MBD2

MBD2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L2L
Ідентифікатори
Символи	MBD2, DMTase, NY-CO-41, methyl-CpG binding domain protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603547 MGI: 1333813 HomoloGene: 2918 GeneCards: MBD2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • protein domain specific binding; • methyl-CpG binding; • C2H2 zinc finger domain binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding; • siRNA binding; • nucleosomal DNA binding; • satellite DNA binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • histone deacetylase complex; • Гетерохроматин; • Хроматин; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of Wnt signaling pathway; • regulation of cell population proliferation; • maternal behavior; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • старіння людини; • response to mechanical stimulus; • response to estradiol; • cellular response to organic cyclic compound; • response to nutrient levels; • response to organic cyclic compound; • positive regulation of chromatin binding; • heart development; • embryonic organ development; • rDNA heterochromatin assembly; • regulation of DNA methylation; • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • cellular protein-containing complex assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8932
	17191
	ENSG00000134046
	ENSMUSG00000024513
	Q9UBB5
	Q9Z2E1
	NM_015832; NM_003927
	NM_010773; NM_001311071
	NP_003918; NP_056647; NP_056647.1
	NP_001298000; NP_034903
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MBD2 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 43 255[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRAHPGGGRC	CPEQEEGESA	AGGSGAGGDS	AIEQGGQGSA	LAPSPVSGVR
REGARGGGRG	RGRWKQAGRG	GGVCGRGRGR	GRGRGRGRGR	GRGRGRPPSG
GSGLGGDGGG	CGGGGSGGGG	APRREPVPFP	SGSAGPGPRG	PRATESGKRM
DCPALPPGWK	KEEVIRKSGL	SAGKSDVYYF	SPSGKKFRSK	PQLARYLGNT
VDLSSFDFRT	GKMMPSKLQK	NKQRLRNDPL	NQNKGKPDLN	TTLPIRQTAS
IFKQPVTKVT	NHPSNKVKSD	PQRMNEQPRQ	LFWEKRLQGL	SASDVTEQII
KTMELPKGLQ	GVGPGSNDET	LLSAVASALH	TSSAPITGQV	SAAVEKNPAV
WLNTSQPLCK	AFIVTDEDIR	KQEERVQQVR	KKLEEALMAD	ILSRAADTEE
MDIEMDSGDE	A

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins.. Mol. Cell. Biol. 18: 6538 — 6547. PubMed DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bhattacharya S.K., Ramchandani S., Cervoni N., Szyf M. (1999). A mammalian protein with specific demethylase activity for mCpG DNA.. Nature 397: 579 — 583. PubMed DOI:10.1038/17533
Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase.. Genes Cells 5: 677 — 688. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. (2000). The minimal repression domain of MBD2b overlaps with the methyl-CpG-binding domain and binds directly to Sin3A.. J. Biol. Chem. 275: 34963 — 34967. PubMed DOI:10.1074/jbc.M005929200
Sekimata M., Takahashi A., Murakami-Sekimata A., Homma Y. (2001). Involvement of a novel zinc finger protein, MIZF, in transcriptional repression by interacting with a methyl-CpG-binding protein, MBD2.. J. Biol. Chem. 276: 42632 — 42638. PubMed DOI:10.1074/jbc.M107048200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6917 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9UBB5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6917 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UBB5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.