LEF1

LEF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LEF, 3OUW, 3OUX
Ідентифікатори
Символи	LEF1, LEF-1, TCF10, TCF1ALPHA, TCF7L3, lymphoid enhancer binding factor 1
Зовнішні ІД	MGI: 96770 HomoloGene: 7813 GeneCards: LEF1
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічний лімфолейкоз, системний червоний вовчак[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • armadillo repeat domain binding; • estrogen receptor binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor binding; • estrogen receptor activity; • gamma-catenin binding; • histone binding; • C2H2 zinc finger domain binding; • chromatin binding; • cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process; • GO:0001948 protein binding; • DNA binding, bending; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • beta-catenin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex; • beta-catenin-TCF complex; • Нуклеоплазма; • protein-DNA complex;
Біологічний процес	• somitogenesis; • tongue development; • paraxial mesoderm formation; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of DNA binding; • T cell receptor V(D)J recombination; • transcription by RNA polymerase II; • cellular response to cytokine stimulus; • mammary gland development; • negative regulation of interleukin-13 production; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis; • cell chemotaxis; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • face morphogenesis; • neutrophil differentiation; • negative regulation of interleukin-5 production; • regulation of transcription, DNA-templated; • dentate gyrus development; • apoptotic process involved in morphogenesis; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell growth; • regulation of Wnt signaling pathway; • embryonic limb morphogenesis; • hypothalamus development; • branching involved in blood vessel morphogenesis; • trachea gland development; • regulation of striated muscle tissue development; • positive regulation of cell-cell adhesion; • forebrain neuroblast division; • eye pigmentation; • negative regulation of apoptotic process; • sprouting angiogenesis; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • BMP signaling pathway; • positive regulation of cell cycle process; • osteoblast differentiation; • histone H3 acetylation; • formation of radial glial scaffolds; • positive regulation of granulocyte differentiation; • alpha-beta T cell differentiation; • canonical Wnt signaling pathway; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • sensory perception of taste; • cellular response to interleukin-4; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • cell development; • negative regulation of cell-cell adhesion; • negative regulation of interleukin-4 production; • negative regulation of striated muscle tissue development; • positive regulation of cell migration; • Wnt signaling pathway; • T-helper 1 cell differentiation; • positive regulation of cell proliferation in bone marrow; • anatomical structure regression; • chorio-allantoic fusion; • negative regulation of apoptotic process in bone marrow cell; • B cell proliferation; • positive regulation of gene expression; • vasculature development; • forebrain radial glial cell differentiation; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell population proliferation; • forebrain neuron differentiation; • histone H4 acetylation; • hippocampus development; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway; • steroid hormone mediated signaling pathway; • odontoblast differentiation; • beta-catenin-TCF complex assembly; • Епітеліально-мезенхімальний перехід; • regulation of cell-cell adhesion; • secondary palate development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	51176
	16842
	ENSG00000138795
	ENSMUSG00000027985
	Q9UJU2; Q659G9
	P27782
	NM_001130713; NM_001130714; NM_001166119; NM_016269
NM_001276402; NM_001276403; NM_010703; NM_001379059; NM_001379060;
	NM_001379061; NM_001379062
	NP_001124185; NP_001124186; NP_001159591; NP_057353; NP_057353.1
NP_001263331; NP_001263332; NP_034833; NP_001365988; NP_001365989;
	NP_001365990; NP_001365991
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LEF1 (англ. Lymphoid enhancer binding factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 201[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQLSGGGGG	GGGDPELCAT	DEMIPFKDEG	DPQKEKIFAE	ISHPEEEGDL
ADIKSSLVNE	SEIIPASNGH	EVARQAQTSQ	EPYHDKAREH	PDDGKHPDGG
LYNKGPSYSS	YSGYIMMPNM	NNDPYMSNGS	LSPPIPRTSN	KVPVVQPSHA
VHPLTPLITY	SDEHFSPGSH	PSHIPSDVNS	KQGMSRHPPA	PDIPTFYPLS
PGGVGQITPP	LGWQGQPVYP	ITGGFRQPYP	SSLSVDTSMS	RFSHHMIPGP
PGPHTTGIPH	PAIVTPQVKQ	EHPHTDSDLM	HVKPQHEQRK	EQEPKRPHIK
KPLNAFMLYM	KEMRANVVAE	CTLKESAAIN	QILGRRWHAL	SREEQAKYYE
LARKERQLHM	QLYPGWSARD	NYGKKKKRKR	EKLQESASGT	GPRMTAAYI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Waterman M.L., Fischer W.H., Jones K.A. (1991). A thymus-specific member of the HMG protein family regulates the human T cell receptor C alpha enhancer.. Genes Dev. 5: 656 — 669. PubMed DOI:10.1101/gad.5.4.656
Hovanes K., Li T.W., Waterman M.L. (2000). The human LEF-1 gene contains a promoter preferentially active in lymphocytes and encodes multiple isoforms derived from alternative splicing.. Nucleic Acids Res. 28: 1994 — 2003. PubMed DOI:10.1093/nar/28.9.1994
Jesse S., Koenig A., Ellenrieder V., Menke A. (2010). Lef-1 isoforms regulate different target genes and reduce cellular adhesion.. Int. J. Cancer 126: 1109 — 1120. PubMed DOI:10.1002/ijc.24802
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bruhn L., Munnerlyn A., Grosschedl R. (1997). ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function.. Genes Dev. 11: 640 — 653. PubMed DOI:10.1101/gad.11.5.640
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors.. Nucleic Acids Res. 29: 1410 — 1419. PubMed DOI:10.1093/nar/29.7.1410

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LEF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6551 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q9UJU2 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LEF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6551 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9UJU2 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.