ERCC6
ERCC6 (англ. DNA excision repair protein ERCC-6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 493 амінокислот, а молекулярна маса — 168 416[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPNEGIPHSS | QTQEQDCLQS | QPVSNNEEMA | IKQESGGDGE | VEEYLSFRSV | ||||
GDGLSTSAVG | CASAAPRRGP | ALLHIDRHQI | QAVEPSAQAL | ELQGLGVDVY | ||||
DQDVLEQGVL | QQVDNAIHEA | SRASQLVDVE | KEYRSVLDDL | TSCTTSLRQI | ||||
NKIIEQLSPQ | AATSRDINRK | LDSVKRQKYN | KEQQLKKITA | KQKHLQAILG | ||||
GAEVKIELDH | ASLEEDAEPG | PSSLGSMLMP | VQETAWEELI | RTGQMTPFGT | ||||
QIPQKQEKKP | RKIMLNEASG | FEKYLADQAK | LSFERKKQGC | NKRAARKAPA | ||||
PVTPPAPVQN | KNKPNKKARV | LSKKEERLKK | HIKKLQKRAL | QFQGKVGLPK | ||||
ARRPWESDMR | PEAEGDSEGE | ESEYFPTEEE | EEEEDDEVEG | AEADLSGDGT | ||||
DYELKPLPKG | GKRQKKVPVQ | EIDDDFFPSS | GEEAEAASVG | EGGGGGRKVG | ||||
RYRDDGDEDY | YKQRLRRWNK | LRLQDKEKRL | KLEDDSEESD | AEFDEGFKVP | ||||
GFLFKKLFKY | QQTGVRWLWE | LHCQQAGGIL | GDEMGLGKTI | QIIAFLAGLS | ||||
YSKIRTRGSN | YRFEGLGPTV | IVCPTTVMHQ | WVKEFHTWWP | PFRVAILHET | ||||
GSYTHKKEKL | IRDVAHCHGI | LITSYSYIRL | MQDDISRYDW | HYVILDEGHK | ||||
IRNPNAAVTL | ACKQFRTPHR | IILSGSPMQN | NLRELWSLFD | FIFPGKLGTL | ||||
PVFMEQFSVP | ITMGGYSNAS | PVQVKTAYKC | ACVLRDTINP | YLLRRMKSDV | ||||
KMSLSLPDKN | EQVLFCRLTD | EQHKVYQNFV | DSKEVYRILN | GEMQIFSGLI | ||||
ALRKICNHPD | LFSGGPKNLK | GLPDDELEED | QFGYWKRSGK | MIVVESLLKI | ||||
WHKQGQRVLL | FSQSRQMLDI | LEVFLRAQKY | TYLKMDGTTT | IASRQPLITR | ||||
YNEDTSIFVF | LLTTRVGGLG | VNLTGANRVV | IYDPDWNPST | DTQARERAWR | ||||
IGQKKQVTVY | RLLTAGTIEE | KIYHRQIFKQ | FLTNRVLKDP | KQRRFFKSND | ||||
LYELFTLTSP | DASQSTETSA | IFAGTGSDVQ | TPKCHLKRRI | QPAFGADHDV | ||||
PKRKKFPASN | ISVNDATSSE | EKSEAKGAEV | NAVTSNRSDP | LKDDPHMSSN | ||||
VTSNDRLGEE | TNAVSGPEEL | SVISGNGECS | NSSGTGKTSM | PSGDESIDEK | ||||
LGLSYKRERP | SQAQTEAFWE | NKQMENNFYK | HKSKTKHHSV | AEEETLEKHL | ||||
RPKQKPKNSK | HCRDAKFEGT | RIPHLVKKRR | YQKQDSENKS | EAKEQSNDDY | ||||
VLEKLFKKSV | GVHSVMKHDA | IMDGASPDYV | LVEAEANRVA | QDALKALRLS | ||||
RQRCLGAVSG | VPTWTGHRGI | SGAPAGKKSR | FGKKRNSNFS | VQHPSSTSPT | ||||
EKCQDGIMKK | EGKDNVPEHF | SGRAEDADSS | SGPLASSSLL | AKMRARNHLI | ||||
LPERLESESG | HLQEASALLP | TTEHDDLLVE | MRNFIAFQAH | TDGQASTREI | ||||
LQEFESKLSA | SQSCVFRELL | RNLCTFHRTS | GGEGIWKLKP | EYC |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Troelstra C., Hesen V., Bootsma D., Hoeijmakers J.H.J. (1993). Structure and expression of the excision repair gene ERCC6, involved in the human disorder Cockayne's syndrome group B.. Nucleic Acids Res. 21: 419 — 426. PubMed DOI:10.1093/nar/21.3.419
- Cleaver J.E., Thompson L.H., Richardson A.S., States J.C. (1999). A summary of mutations in the UV-sensitive disorders: xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome, and trichothiodystrophy.. Hum. Mutat. 14: 9 — 22. PubMed DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)14:1<9::AID-HUMU2>3.0.CO;2-6
- Colella S., Nardo T., Botta E., Lehmann A.R., Stefanini M. (2000). Identical mutations in the CSB gene associated with either Cockayne syndrome or the DeSanctis-Cacchione variant of xeroderma pigmentosum.. Hum. Mol. Genet. 9: 1171 — 1175. PubMed DOI:10.1093/hmg/9.8.1171
- Christiansen M., Thorslund T., Jochimsen B., Bohr V.A., Stevnsner T. (2005). The Cockayne syndrome group B protein is a functional dimer.. FEBS J. 272: 4306 — 4314. PubMed DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04844.x
- Beerens N., Hoeijmakers J.H., Kanaar R., Vermeulen W., Wyman C. (2005). The CSB protein actively wraps DNA.. J. Biol. Chem. 280: 4722 — 4729. PubMed DOI:10.1074/jbc.M409147200
- Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription.. J. Biol. Chem. 281: 16264 — 16271. PubMed DOI:10.1074/jbc.M600233200
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3438 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
- UniProt, Q03468 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.