSDSEFKELMQM
LDPGDTGVVNTSMFIDLIEENCRMRKTSPCTDAKTPFLLAWDSVEEIVHD
TITRNLQAFYNMLRSYDLGDTGRIGRNNFKKIMHVFCPFLTNAHFIKLCS
KIQDIGSGRILYKKLLACIGIDGPPTVSPVLVPKDQLLSEHLQKDEQQQP
DLSERTKLTEDKTTLTKKMTTEEVIEKFKKCIQQQDPAFKKRFLDFSKEP
NGKINVHDFKKVLEDTGMPMDDDQYALLTTKIGFEKEGMSYLDFAAGFED
PPMRGPETTPPQPPTPSKSYVNSHFITAEECLKLFPRRLKESFRDPYSAF
FKTDADRDGIINMHDLHRLLLHLLLNLKDDEFERFLGLLGLRLSVTLNFR
EFQNLCEKRPWRTDEAPQRLIRPKQKVADSELACEQAHQYLVTKAKNRWS
DLSKNFLETDNEGNGILRRRDIKNALYGFDIPLTPREFEKLWARYDTEGK
GHITYQEFLQKLGINYSPAVHRPCAEDYFNFMGHFTKPQQLQEEMKELQQ
STEKAVAARDKLMDRHQDISKAFTKTDQSKTNYISICKMQEVLEECGCSL
TEGELTHLLNSWGVSRHDNAINYLDFLRAVENSKSTGAQPKEKEESMPIN
FATLNPQEAVRKIQEVVESSQLALSTAFSALDKEDTGFVKATEFGQVLKD
FCYKLTDNQYHYFLRKLRIHLTPYINWKYFLQNFSCFLEETADEWAEKMP
KGPPPTSPKATADRDILARLHKAVTSHYHAITQEFENFDTMKTNTISREE
FRAICNRRVQILTDEQFDRLWNEMPVNAKGRLKYPDFLSRFSSETAATPM
ATGDSAVAQRGSSVPDVSEGTRSALSLPTQELRPGSKSQSHPCTPASTTV
IPGTPPLQNCDPIESRLRKRIQGCWRQLLKECKEKDVARQGDINASDFLA
LVEKFNLDISKEECQQLIIKYDLKSNGKFAYCDFIQSCVLLLKAKESSLM
HRMKIQNAHKMKEAGAETPSFYSALLRIQPKIVHCWRPMRRTFKSYDEAG
TGLLSVADFRTVLRQYSINLSEEEFFHILEYYDKTLSSKISYNDFLRAFL
Q
EFCAB6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand calcium binding domain 6
Зовнішні ІД MGI: 1924877 HomoloGene: 11259 GeneCards: EFCAB6
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
64800
77627
Ensembl
ENSG00000186976
ENSMUSG00000022441
UniProt
Q5THR3
Q6P1E8
RefSeq (мРНК)
NM_022785
NM_198856
NM_001161628
NM_001161629
NM_029946
RefSeq (білок)
NP_073622
NP_942153
NP_001155100
NP_001155101
NP_084222
Локус (UCSC) Хр. 22: 43.53 – 43.81 Mb Хр. 15: 83.87 – 84.07 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping.. DNA Res. 8: 1 — 9. PubMed DOI:10.1093/dnares/8.1.1
  • Niki T., Takahashi-Niki K., Taira T., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (2003). DJBP: a novel DJ-1-binding protein, negatively regulates the androgen receptor by recruiting histone deacetylase complex, and DJ-1 antagonizes this inhibition by abrogation of this complex.. Mol. Cancer Res. 1: 247 — 261. PubMed

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24204 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q5THR3 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.