MBD3

MBD3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2MB7
Ідентифікатори
Символи	MBD3, methyl-CpG binding domain protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603573 MGI: 1333812 HomoloGene: 2917 GeneCards: MBD3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyl-CpG binding; • DNA binding; • nucleosomal DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • chromatin binding; • histone deacetylase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Гетерохроматин; • хромосома; • NuRD complex; • цитоплазма; • Хроматин; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• response to estradiol; • Гістогенез; • embryonic organ development; • regulation of DNA methylation; • in utero embryonic development; • response to organic cyclic compound; • regulation of transcription, DNA-templated; • heart development; • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly; • histone acetylation; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • старіння людини; • brain development; • response to nutrient levels; • transcription, DNA-templated; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • histone deacetylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	53615
	17192
	ENSG00000071655
	ENSMUSG00000035478
	O95983
	Q9Z2D8
	NM_003926; NM_001281453; NM_001281454
	NM_013595; NM_001306143
	NP_001268382; NP_001268383
	NP_001293072; NP_038623
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MBD3 (англ. Methyl-CpG binding domain protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 844[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERKRWECPA	LPQGWEREEV	PRRSGLSAGH	RDVFYYSPSG	KKFRSKPQLA
RYLGGSMDLS	TFDFRTGKML	MSKMNKSRQR	VRYDSSNQVK	GKPDLNTALP
VRQTASIFKQ	PVTKITNHPS	NKVKSDPQKA	VDQPRQLFWE	KKLSGLNAFD
IAEELVKTMD	LPKGLQGVGP	GCTDETLLSA	IASALHTSTM	PITGQLSAAV
EKNPGVWLNT	TQPLCKAFMV	TDEDIRKQEE	LVQQVRKRLE	EALMADMLAH
VEELARDGEA	PLDKACAEDD	DEEDEEEEEE	EPDPDPEMEH	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Hendrich B., Bird A. (1998). Identification and characterization of a family of mammalian methyl-CpG binding proteins.. Mol. Cell. Biol. 18: 6538 — 6547. PubMed DOI:10.1128/MCB.18.11.6538
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase.. Genes Cells 5: 677 — 688. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
Saito M., Ishikawa F. (2002). The mCpG-binding domain of human MBD3 does not bind to mCpG but interacts with NuRD/Mi2 components HDAC1 and MTA2.. J. Biol. Chem. 277: 35434 — 35439. PubMed DOI:10.1074/jbc.M203455200
Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3.. J. Biol. Chem. 277: 40958 — 40966. PubMed DOI:10.1074/jbc.M207467200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6918 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O95983 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6918 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95983 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.