HDAC7

HDAC7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3C0Y, 3C0Z, 3C10, 3ZNR, 3ZNS
Ідентифікатори
Символи	HDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, histone deacetylase 7
Зовнішні ІД	OMIM: 606542 MGI: 1891835 HomoloGene: 9124 GeneCards: HDAC7
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння[1]
Реагує на сполуку
	Belinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • protein kinase binding; • 14-3-3 protein binding; • hydrolase activity; • protein kinase C binding; • chromatin binding; • histone deacetylase activity; • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • GO:0001948 protein binding; • SUMO transferase activity;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • цитоплазма; • клітинне ядро; • histone deacetylase complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• transcription, DNA-templated; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; • cell-cell junction assembly; • васкулогенез; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3 deacetylation; • negative regulation of osteoblast differentiation; • negative regulation of interleukin-2 production; • regulation of transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • chromatin organization; • protein sumoylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51564
	56233
	ENSG00000061273
	ENSMUSG00000022475
	Q8WUI4
	Q8C2B3
	NM_001098416; NM_001308090; NM_015401; NM_016596; NM_001368046
NM_001204275; NM_001204276; NM_001204277; NM_001204278; NM_001204279;
	NM_001204280; NM_001204281; NM_019572; NM_001378971
	NP_001091886; NP_001295019; NP_056216; NP_001354975
NP_001191204; NP_001191205; NP_001191206; NP_001191207; NP_001191208;
	NP_001191209; NP_001191210; NP_062518; NP_001365900
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HDAC7 (англ. Histone deacetylase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 952 амінокислот, а молекулярна маса — 102 927[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLRVGQRPP	VEPPPEPTLL	ALQRPQRLHH	HLFLAGLQQQ	RSVEPMRLSM
DTPMPELQVG	PQEQELRQLL	HKDKSKRSAV	ASSVVKQKLA	EVILKKQQAA
LERTVHPNSP	GIPYRTLEPL	ETEGATRSML	SSFLPPVPSL	PSDPPEHFPL
RKTVSEPNLK	LRYKPKKSLE	RRKNPLLRKE	SAPPSLRRRP	AETLGDSSPS
SSSTPASGCS	SPNDSEHGPN	PILGSEALLG	QRLRLQETSV	APFALPTVSL
LPAITLGLPA	PARADSDRRT	HPTLGPRGPI	LGSPHTPLFL	PHGLEPEAGG
TLPSRLQPIL	LLDPSGSHAP	LLTVPGLGPL	PFHFAQSLMT	TERLSGSGLH
WPLSRTRSEP	LPPSATAPPP	PGPMQPRLEQ	LKTHVQVIKR	SAKPSEKPRL
RQIPSAEDLE	TDGGGPGQVV	DDGLEHRELG	HGQPEARGPA	PLQQHPQVLL
WEQQRLAGRL	PRGSTGDTVL	LPLAQGGHRP	LSRAQSSPAA	PASLSAPEPA
SQARVLSSSE	TPARTLPFTT	GLIYDSVMLK	HQCSCGDNSR	HPEHAGRIQS
IWSRLQERGL	RSQCECLRGR	KASLEELQSV	HSERHVLLYG	TNPLSRLKLD
NGKLAGLLAQ	RMFVMLPCGG	VGVDTDTIWN	ELHSSNAARW	AAGSVTDLAF
KVASRELKNG	FAVVRPPGHH	ADHSTAMGFC	FFNSVAIACR	QLQQQSKASK
ILIVDWDVHH	GNGTQQTFYQ	DPSVLYISLH	RHDDGNFFPG	SGAVDEVGAG
SGEGFNVNVA	WAGGLDPPMG	DPEYLAAFRI	VVMPIAREFS	PDLVLVSAGF
DAAEGHPAPL	GGYHVSAKCF	GYMTQQLMNL	AGGAVVLALE	GGHDLTAICD
ASEACVAALL	GNRVDPLSEE	GWKQKPNLNA	IRSLEAVIRV	HSKYWGCMQR
LASCPDSWVP	RVPGADKEEV	EAVTALASLS	VGILAEDRPS	EQLVEEEEPM
NL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lee H.-J., Chun M., Kandror K.V. (2001). Tip60 and HDAC7 interact with the endothelin receptor a and may be involved in downstream signaling.. J. Biol. Chem. 276: 16597 — 16600. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000909200
Bryant H., Farrell P.J. (2002). Signal transduction and transcription factor modification during reactivation of Epstein-Barr virus from latency.. J. Virol. 76: 10290 — 10298. PubMed DOI:10.1128/JVI.76.20.10290-10298.2002
Xiao H., Chung J., Kao H.-Y., Yang Y.-C. (2003). Tip60 is a co-repressor for STAT3.. J. Biol. Chem. 278: 11197 — 11204. PubMed DOI:10.1074/jbc.M210816200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HDAC7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14067 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q8WUI4 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HDAC7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Histone deacetylase 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14067 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q8WUI4 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.