MEP1B

MEP1B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4GWM, 4GWN
Ідентифікатори
Символи	MEP1B, meprin A subunit beta
Зовнішні ІД	OMIM: 600389 MGI: 96964 HomoloGene: 48382 GeneCards: MEP1B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • metallopeptidase activity; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • identical protein binding; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • extracellular region; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • meprin A complex;
Біологічний процес	• inflammatory response; • toxin transport; • Протеоліз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4225
	17288
	ENSG00000141434
	ENSMUSG00000024313
	Q16820
	Q61847
	NM_001308171; NM_005925
	NM_008586
	NP_001295100; NP_005916
	NP_032612
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MEP1B (англ. Meprin A subunit beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 701 амінокислот, а молекулярна маса — 79 571[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDLWNLSWFL	FLDALLVISG	LATPENFDVD	GGMDQDIFDI	NEGLGLDLFE
GDIRLDRAQI	RNSIIGEKYR	WPHTIPYVLE	DSLEMNAKGV	ILNAFERYRL
KTCIDFKPWA	GETNYISVFK	GSGCWSSVGN	RRVGKQELSI	GANCDRIATV
QHEFLHALGF	WHEQSRSDRD	DYVRIMWDRI	LSGREHNFNT	YSDDISDSLN
VPYDYTSVMH	YSKTAFQNGT	EPTIVTRISD	FEDVIGQRMD	FSDSDLLKLN
QLYNCSSSLS	FMDSCSFELE	NVCGMIQSSG	DNADWQRVSQ	VPRGPESDHS
NMGQCQGSGF	FMHFDSSSVN	VGATAVLESR	TLYPKRGFQC	LQFYLYNSGS
ESDQLNIYIR	EYSADNVDGN	LTLVEEIKEI	PTGSWQLYHV	TLKVTKKFRV
VFEGRKGSGA	SLGGLSIDDI	NLSETRCPHH	IWHIRNFTQF	IGSPNGTLYS
PPFYSSKGYA	FQIYLNLAHV	TNAGIYFHLI	SGANDDQLQW	PCPWQQATMT
LLDQNPDIRQ	RMSNQRSITT	DPFMTTDNGN	YFWDRPSKVG	TVALFSNGTQ
FRRGGGYGTS	AFITHERLKS	RDFIKGDDVY	ILLTVEDISH	LNSTQIQLTP
APSVQDLCSK	TTCKNDGVCT	VRDGKAECRC	QSGEDWWYMG	ERCEKRGSTR
DTIVIAVSST	VAVFALMLII	TLVSVYCTRK	KYRERMSSNR	PNLTPQNQHA
F

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Dumermuth E., Eldering J.A., Gruenberg J., Jiang W., Sterchi E.E. (1993). Cloning of the PABA peptide hydrolase alpha subunit (PPH alpha) from human small intestine and its expression in COS-1 cells.. FEBS Lett. 335: 367 — 375. PubMed DOI:10.1016/0014-5793(93)80421-P
Pischitzis A., Hahn D., Leuenberger B., Sterchi E.E. (1999). N-Benzoyl-L-tyrosyl-p-aminobenzoic acid hydrolase beta (human meprinbeta). A 13-amino-acid sequence is required for proteolytic processing and subsequent secretion.. Eur. J. Biochem. 261: 421 — 429. PubMed DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00268.x
Leuenberger B., Hahn D., Pischitzis A., Hansen M.K., Sterchi E.E. (2003). Human meprin beta: O-linked glycans in the intervening region of the type I membrane protein protect the C-terminal region from proteolytic cleavage and diminish its secretion.. Biochem. J. 369: 659 — 665. PubMed DOI:10.1042/BJ20021398
Villa J.P., Bertenshaw G.P., Bond J.S. (2003). Critical amino acids in the active site of meprin metalloproteinases for substrate and peptide bond specificity.. J. Biol. Chem. 278: 42545 — 42550. PubMed DOI:10.1074/jbc.M303718200
Banerjee S., Bond J.S. (2008). Prointerleukin-18 is activated by meprin beta in vitro and in vivo in intestinal inflammation.. J. Biol. Chem. 283: 31371 — 31377. PubMed DOI:10.1074/jbc.M802814200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7020 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q16820 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7020 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q16820 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.