GABPB1

GABPB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AWC
Ідентифікатори
Символи	GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, GA binding protein transcription factor beta subunit 1, GA binding protein transcription factor subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600610 MGI: 95611 HomoloGene: 7723 GeneCards: GABPB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein heterodimerization activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • mitochondrion organization; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2553
	14391
	ENSG00000104064
	ENSMUSG00000027361
	Q06547
	Q00420
NM_002041; NM_005254; NM_016654; NM_016655; NM_181427;
	NM_001320910; NM_001320915
NM_001271467; NM_001271468; NM_001271469; NM_001271470; NM_001271492;
	NM_010249; NM_207669; NM_001355108; NM_001355109
NP_001307839; NP_001307844; NP_002032; NP_005245; NP_057738;
	NP_057739; NP_852092; NP_057738.1
NP_001258396; NP_001258397; NP_001258398; NP_001258399; NP_001258421;
	NP_034379; NP_997552; NP_001342037; NP_001342038
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABPB1 (англ. GA binding protein transcription factor beta subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 42 483[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLVDLGKKL	LEAARAGQDD	EVRILMANGA	PFTTDWLGTS	PLHLAAQYGH
YSTTEVLLRA	GVSRDARTKV	DRTPLHMAAS	EGHASIVEVL	LKHGADVNAK
DMLKMTALHW	ATEHNHQEVV	ELLIKYGADV	HTQSKFCKTA	FDISIDNGNE
DLAEILQIAM	QNQINTNPES	PDTVTIHAAT	PQFIIGPGGV	VNLTGLVSSE
NSSKATDETG	VSAVQFGNSS	TSVLATLAAL	AEASAPLSNS	SETPVVATEE
VVTAESVDGA	IQQVVSSGGQ	QVITIVTDGI	QLGNLHSIPT	SGIGQPIIVT
MPDGQQVLTV	PATDIAEETV	ISEEPPAKRQ	CIEIIENRVE	SAEIEEREAL
QKQLDEANRE	AQKYRQQLLK	KEQEAEAYRQ	KLEAMTRLQT	NKEAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain.. Mol. Cell. Biol. 15: 102 — 111. PubMed DOI:10.1128/MCB.15.1.102
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Virbasius J.V., Virbasius C.A., Scarpulla R.C. (1993). Identity of GABP with NRF-2, a multisubunit activator of cytochrome oxidase expression, reveals a cellular role for an ETS domain activator of viral promoters.. Genes Dev. 7: 380 — 392. PubMed DOI:10.1101/gad.7.3.380
Gugneja S., Virbasius C.M., Scarpulla R.C. (1996). Nuclear respiratory factors 1 and 2 utilize similar glutamine-containing clusters of hydrophobic residues to activate transcription.. Mol. Cell. Biol. 16: 5708 — 5716. PubMed DOI:10.1128/MCB.16.10.5708
Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP.. EMBO J. 19: 683 — 690. PubMed DOI:10.1093/emboj/19.4.683

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4074 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q06547 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4074 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q06547 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.