HLA-DRB1

HLA-DRB1
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A6A, 1BX2, 1YMM, 2WBJ,%%s1AQD, 1DLH, 1FYT, 1HXY, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2XN9, 3L6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 4AEN, 4AH2, 4C56, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4I5B, 4OV5, 4X5W, 4X5X,%%s1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1J8H, 2SEB, 3O6F, 3T0E, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4Y19, 4Y1A
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRB1, DRB1, DRw10, HLA-DR1B, HLA-DRB, SS1, major histocompatibility complex, class II, DR beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142857 HomoloGene: 136635 GeneCards: HLA-DRB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding; • MHC class II receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • MHC class II protein complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • clathrin-coated endocytic vesicle membrane; • ендосома; • комплекс Ґольджі; • trans-Golgi network membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • late endosome membrane; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • transport vesicle membrane; • MHC class II protein complex; • lysosomal membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • Лізосома; • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; • endosome membrane; • external side of plasma membrane; • cell surface; • Екзосома;
Біологічний процес	• antigen processing and presentation; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • immune system process; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • immunoglobulin production involved in immunoglobulin-mediated immune response; • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II; • humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • Імунна відповідь; • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex; • T cell receptor signaling pathway; • adaptive immune response; • negative regulation of interferon-gamma production; • inflammatory response to antigenic stimulus; • protein tetramerization; • regulation of interleukin-4 production; • negative regulation of T cell proliferation; • T-helper 1 type immune response; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • T cell costimulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3123
	н/д
ENSG00000236884; ENSG00000206240; ENSG00000229074; ENSG00000196126; ENSG00000206306;
	ENSG00000228080
	н/д
	P01911
	н/д
	NM_001243965; NM_002124; NM_001359193; NM_001359194
	н/д
	NP_001230894; NP_002115; NP_001346122; NP_001346123; NP_002115.2
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

HLA-DRB1 (англ. HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-15 beta chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 29 966[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVCLKLPGGS	CMTALTVTLM	VLSSPLALSG	DTRPRFLWQP	KRECHFFNGT
ERVRFLDRYF	YNQEESVRFD	SDVGEFRAVT	ELGRPDAEYW	NSQKDILEQA
RAAVDTYCRH	NYGVVESFTV	QRRVQPKVTV	YPSKTQPLQH	HNLLVCSVSG
FYPGSIEVRW	FLNGQEEKAG	MVSTGLIQNG	DWTFQTLVML	ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT	SPLTVEWRAR	SESAQSKMLS	GVGGFVLGLL	FLGAGLFIYF
RNQKGHSGLQ	PTGFLS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic.. Immunogenetics 27: 449 — 455. PubMed DOI:10.1007/BF00364432
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591 — 4595. PubMed DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
Cresswell P. (1996). Invariant chain structure and MHC class II function.. Cell 84: 505 — 507. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)81025-9
Villadangos J.A. (2001). Presentation of antigens by MHC class II molecules: getting the most out of them.. Mol. Immunol. 38: 329 — 346. PubMed DOI:10.1016/S0161-5890(01)00069-4
Menendez-Benito V., Neefjes J. (2007). Autophagy in MHC class II presentation: sampling from within.. Immunity 26: 1 — 3. PubMed DOI:10.1016/j.immuni.2007.01.005

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4948 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01911 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4948 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P01911 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.