MDK

MDK
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1MKC, 1MKN
Ідентифікатори
Символи	MDK, ARAP, MK, NEGF2, midkine (neurite growth-promoting factor 2), midkine
Зовнішні ІД	OMIM: 162096 MGI: 96949 HomoloGene: 1792 GeneCards: MDK
Онтологія гена
Молекулярна функція	• growth factor activity; • heparin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell projection; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• Notch signaling pathway; • negative regulation of neuron apoptotic process; • regulation of behavior; • cerebellar granular layer development; • dentate gyrus development; • response to glucocorticoid; • behavioral fear response; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • multicellular organism development; • дефекація; • Короткочасна пам'ять; • cerebral cortex development; • response to hormone; • cell migration; • hippocampus development; • positive regulation of cell division; • Сигнальна трансдукція; • negative regulation of neuron death; • response to wounding; • adrenal gland development; • Диференціація клітин; • regulation of signaling receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4192
	17242
	ENSG00000110492
	ENSMUSG00000027239
	P21741
	P12025
NM_001012333; NM_001012334; NM_001270550; NM_001270551; NM_001270552;
	NM_002391
NM_001012335; NM_001012336; NM_010784; NM_001291481; NM_001291482;
	NM_001291483
NP_001012333; NP_001012334; NP_001257479; NP_001257480; NP_001257481;
	NP_002382
NP_001012335; NP_001012336; NP_001278410; NP_001278411; NP_001278412;
	NP_034914
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MDK (англ. Midkine (neurite growth-promoting factor 2)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 143 амінокислот, а молекулярна маса — 15 585[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQHRGFLLLT	LLALLALTSA	VAKKKDKVKK	GGPGSECAEW	AWGPCTPSSK
DCGVGFREGT	CGAQTQRIRC	RVPCNWKKEF	GADCKYKFEN	WGACDGGTGT
KVRQGTLKKA	RYNAQCQETI	RVTKPCTPKT	KAKAKAKKGK	GKD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з з молекулою гепарину. Секретований назовні.

Література

Tsutsui J., Uehara K., Kadomatsu K., Matsubara S., Muramatsu T. (1991). A new family of heparin-binding factors: strong conservation of midkine (MK) sequences between the human and the mouse.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 792 — 797. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(05)80255-4
Fairhurst J.L., Kretschmer P.J., Gluzman Y., Boehlen P., Kovesdi I. (1993). Structure of the gene coding for the human retinoic acid-inducible factor, MK.. DNA Cell Biol. 12: 139 — 147. PubMed DOI:10.1089/dna.1993.12.139
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
Uehara K., Matsubara S., Kadomatsu K., Tsutsui J., Muramatsu T. (1992). Genomic structure of human midkine (MK), a retinoic acid-responsive growth/differentiation factor.. J. Biochem. 111: 563 — 567. PubMed
Novotny W.F., Maffi T., Mehta R.L., Milner P.G. (1993). Identification of novel heparin-releasable proteins, as well as the cytokines midkine and pleiotrophin, in human postheparin plasma.. Arterioscler. Thromb. 13: 1798 — 1805. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6972 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P21741 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6972 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P21741 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.