GNA13

GNA13
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SHZ, 1ZCB, 3AB3, 3CX6, 3CX7, 3CX8
Ідентифікатори
Символи	GNA13, G13, G protein subunit alpha 13, HG1N
Зовнішні ІД	OMIM: 604406 MGI: 95768 HomoloGene: 55976 GeneCards: GNA13
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • G-protein beta/gamma-subunit complex binding; • type 1 angiotensin receptor binding; • GTP binding; • D5 dopamine receptor binding; • signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • guanyl nucleotide binding; • G protein-coupled receptor binding; • guanyl-nucleotide exchange factor activity; • GO:0006184 GTPase activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • focal adhesion; • Меланосома; • brush border membrane; • heterotrimeric G-protein complex; • Екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • movement of cell or subcellular component; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • regulation of cell migration; • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • small GTPase mediated signal transduction; • in utero embryonic development; • platelet activation; • activation of phospholipase D activity; • Rho protein signal transduction; • Ангіогенез; • regulation of cell shape; • branching involved in blood vessel morphogenesis; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of apoptotic process; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10672
	14674
	ENSG00000120063
	ENSMUSG00000020611
	Q14344
	P27601
	NM_001282425; NM_006572
	NM_010303; NM_001359034
	NP_001269354; NP_006563
	NP_034433; NP_001345963
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GNA13 (англ. G protein subunit alpha 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 377 амінокислот, а молекулярна маса — 44 050[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADFLPSRSV	LSVCFPGCLL	TSGEAEQQRK	SKEIDKCLSR	EKTYVKRLVK
ILLLGAGESG	KSTFLKQMRI	IHGQDFDQRA	REEFRPTIYS	NVIKGMRVLV
DAREKLHIPW	GDNSNQQHGD	KMMSFDTRAP	MAAQGMVETR	VFLQYLPAIR
ALWADSGIQN	AYDRRREFQL	GESVKYFLDN	LDKLGEPDYI	PSQQDILLAR
RPTKGIHEYD	FEIKNVPFKM	VDVGGQRSER	KRWFECFDSV	TSILFLVSSS
EFDQVLMEDR	LTNRLTESLN	IFETIVNNRV	FSNVSIILFL	NKTDLLEEKV
QIVSIKDYFL	EFEGDPHCLR	DVQKFLVECF	RNKRRDQQQK	PLYHHFTTAI
NTENIRLVFR	DVKDTILHDN	LKQLMLQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Kabouridis P.S., Waters S.T., Escobar S., Stanners J., Tsoukas C.D. (1995). Expression of GTP-binding protein alpha subunits in human thymocytes.. Mol. Cell. Biochem. 144: 45 — 51. PubMed DOI:10.1007/BF00926739
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fukuhara S., Murga C., Zohar M., Igishi T., Gutkind J.S. (1999). A novel PDZ domain containing guanine nucleotide exchange factor links heterotrimeric G proteins to Rho.. J. Biol. Chem. 274: 5868 — 5879. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.9.5868
Fukuhara S., Chikumi H., Gutkind J.S. (2000). Leukemia-associated Rho guanine nucleotide exchange factor (LARG) links heterotrimeric G proteins of the G(12) family to Rho.. FEBS Lett. 485: 183 — 188. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(00)02224-9
Bhattacharyya R., Wedegaertner P.B. (2000). Galpha 13 requires palmitoylation for plasma membrane localization, Rho-dependent signaling, and promotion of p115-RhoGEF membrane binding.. J. Biol. Chem. 275: 14992 — 14999. PubMed DOI:10.1074/jbc.M000415200
Meigs T.E., Fedor-Chaiken M., Kaplan D.D., Brackenbury R., Casey P.J. (2002). Galpha12 and Galpha13 negatively regulate the adhesive functions of cadherin.. J. Biol. Chem. 277: 24594 — 24600. PubMed DOI:10.1074/jbc.M201984200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4381 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q14344 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4381 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q14344 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.