GABBR2

GABBR2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4F11, 4F12, 4MQE, 4MQF, 4MR7, 4MR8, 4MR9, 4MRM, 4MS1, 4MS3, 4MS4, 4PAS
Ідентифікатори
Символи	GABBR2, GABABR2, GPR51, GPRC3B, HG20, HRIHFB2099, gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, EIEE59, NDPLHS, DEE59
Зовнішні ІД	OMIM: 607340 MGI: 2386030 HomoloGene: 55902 GeneCards: GABBR2
Пов'язані генетичні захворювання
	Посттравматичний стресовий розлад, early infantile epileptic encephalopathy 59[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • G protein-coupled receptor activity; • G protein-coupled GABA receptor activity; • signal transducer activity; • protein heterodimerization activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • neuron projection; • Міжклітинні контакти; • G protein-coupled receptor heterodimeric complex; • клітинна мембрана; • postsynaptic membrane; • Синапс; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • GABA receptor complex;
Біологічний процес	• gamma-aminobutyric acid signaling pathway; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • negative regulation of adenylate cyclase activity; • Сигнальна трансдукція; • chemical synaptic transmission; • neuron-glial cell signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9568
	242425
	ENSG00000136928
	ENSMUSG00000039809
	O75899
	Q80T41
	NM_005458
	NM_001081141
	NP_005449
	NP_001074610
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABBR2 (англ. Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 105 821[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASPRSSGQP	GPPPPPPPPP	ARLLLLLLLP	LLLPLAPGAW	GWARGAPRPP
PSSPPLSIMG	LMPLTKEVAK	GSIGRGVLPA	VELAIEQIRN	ESLLRPYFLD
LRLYDTECDN	AKGLKAFYDA	IKYGPNHLMV	FGGVCPSVTS	IIAESLQGWN
LVQLSFAATT	PVLADKKKYP	YFFRTVPSDN	AVNPAILKLL	KHYQWKRVGT
LTQDVQRFSE	VRNDLTGVLY	GEDIEISDTE	SFSNDPCTSV	KKLKGNDVRI
ILGQFDQNMA	AKVFCCAYEE	NMYGSKYQWI	IPGWYEPSWW	EQVHTEANSS
RCLRKNLLAA	MEGYIGVDFE	PLSSKQIKTI	SGKTPQQYER	EYNNKRSGVG
PSKFHGYAYD	GIWVIAKTLQ	RAMETLHASS	RHQRIQDFNY	TDHTLGRIIL
NAMNETNFFG	VTGQVVFRNG	ERMGTIKFTQ	FQDSREVKVG	EYNAVADTLE
IINDTIRFQG	SEPPKDKTII	LEQLRKISLP	LYSILSALTI	LGMIMASAFL
FFNIKNRNQK	LIKMSSPYMN	NLIILGGMLS	YASIFLFGLD	GSFVSEKTFE
TLCTVRTWIL	TVGYTTAFGA	MFAKTWRVHA	IFKNVKMKKK	IIKDQKLLVI
VGGMLLIDLC	ILICWQAVDP	LRRTVEKYSM	EPDPAGRDIS	IRPLLEHCEN
THMTIWLGIV	YAYKGLLMLF	GCFLAWETRN	VSIPALNDSK	YIGMSVYNVG
IMCIIGAAVS	FLTRDQPNVQ	FCIVALVIIF	CSTITLCLVF	VPKLITLRTN
PDAATQNRRF	QFTQNQKKED	SKTSTSVTSV	NQASTSRLEG	LQSENHRLRM
KITELDKDLE	EVTMQLQDTP	EKTTYIKQNH	YQELNDILNL	GNFTESTDGG
KAILKNHLDQ	NPQLQWNTTE	PSRTCKDPIE	DINSPEHIQR	RLSLQLPILH
HAYLPSIGGV	DASCVSPCVS	PTASPRHRHV	PPSFRVMVSG	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Martin S.C., Russek S.J., Farb D.H. (1999). Molecular identification of the human GABABR2: cell surface expression and coupling to adenylyl cyclase in the absence of GABABR1.. Mol. Cell. Neurosci. 13: 180 — 191. PubMed DOI:10.1006/mcne.1999.0741
Clark J.A., Mezey E., Lam A.S., Bonner T.I. (2000). Distribution of the GABA(B) receptor subunit gb2 in rat CNS.. Brain Res. 860: 41 — 52. PubMed DOI:10.1016/S0006-8993(00)01958-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Nomura R., Suzuki Y., Kakizuka A., Jingami H. (2008). Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma-aminobutyric acid receptor.. J. Biol. Chem. 283: 4665 — 4673. PubMed DOI:10.1074/jbc.M705202200
Geng Y., Bush M., Mosyak L., Wang F., Fan Q.R. (2013). Structural mechanism of ligand activation in human GABA(B) receptor.. Nature 504: 254 — 259. PubMed DOI:10.1038/nature12725

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з GABBR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4507 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, O75899 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GABBR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4507 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O75899 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.