LITAF

LITAF
Ідентифікатори
Символи	LITAF, PIG7, SIMPLE, TP53I7, lipopolysaccharide induced TNF factor
Зовнішні ІД	OMIM: 603795 MGI: 1929512 HomoloGene: 37974 GeneCards: LITAF
Пов'язані генетичні захворювання
	Charcot-Marie-Tooth disease type 1C[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity; • GO:0001948 protein binding; • WW domain binding; • zinc ion binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • DNA binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• мембрана; • Нуклеоплазма; • lysosomal membrane; • Лізосома; • гіалоплазма; • cytoplasmic side of plasma membrane; • cytoplasmic side of early endosome membrane; • cytoplasmic side of late endosome membrane; • cytoplasmic side of lysosomal membrane; • Golgi membrane; • клітинне ядро; • цитоплазма; • Ендосома; • комплекс Ґольджі; • клітинна мембрана; • endosome membrane; • early endosome membrane; • late endosome membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • integral component of membrane;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • Старіння людини; • transcription, DNA-templated; • regulation of cytokine production; • response to lipopolysaccharide; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • cellular response to lipopolysaccharide; • Сигнальна трансдукція; • transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9516
	56722
	ENSG00000189067
	ENSMUSG00000022500
	Q99732
	Q9JLJ0
	NM_001136472; NM_001136473; NM_004862
	NM_019980
	NP_001129944; NP_001129945; NP_004853
	NP_064364
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LITAF (англ. Lipopolysaccharide induced TNF factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 161 амінокислот, а молекулярна маса — 17 107[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVPGPYQAA	TGPSSAPSAP	PSYEETVAVN	SYYPTPPAPM	PGPTTGLVTG
PDGKGMNPPS	YYTQPAPIPN	NNPITVQTVY	VQHPITFLDR	PIQMCCPSCN
KMIVSQLSYN	AGALTWLSCG	SLCLLGCIAG	CCFIPFCVDA	LQDVDHYCPN
CRALLGTYKR	L

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Polyak K., Xia Y., Zweier J.L., Kinzler K.W., Vogelstein B. (1997). A model for p53-induced apoptosis.. Nature 389: 300 — 306. PubMed DOI:10.1038/38525
Myokai F., Takashiba S., Lebo R., Amar S. (1999). A novel lipopolysaccharide-induced transcription factor regulating tumor necrosis factor alpha gene expression: molecular cloning, sequencing, characterization, and chromosomal assignment.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4518 — 4523. PubMed DOI:10.1073/pnas.96.8.4518
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Shirk A.J., Anderson S.K., Hashemi S.H., Chance P.F., Bennett C.L. (2005). SIMPLE interacts with NEDD4 and TSG101: evidence for a role in lysosomal sorting and implications for Charcot-Marie-Tooth disease.. J. Neurosci. Res. 82: 43 — 50. PubMed DOI:10.1002/jnr.20628
Tang X., Marciano D.L., Leeman S.E., Amar S. (2005). LPS induces the interaction of a transcription factor, LPS-induced TNF-alpha factor, and STAT6(B) with effects on multiple cytokines.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5132 — 5137. PubMed DOI:10.1073/pnas.0501159102
Tang X., Metzger D., Leeman S., Amar S. (2006). LPS-induced TNF-alpha factor (LITAF)-deficient mice express reduced LPS-induced cytokine: Evidence for LITAF-dependent LPS signaling pathways.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 13777 — 13782. PubMed DOI:10.1073/pnas.0605988103

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з LITAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16841 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q99732 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LITAF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16841 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q99732 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.