HLA-DPA1

HLA-DPA1
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M
Ідентифікатори
Символи	HLA-DPA1, DP(W3), DP(W4), HLA-DP1A, HLADP, HLASB, PLT1, major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1, DPA1, HLA-DPB1, HLA-DPA
Зовнішні ІД	OMIM: 142880 HomoloGene: 110708 GeneCards: HLA-DPA1
Пов'язані генетичні захворювання
	гепатит B[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • Ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • integral component of plasma membrane; • MHC class II protein complex; • cell surface; • lysosomal membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • positive regulation of interferon-gamma production; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • positive regulation of T cell activation; • Імунна відповідь; • positive regulation of T cell proliferation; • cellular response to interferon-gamma; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3113
	100332267
ENSG00000229685; ENSG00000224103; ENSG00000206291; ENSG00000168384; ENSG00000228163;
	ENSG00000236177; ENSG00000235844; ENSG00000231389
	н/д
	P20036
	н/д
	NM_001242524; NM_001242525; NM_033554
	XM_002660389
	NP_001229453; NP_001229454; NP_291032
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DPA1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 381[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRPEDRMFHI	RAVILRALSL	AFLLSLRGAG	AIKADHVSTY	AAFVQTHRPT
GEFMFEFDED	EMFYVDLDKK	ETVWHLEEFG	QAFSFEAQGG	LANIAILNNN
LNTLIQRSNH	TQATNDPPEV	TVFPKEPVEL	GQPNTLICHI	DKFFPPVLNV
TWLCNGELVT	EGVAESLFLP	RTDYSFHKFH	YLTFVPSAED	FYDCRVEHWG
LDQPLLKHWE	AQEPIQMPET	TETVLCALGL	VLGLVGIIVG	TVLIIKSLRS
GHDPRAQGTL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Lawrance S.K., Das H.K., Pan J., Weissman S.M. (1985). The genomic organisation and nucleotide sequence of the HLA-SB(DP) alpha gene.. Nucleic Acids Res. 13: 7515 — 7528. PubMed DOI:10.1093/nar/13.20.7515
Young J.A., Lindsay J., Bodmer J.G., Trowsdale J. (1988). Epitope recognition by a DP alpha chain-specific monoclonal antibody (DP11.1) is influenced by the interaction between the DP alpha chain and its polymorphic DP beta chain partner.. Hum. Immunol. 23: 37 — 44. PubMed DOI:10.1016/0198-8859(88)90016-X
Muntau B., Thye T., Pirmez C., Horstmann R.D. (1997). A novel DPA1 allele (DPA1*0203) composed of known epitopes.. Tissue Antigens 49: 668 — 669. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1997.tb02821.x
McDaniel D.O., Nguyen C., McDaniel L.S. (2000). A new HLA-DPA1 allele, DPA1*02016, identified in African-American population.. Tissue Antigens 56: 197 — 198. PubMed DOI:10.1034/j.1399-0039.2000.560219.x
Peterson T.A., Luo M., Mao X., Brunham R.C., Plummer F.A. (2008). Identification of a novel DPA1 allele, DPA1*010602, in an East African population.. Hum. Immunol. 69: 885 — 886. PubMed DOI:10.1016/j.humimm.2008.09.001
Lee K.W. (2008). Description of two novel HLA-DPA1 alleles: DPA1*0110 and DPA1*010304.. Tissue Antigens 71: 575 — 577. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.2008.01035.x

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4938 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.
UniProt, P20036 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4938 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P20036 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.