HLA-DQB1

HLA-DQB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JK8, 1S9V, 1UVQ, 2NNA, 4GG6
Ідентифікатори
Символи	HLA-DQB1, CELIAC1, HLA-DQB, IDDM1, major histocompatibility complex, class II, DQ beta 1, HLA-DRB1
Зовнішні ІД	OMIM: 604305 MGI: 103070 HomoloGene: 1603 GeneCards: HLA-DQB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immunoglobulin production involved in immunoglobulin-mediated immune response; • immune system process; • T cell costimulation; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • Імунна відповідь; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3119
	14961
ENSG00000233209; ENSG00000206237; ENSG00000231286; ENSG00000206302; ENSG00000179344;
	ENSG00000231939; ENSG00000225824
	ENSMUSG00000073421
	P01920
P14483; P01921; P06342; P06343; P06345;
	P06346
	NM_002123; NM_001243961; NM_001243962
	NM_207105
	NP_001230890; NP_001230891; NP_002114
	NP_996988
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HLA-DQB1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DQ beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 261 амінокислот, а молекулярна маса — 29 991[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSWKKALRIP	GGLRAATVTL	MLAMLSTPVA	EGRDSPEDFV	YQFKAMCYFT
NGTERVRYVT	RYIYNREEYA	RFDSDVEVYR	AVTPLGPPDA	EYWNSQKEVL
ERTRAELDTV	CRHNYQLELR	TTLQRRVEPT	VTISPSRTEA	LNHHNLLVCS
VTDFYPAQIK	VRWFRNDQEE	TTGVVSTPLI	RNGDWTFQIL	VMLEMTPQHG
DVYTCHVEHP	SLQNPITVEW	RAQSESAQSK	MLSGIGGFVL	GLIFLGLGLI
IHHRSQKGLL	H

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Boss J.M., Strominger J.L. (1984). Cloning and sequence analysis of the human major histocompatibility complex gene DC-3 beta.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81: 5199 — 5203. PubMed DOI:10.1073/pnas.81.16.5199
Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic.. Immunogenetics 27: 449 — 455. PubMed DOI:10.1007/BF00364432
Giorda R., Turco E., Trucco M. (1991). Full length beta chain cDNAs of DQw9 and DQw8 molecules encode proteins that differ only at amino acid 57.. Immunogenetics 33: 404 — 408. PubMed DOI:10.1007/BF00216702
Vilches C., Garcia-Pacheco J.M., de Pablo R., Puente S., Kreisler M. (1996). Complete coding region of the new HLA-DQB1*0612 allele, obtained by RT-PCR.. Tissue Antigens 48: 589 — 592. PubMed DOI:10.1111/j.1399-0039.1996.tb02674.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hiraiwa A., Seyfried C.E., Nepom G.T., Milner E.C. (1989). Sequence analysis of HLA class II domains: characterization of the DQw3 family of DQB genes.. Immunogenetics 29: 186 — 190. PubMed DOI:10.1007/BF00373644

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4944 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01920 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4944 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P01920 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.