LAMA5

LAMA5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Y38
Ідентифікатори
Символи	LAMA5, Laminin, alpha 5, laminin subunit alpha 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 GeneCards: LAMA5
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural molecule activity; • integrin binding; • signaling receptor binding; • extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • laminin-5 complex; • extracellular region; • Базальна мембрана; • laminin-10 complex; • laminin-11 complex; • Екзосома; • клітинне ядро; • extracellular space; • synaptic cleft; • neuromuscular junction; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• hair follicle development; • Диференціація клітин; • regulation of embryonic development; • regulation of cell migration; • cell recognition; • embryo development; • lung development; • muscle organ development; • extracellular matrix organization; • morphogenesis of a polarized epithelium; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • focal adhesion assembly; • branching involved in ureteric bud morphogenesis; • regulation of cell adhesion; • Адгезія клітин; • regulation of cell population proliferation; • cytoskeleton organization; • Ангіогенез; • neural crest cell migration; • animal organ morphogenesis; • integrin-mediated signaling pathway; • endothelial cell differentiation; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • morphogenesis of embryonic epithelium; • проліферація; • cell migration; • branching morphogenesis of an epithelial tube; • branching involved in salivary gland morphogenesis; • cilium assembly; • protein localization to plasma membrane; • cytokine-mediated signaling pathway; • Гістогенез; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3911
	16776
	ENSG00000130702
	ENSMUSG00000015647
	O15230
	Q61001
	NM_005560
	NM_001081171
	NP_005551
	NP_001074640
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LAMA5 (англ. Laminin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 695 амінокислот, а молекулярна маса — 399 737[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKRLCAGSA	LCVRGPRGPA	PLLLVGLALL	GAARAREEAG	GGFSLHPPYF
NLAEGARIAA	SATCGEEAPA	RGSPRPTEDL	YCKLVGGPVA	GGDPNQTIRG
QYCDICTAAN	SNKAHPASNA	IDGTERWWQS	PPLSRGLEYN	EVNVTLDLGQ
VFHVAYVLIK	FANSPRPDLW	VLERSMDFGR	TYQPWQFFAS	SKRDCLERFG
PQTLERITRD	DAAICTTEYS	RIVPLENGEI	VVSLVNGRPG	AMNFSYSPLL
REFTKATNVR	LRFLRTNTLL	GHLMGKALRD	PTVTRRYYYS	IKDISIGGRC
VCHGHADACD	AKDPTDPFRL	QCTCQHNTCG	GTCDRCCPGF	NQQPWKPATA
NSANECQSCN	CYGHATDCYY	DPEVDRRRAS	QSLDGTYQGG	GVCIDCQHHT
TGVNCERCLP	GFYRSPNHPL	DSPHVCRRCN	CESDFTDGTC	EDLTGRCYCR
PNFSGERCDV	CAEGFTGFPS	CYPTPSSSND	TREQVLPAGQ	IVNCDCSAAG
TQGNACRKDP	RVGRCLCKPN	FQGTHCELCA	PGFYGPGCQP	CQCSSPGVAD
DRCDPDTGQC	RCRVGFEGAT	CDRCAPGYFH	FPLCQLCGCS	PAGTLPEGCD
EAGRCLCQPE	FAGPHCDRCR	PGYHGFPNCQ	ACTCDPRGAL	DQLCGAGGLC
RCRPGYTGTA	CQECSPGFHG	FPSCVPCHCS	AEGSLHAACD	PRSGQCSCRP
RVTGLRCDTC	VPGAYNFPYC	EAGSCHPAGL	APVDPALPEA	QVPCMCRAHV
EGPSCDRCKP	GFWGLSPSNP	EGCTRCSCDL	RGTLGGVAEC	QPGTGQCFCK
PHVCGQACAS	CKDGFFGLDQ	ADYFGCRSCR	CDIGGALGQS	CEPRTGVCRC
RPNTQGPTCS	EPARDHYLPD	LHHLRLELEE	AATPEGHAVR	FGFNPLEFEN
FSWRGYAQMA	PVQPRIVARL	NLTSPDLFWL	VFRYVNRGAM	SVSGRVSVRE
EGRSATCANC	TAQSQPVAFP	PSTEPAFITV	PQRGFGEPFV	LNPGTWALRV
EAEGVLLDYV	VLLPSAYYEA	ALLQLRVTEA	CTYRPSAQQS	GDNCLLYTHL
PLDGFPSAAG	LEALCRQDNS	LPRPCPTEQL	SPSHPPLITC	TGSDVDVQLQ
VAVPQPGRYA	LVVEYANEDA	RQEVGVAVHT	PQRAPQQGLL	SLHPCLYSTL
CRGTARDTQD	HLAVFHLDSE	ASVRLTAEQA	RFFLHGVTLV	PIEEFSPEFV
EPRVSCISSH	GAFGPNSAAC	LPSRFPKPPQ	PIILRDCQVI	PLPPGLPLTH
AQDLTPAMSP	AGPRPRPPTA	VDPDAEPTLL	REPQATVVFT	THVPTLGRYA
FLLHGYQPAH	PTFPVEVLIN	AGRVWQGHAN	ASFCPHGYGC	RTLVVCEGQA
LLDVTHSELT	VTVRVPKGRW	LWLDYVLVVP	ENVYSFGYLR	EEPLDKSYDF
ISHCAAQGYH	ISPSSSSLFC	RNAAASLSLF	YNNGARPCGC	HEVGATGPTC
EPFGGQCPCH	AHVIGRDCSR	CATGYWGFPN	CRPCDCGARL	CDELTGQCIC
PPRTIPPDCL	LCQPQTFGCH	PLVGCEECNC	SGPGIQELTD	PTCDTDSGQC
KCRPNVTGRR	CDTCSPGFHG	YPRCRPCDCH	EAGTAPGVCD	PLTGQCYCKE
NVQGPKCDQC	SLGTFSLDAA	NPKGCTRCFC	FGATERCRSS	SYTRQEFVDM
EGWVLLSTDR	QVVPHERQPG	TEMLRADLRH	VPEAVPEAFP	ELYWQAPPSY
LGDRVSSYGG	TLRYELHSET	QRGDVFVPME	SRPDVVLQGN	QMSITFLEPA
YPTPGHVHRG	QLQLVEGNFR	HTETRNTVSR	EELMMVLASL	EQLQIRALFS
QISSAVFLRR	VALEVASPAG	QGALASNVEL	CLCPASYRGD	SCQECAPGFY
RDVKGLFLGR	CVPCQCHGHS	DRCLPGSGVC	VDCQHNTEGA	HCERCQAGFV
SSRDDPSAPC	VSCPCPLSVP	SNNFAEGCVL	RGGRTQCLCK	PGYAGASCER
CAPGFFGNPL	VLGSSCQPCD	CSGNGDPNLL	FSDCDPLTGA	CRGCLRHTTG
PRCEICAPGF	YGNALLPGNC	TRCDCTPCGT	EACDPHSGHC	LCKAGVTGRR
CDRCQEGHFG	FDGCGGCRPC	ACGPAAEGSE	CHPQSGQCHC	RPGTMGPQCR
ECAPGYWGLP	EQGCRRCQCP	GGRCDPHTGR	CNCPPGLSGE	RCDTCSQQHQ
VPVPGGPVGH	SIHCEVCDHC	VVLLLDDLER	AGALLPAIHE	QLRGINASSM
AWARLHRLNA	SIADLQSQLR	SPLGPRHETA	QQLEVLEQQS	TSLGQDARRL
GGQAVGTRDQ	ASQLLAGTEA	TLGHAKTLLA	AIRAVDRTLS	ELMSQTGHLG
LANASAPSGE	QLLRTLAEVE	RLLWEMRARD	LGAPQAAAEA	ELAAAQRLLA
RVQEQLSSLW	EENQALATQT	RDRLAQHEAG	LMDLREALNR	AVDATREAQE
LNSRNQERLE	EALQRKQELS	RDNATLQATL	HAARDTLASV	FRLLHSLDQA
KEELERLAAS	LDGARTPLLQ	RMQTFSPAGS	KLRLVEAAEA	HAQQLGQLAL
NLSSIILDVN	QDRLTQRAIE	ASNAYSRILQ	AVQAAEDAAG	QALQQADHTW
ATVVRQGLVD	RAQQLLANST	ALEEAMLQEQ	QRLGLVWAAL	QGARTQLRDV
RAKKDQLEAH	IQAAQAMLAM	DTDETSKKIA	HAKAVAAEAQ	DTATRVQSQL
QAMQENVERW	QGQYEGLRGQ	DLGQAVLDAG	HSVSTLEKTL	PQLLAKLSIL
ENRGVHNASL	ALSASIGRVR	ELIAQARGAA	SKVKVPMKFN	GRSGVQLRTP
RDLADLAAYT	ALKFYLQGPE	PEPGQGTEDR	FVMYMGSRQA	TGDYMGVSLR
DKKVHWVYQL	GEAGPAVLSI	DEDIGEQFAA	VSLDRTLQFG	HMSVTVERQM
IQETKGDTVA	PGAEGLLNLR	PDDFVFYVGG	YPSTFTPPPL	LRFPGYRGCI
EMDTLNEEVV	SLYNFERTFQ	LDTAVDRPCA	RSKSTGDPWL	TDGSYLDGTG
FARISFDSQI	STTKRFEQEL	RLVSYSGVLF	FLKQQSQFLC	LAVQEGSLVL
LYDFGAGLKK	AVPLQPPPPL	TSASKAIQVF	LLGGSRKRVL	VRVERATVYS
VEQDNDLELA	DAYYLGGVPP	DQLPPSLRRL	FPTGGSVRGC	VKGIKALGKY
VDLKRLNTTG	VSAGCTADLL	VGRAMTFHGH	GFLRLALSNV	APLTGNVYSG
FGFHSAQDSA	LLYYRASPDG	LCQVSLQQGR	VSLQLLRTEV	KTQAGFADGA
PHYVAFYSNA	TGVWLYVDDQ	LQQMKPHRGP	PPELQPQPEG	PPRLLLGGLP
ESGTIYNFSG	CISNVFVQRL	LGPQRVFDLQ	QNLGSVNVST	GCAPALQAQT
PGLGPRGLQA	TARKASRRSR	QPARHPACML	PPHLRTTRDS	YQFGGSLSSH
LEFVGILARH	RNWPSLSMHV	LPRSSRGLLL	FTARLRPGSP	SLALFLSNGH
FVAQMEGLGT	RLRAQSRQRS	RPGRWHKVSV	RWEKNRILLV	TDGARAWSQE
GPHRQHQGAE	HPQPHTLFVG	GLPASSHSSK	LPVTVGFSGC	VKRLRLHGRP
LGAPTRMAGV	TPCILGPLEA	GLFFPGSGGV	ITLDLPGATL	PDVGLELEVR
PLAVTGLIFH	LGQARTPPYL	QLQVTEKQVL	LRADDGAGEF	STSVTRPSVL
CDGQWHRLAV	MKSGNVLRLE	VDAQSNHTVG	PLLAAAAGAP	APLYLGGLPE
PMAVQPWPPA	YCGCMRRLAV	NRSPVAMTRS	VEVHGAVGAS	GCPAA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins.. DNA Res. 8: 179 — 187. PubMed DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LAMA5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6485 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O15230 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LAMA5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6485 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O15230 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.