GABBR1

GABBR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4MQE, 4MQF, 4MR7, 4MR9, 4MRM, 4MS1, 4MS3, 4MS4, 4PAS
Ідентифікатори
Символи	GABBR1, GABABR1, GABBR1-3, GB1, GPRC3A, dJ271M21.1.1, dJ271M21.1.2, gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603540 MGI: 1860139 HomoloGene: 1132 GeneCards: GABBR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • G protein-coupled GABA receptor activity; • G protein-coupled neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • G protein-coupled receptor dimeric complex; • postsynaptic membrane; • cell projection; • мембрана; • клітинна мембрана; • Синапс; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • Міжклітинні контакти; • Дендрит (нейробіологія); • G protein-coupled receptor heterodimeric complex; • presynaptic membrane; • presynapse; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • GABA-ergic synapse;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway; • adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of adenylate cyclase activity; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • regulation of postsynaptic membrane potential; • neuron-glial cell signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2550
	54393
ENSG00000237112; ENSG00000206511; ENSG00000206466; ENSG00000232632; ENSG00000232569;
	ENSG00000237051; ENSG00000204681
	ENSMUSG00000024462
	Q9UBS5
	Q9WV18
	NM_001470; NM_021903; NM_021904; NM_021905; NM_001319053
	NM_019439
	NP_001305982; NP_001461; NP_068703; NP_068704
	NP_062312
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABBR1 (англ. Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 961 амінокислот, а молекулярна маса — 108 320[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLLLLLAPL	FLRPPGAGGA	QTPNATSEGC	QIIHPPWEGG	IRYRGLTRDQ
VKAINFLPVD	YEIEYVCRGE	REVVGPKVRK	CLANGSWTDM	DTPSRCVRIC
SKSYLTLENG	KVFLTGGDLP	ALDGARVDFR	CDPDFHLVGS	SRSICSQGQW
STPKPHCQVN	RTPHSERRAV	YIGALFPMSG	GWPGGQACQP	AVEMALEDVN
SRRDILPDYE	LKLIHHDSKC	DPGQATKYLY	ELLYNDPIKI	ILMPGCSSVS
TLVAEAARMW	NLIVLSYGSS	SPALSNRQRF	PTFFRTHPSA	TLHNPTRVKL
FEKWGWKKIA	TIQQTTEVFT	STLDDLEERV	KEAGIEITFR	QSFFSDPAVP
VKNLKRQDAR	IIVGLFYETE	ARKVFCEVYK	ERLFGKKYVW	FLIGWYADNW
FKIYDPSINC	TVDEMTEAVE	GHITTEIVML	NPANTRSISN	MTSQEFVEKL
TKRLKRHPEE	TGGFQEAPLA	YDAIWALALA	LNKTSGGGGR	SGVRLEDFNY
NNQTITDQIY	RAMNSSSFEG	VSGHVVFDAS	GSRMAWTLIE	QLQGGSYKKI
GYYDSTKDDL	SWSKTDKWIG	GSPPADQTLV	IKTFRFLSQK	LFISVSVLSS
LGIVLAVVCL	SFNIYNSHVR	YIQNSQPNLN	NLTAVGCSLA	LAAVFPLGLD
GYHIGRNQFP	FVCQARLWLL	GLGFSLGYGS	MFTKIWWVHT	VFTKKEEKKE
WRKTLEPWKL	YATVGLLVGM	DVLTLAIWQI	VDPLHRTIET	FAKEEPKEDI
DVSILPQLEH	CSSRKMNTWL	GIFYGYKGLL	LLLGIFLAYE	TKSVSTEKIN
DHRAVGMAIY	NVAVLCLITA	PVTMILSSQQ	DAAFAFASLA	IVFSSYITLV
VLFVPKMRRL	ITRGEWQSEA	QDTMKTGSST	NNNEEEKSRL	LEKENRELEK
IIAEKEERVS	ELRHQLQSRQ	QLRSRRHPPT	PPEPSGGLPR	GPPEPPDRLS
CDGSRVHLLY	K

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах. Також секретований назовні.

Література

Makoff A. (1999). Molecular cloning of human GABABR1 and its tissue distribution.. Brain Res. Mol. Brain Res. 64: 137 — 140. PubMed DOI:10.1016/S0169-328X(98)00316-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Nomura R., Suzuki Y., Kakizuka A., Jingami H. (2008). Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma-aminobutyric acid receptor.. J. Biol. Chem. 283: 4665 — 4673. PubMed DOI:10.1074/jbc.M705202200
Geng Y., Bush M., Mosyak L., Wang F., Fan Q.R. (2013). Structural mechanism of ligand activation in human GABA(B) receptor.. Nature 504: 254 — 259. PubMed DOI:10.1038/nature12725

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4070 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, Q9UBS5 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4070 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UBS5 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.