EOMES

EOMES
Ідентифікатори
Символи	EOMES, TBR2, Eomesodermin
Зовнішні ІД	OMIM: 604615 MGI: 1201683 HomoloGene: 3971 GeneCards: EOMES
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, лімфогранульоматоз[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • chromatin binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• stem cell population maintenance; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of neurogenesis; • Гаструляція; • trophectodermal cell differentiation; • skeletal muscle cell differentiation; • adaptive immune response; • multicellular organism development; • Диференціація клітин; • blastocyst development; • regulation of transcription, DNA-templated; • cerebral cortex neuron differentiation; • regulation of neuron differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation involved in immune response; • transcription, DNA-templated; • olfactory bulb development; • endodermal cell fate specification; • cerebral cortex regionalization; • cardioblast differentiation; • immune system process; • positive regulation of cell differentiation; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • brain development; • Регуляція експресії генів; • mesoderm formation; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • mesodermal to mesenchymal transition involved in gastrulation; • endoderm formation; • cell differentiation involved in embryonic placenta development; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • neurogenesis; • neuron differentiation; • endoderm development; • anatomical structure morphogenesis; • mesendoderm development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8320
	13813
	ENSG00000163508
	ENSMUSG00000032446
	O95936
	O54839
	NM_001278182; NM_001278183; NM_005442
	NM_001164789; NM_010136
	NP_001265111; NP_001265112; NP_005433
	NP_001158261; NP_034266
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EOMES (англ. Eomesodermin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 72 732[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQLGEQLLVS	SVNLPGAHFY	PLESARGGSG	GSAGHLPSAA	PSPQKLDLDK
ASKKFSGSLS	CEAVSGEPAA	ASAGAPAAML	SDTDAGDAFA	SAAAVAKPGP
PDGRKGSPCG	EEELPSAAAA	AAAAAAAAAA	TARYSMDSLS	SERYYLQSPG
PQGSELAAPC	SLFPYQAAAG	APHGPVYPAP	NGARYPYGSM	LPPGGFPAAV
CPPGRAQFGP	GAGAGSGAGG	SSGGGGGPGT	YQYSQGAPLY	GPYPGAAAAG
SCGGLGGLGV	PGSGFRAHVY	LCNRPLWLKF	HRHQTEMIIT	KQGRRMFPFL
SFNINGLNPT	AHYNVFVEVV	LADPNHWRFQ	GGKWVTCGKA	DNNMQGNKMY
VHPESPNTGS	HWMRQEISFG	KLKLTNNKGA	NNNNTQMIVL	QSLHKYQPRL
HIVEVTEDGV	EDLNEPSKTQ	TFTFSETQFI	AVTAYQNTDI	TQLKIDHNPF
AKGFRDNYDS	SHQIVPGGRY	GVQSFFPEPF	VNTLPQARYY	NGERTVPQTN
GLLSPQQSEE	VANPPQRWLV	TPVQQPGTNK	LDISSYESEY	TSSTLLPYGI
KSLPLQTSHA	LGYYPDPTFP	AMAGWGGRGS	YQRKMAAGLP	WTSRTSPTVF
SEDQLSKEKV	KEEIGSSWIE	TPPSIKSLDS	NDSGVYTSAC	KRRRLSPSNS
SNENSPSIKC	EDINAEEYSK	DTSKGMGGYY	AFYTTP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, гаструляція, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kimura N., Nakashima K., Ueno M., Taga T. (1999). A novel mammalian T-box-containing gene, Tbr2, expressed in mouse developing brain.. Brain Res. Dev. Brain Res. 115: 183 — 193. PubMed DOI:10.1016/S0165-3806(99)00064-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з EOMES переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3372 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O95936 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з EOMES переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3372 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O95936 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.