HLA-DPB1

HLA-DPB1
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M
Ідентифікатори
Символи	HLA-DPB1, DPB1, HLA-DP, HLA-DP1B, HLA-DPB, major histocompatibility complex, class II, DP beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142858 HomoloGene: 129927 GeneCards: HLA-DPB1
Пов'язані генетичні захворювання
	гепатит B[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • cell surface; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immune system process; • T cell costimulation; • positive regulation of interferon-gamma production; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • positive regulation of T cell activation; • positive regulation of T cell proliferation; • Імунна відповідь; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3115
	н/д
ENSG00000236693; ENSG00000230708; ENSG00000229295; ENSG00000226826; ENSG00000215048;
	ENSG00000223865; ENSG00000230763; ENSG00000237710
	н/д
	P04440
	н/д
	NM_002121
	н/д
	NP_002112
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

HLA-DPB1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 159[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMVLQVSAAP	RTVALTALLM	VLLTSVVQGR	ATPENYLFQG	RQECYAFNGT
QRFLERYIYN	REEFARFDSD	VGEFRAVTEL	GRPAAEYWNS	QKDILEEKRA
VPDRMCRHNY	ELGGPMTLQR	RVQPRVNVSP	SKKGPLQHHN	LLVCHVTDFY
PGSIQVRWFL	NGQEETAGVV	STNLIRNGDW	TFQILVMLEM	TPQQGDVYTC
QVEHTSLDSP	VTVEWKAQSD	SARSKTLTGA	GGFVLGLIIC	GVGIFMHRRS
KKVQRGSA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Kelly A., Trowsdale J. (1985). Complete nucleotide sequence of a functional HLA-DP beta gene and the region between the DP beta 1 and DP alpha 1 genes: comparison of the 5' ends of HLA class II genes.. Nucleic Acids Res. 13: 1607 — 1621. PubMed DOI:10.1093/nar/13.5.1607
Compagnone-Post P., Turco E., Robinson C., Trucco M. (1988). The beta-chains of DP4 molecules from different haplotypes are encoded by the same gene.. Genomics 2: 8 — 13. PubMed DOI:10.1016/0888-7543(88)90103-6
Korioth F., Hartung K., Deicher H., Frey J. (1992). A new HLA-DPB1 allele from a patient with systemic lupus erythematosus.. Tissue Antigens 39: 216 — 219. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb01938.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Rani R., Fernandez-Vina M.A., Zhang S., Stastny P. (1995). HLA-DPB1 alleles in a population from north India and description of a new variant (DPB1*5601).. Tissue Antigens 45: 264 — 269. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02450.x
Hessner M.J., Baxter-Lowe L.A. (1992). Characterization of novel HLA-DPB1 alleles by oligotyping and nucleotide sequencing.. Tissue Antigens 40: 261 — 263. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb02055.x

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4940 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P04440 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4940 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04440 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.