FANCM

FANCM (англ. Fanconi anemia complementation group M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 048 амінокислот, а молекулярна маса — 232 191[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSGRQRTLFQTWGSSISRSSGTPGCSSGTERPQSPGSSKAPLPAAAEAQL
ESDDDVLLVAAYEAERQLCLENGGFCTSAGALWIYPTNCPVRDYQLHISR
AALFCNTLVCLPTGLGKTFIAAVVMYNFYRWFPSGKVVFMAPTKPLVTQQ
IEACYQVMGIPQSHMAEMTGSTQASTRKEIWCSKRVLFLTPQVMVNDLSR
GACPAAEIKCLVIDEAHKALGNYAYCQVVRELVKYTNHFRILALSATPGS
DIKAVQQVITNLLIGQIELRSEDSPDILTYSHERKVEKLIVPLGEELAAI
QKTYIQILESFARSLIQRNVLMRRDIPNLTKYQIILARDQFRKNPSPNIV
GIQQGIIEGEFAICISLYHGYELLQQMGMRSLYFFLCGIMDGTKGMTRSK
NELGRNEDFMKLYNHLECMFARTRSTSANGISAIQQGDKNKKFVYSHPKL
KKLEEVVIEHFKSWNAENTTEKKRDETRVMIFSSFRDSVQEIAEMLSQHQ
PIIRVMTFVGHASGKSTKGFTQKEQLEVVKQFRDGGYNTLVSTCVGEEGL
DIGEVDLIICFDSQKSPIRLVQRMGRTGRKRQGRIVIILSEGREERIYNQ
SQSNKRSIYKAISSNRQVLHFYQRSPRMVPDGINPKLHKMFITHGVYEPE
KPSRNLQRKSSIFSYRDGMRQSSLKKDWFLSEEEFKLWNRLYRLRDSDEI
KEITLPQVQFSSLQNEENKPAQESTTGIHQLSLSEWRLWQDHPLPTHQVD
HSDRCRHFIGLMQMIEGMRHEEGECSYELEVESYLQMEDVTSTFIAPRNE
SNNLASDTFITHKKSSFIKNINQGSSSSVIESDEECAEIVKQTHIKPTKI
VSLKKKVSKEIKKDQLKKENNHGIIDSVDNDRNSTVENIFQEDLPNDKRT
SDTDEIAATCTINENVIKEPCVLLTECQFTNKSTSSLAGNVLDSGYNSFN
DEKSVSSNLFLPFEEELYIVRTDDQFYNCHSLTKEVLANVERFLSYSPPP
LSGLSDLEYEIAKGTALENLLFLPCAEHLRSDKCTCLLSHSAVNSQQNLE
LNSLKCINYPSEKSCLYDIPNDNISDEPSLCDCDVHKHNQNENLVPNNRV
QIHRSPAQNLVGENNHDVDNSDLPVLSTDQDESLLLFEDVNTEFDDVSLS
PLNSKSESLPVSDKTAISETPLVSQFLISDELLLDNNSELQDQITRDANS
FKSRDQRGVQEEKVKNHEDIFDCSRDLFSVTFDLGFCSPDSDDEILEHTS
DSNRPLDDLYGRYLEIKEISDANYVSNQALIPRDHSKNFTSGTVIIPSNE
DMQNPNYVHLPLSAAKNEELLSPGYSQFSLPVQKKVMSTPLSKSNTLNSF
SKIRKEILKTPDSSKEKVNLQRFKEALNSTFDYSEFSLEKSKSSGPMYLH
KSCHSVEDGQLLTSNESEDDEIFRRKVKRAKGNVLNSPEDQKNSEVDSPL
HAVKKRRFPINRSELSSSDESENFPKPCSQLEDFKVCNGNARRGIKVPKR
QSHLKHVARKFLDDEAELSEEDAEYVSSDENDESENEQDSSLLDFLNDET
QLSQAINDSEMRAIYMKSLRSPMMNNKYKMIHKTHKNINIFSQIPEQDET
YLEDSFCVDEEESCKGQSSEEEVCVDFNLITDDCFANSKKYKTRRAVMLK
EMMEQNCAHSKKKLSRIILPDDSSEEENNVNDKRESNIAVNPSTVKKNKQ
QDHCLNSVPSGSSAQSKVRSTPRVNPLAKQSKQTSLNLKDTISEVSDFKP
QNHNEVQSTTPPFTTVDSQKDCRKFPVPQKDGSALEDSSTSGASCSKSRP
HLAGTHTSLRLPQEGKGTCILVGGHEITSGLEVISSLRAIHGLQVEVCPL
NGCDYIVSNRMVVERRSQSEMLNSVNKNKFIEQIQHLQSMFERICVIVEK
DREKTGDTSRMFRRTKSYDSLLTTLIGAGIRILFSSCQEETADLLKELSL
VEQRKNVGIHVPTVVNSNKSEALQFYLSIPNISYITALNMCHQFSSVKRM
ANSSLQEISMYAQVTHQKAEEIYRYIHYVFDIQMLPNDLNQDRLKSDI
FANCM
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи FANCM, FAAP250, KIAA1596, Fanconi anemia complementation group M, FA complementation group M, POF15, SPGF28
Зовнішні ІД OMIM: 609644 MGI: 2442306 HomoloGene: 35378 GeneCards: FANCM
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
57697
104806
Ensembl
ENSG00000187790
ENSMUSG00000055884
UniProt
Q8IYD8
Q8BGE5
RefSeq (мРНК)
NM_001308133
NM_001308134
NM_020937
NM_178912
NM_001364447
RefSeq (білок)
NP_001295062
NP_001295063
NP_065988
NP_849243
NP_001351376
Локус (UCSC) Хр. 14: 45.14 – 45.2 Mb Хр. 12: 65.08 – 65.13 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 273 — 281. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.4.271

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23168 (англ.). Процитовано 20 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8IYD8 (англ.). Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.