GRIK2

GRIK2 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 908 амінокислот, а молекулярна маса — 102 583[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKIIFPILSNPVFRRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPM
GAEELAFRFAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLS
LGVAAIFGPSHSSSANAVQSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLY
PDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDDSTGLIRLQELIKAPSRYNLRLK
IRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGILKQALAMGMMTE
YYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSMER
LQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRH
KPWRFGTRFMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLE
KIGTWDPASGLNMTESQKGKPANITDSLSNRSLIVTTILEEPYVLFKKSD
KPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNG
MVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNP
GVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPDSD
VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISS
YTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKIS
TYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNC
NLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR
GNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVAVGEFLYKSKKNA
QLEKRSFCSAMVEELRMSLKCQRRLKHKPQAPVIVKTEEVINMHTFNDRR
LPGKETMA
GRIK2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи GRIK2, EAA4, GLR6, GLUK6, GLUR6, GluK2, MRT6, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2, NEDLAS
Зовнішні ІД OMIM: 138244 MGI: 95815 HomoloGene: 40717 GeneCards: GRIK2
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2898
14806
Ensembl
ENSG00000164418
ENSMUSG00000056073
UniProt
Q13002
P39087
RefSeq (мРНК)
NM_001166247
NM_021956
NM_175768
NM_001111268
NM_010349
RefSeq (білок)
NP_001159719
NP_068775
NP_786944
NP_001104738
NP_034479
NP_001345795
Локус (UCSC) Хр. 6: 100.96 – 102.08 Mb Хр. 10: 49.09 – 49.79 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • Paschen W., Blackstone C.D., Huganir R.L., Ross C.A. (1994). Human GluR6 kainate receptor (GRIK2): molecular cloning, expression, polymorphism, and chromosomal assignment.. Genomics 20: 435 — 440. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1198
  • Barbon A., Vallini I., Barlati S. (2001). Genomic organization of the human GRIK2 gene and characterization of multiple splicing variants.. Gene 274: 187 — 197. PubMed DOI:10.1016/S0378-1119(01)00611-4
  • Wilkinson K.A., Konopacki F., Henley J.M. (2012). Modification and movement: Phosphorylation and SUMOylation regulate endocytosis of GluK2-containing kainate receptors.. Commun. Integr. Biol. 5: 223 — 226. PubMed DOI:10.4161/cib.19195
  • Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue.. J. Neurochem. 63: 1596 — 1602. PubMed
  • Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits.. NeuroReport 5: 2625 — 2629. PubMed

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4580 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q13002 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.