HDAC9

HDAC9 (англ. Histone deacetylase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 111 297[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQEL
LLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKELLAIKQQQELL
EKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEF
LLSKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYK
YTLPGAQDAKDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNV
VTSFKKRMFEVTESSVSSSSPGSGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHA
EQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAVPSQLNASNSLKEK
QKCETQTLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLL
LKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNRTQ
SAPLPQSTLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGS
HLEEAEEELQGDQAMQEDRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEE
PVDSDEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGL
EKHRLVSRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGN
STTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSL
LYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGA
ARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAI
TAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNF
FPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAK
EFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVL
ALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKI
IEIQSMSLKFS
HDAC9
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HDAC9, HD7, HD7b, HD9, HDAC, HDAC7, HDAC7B, HDAC9B, HDAC9FL, HDRP, MITR, histone deacetylase 9
Зовнішні ІД OMIM: 606543 MGI: 1931221 HomoloGene: 128578 GeneCards: HDAC9
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, інсульт, неспецифічний виразковий коліт, цереброваскулярні хвороби[1]
Реагує на сполуку
Belinostat, entinostat, givinostat, panobinostat, quisinostat, romidepsin, trichostatin A, Золінза[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9734
79221
Ensembl
ENSG00000048052
ENSMUSG00000004698
UniProt
Q9UKV0
Q99N13
RefSeq (мРНК)
NM_001271386
NM_024124
RefSeq (білок)
NP_001258315
NP_077038
Локус (UCSC) Хр. 7: 18.09 – 19 Mb Хр. 12: 34.05 – 34.92 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

  • Zhou X., Marks P.A., Rifkind R.A., Richon V.M. (2001). Cloning and characterization of a histone deacetylase, HDAC9.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10572 — 10577. PubMed DOI:10.1073/pnas.191375098
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhou X., Richon V.M., Rifkind R.A., Marks P.A. (2000). Identification of a transcriptional repressor related to the noncatalytic domain of histone deacetylases 4 and 5.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 1056 — 1061. PubMed DOI:10.1073/pnas.97.3.1056

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.