MET

MET
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1FYR, 1R0P, 1R1W, 1SHY, 1SSL, 2G15, 2RFN, 2RFS, 2UZX, 2UZY, 2WD1, 2WGJ, 2WKM, 3A4P, 3BUX, 3C1X, 3CCN, 3CD8, 3CE3, 3CTH, 3CTJ, 3DKC, 3DKF, 3DKG, 3EFJ, 3EFK, 3F66, 3F82, 3I5N, 3L8V, 3LQ8, 3Q6U, 3Q6W, 3QTI, 3R7O, 3RHK, 3U6H, 3U6I, 3VW8, 3ZBX, 3ZC5, 3ZCL, 3ZXZ, 3ZZE, 4AOI, 4AP7, 4DEG, 4DEH, 4DEI, 4EEV, 4GG7, 4IWD, 4K3J, 4KNB, 4MXC, 4O3T, 4O3U, 4R1V, 4R1Y, 4XMO, 4XYF, 5EYC, 5EYD
Ідентифікатори
Символи	MET, MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase, AUTS9, HGFR, RCCP2, c-Met, DFNB97, OSFD, c-met
Зовнішні ІД	OMIM: 164860 MGI: 96969 HomoloGene: 206 GeneCards: MET
Пов'язані генетичні захворювання
	Розсіяний склероз, autosomal recessive nonsyndromic deafness 97, osteofibrous dysplasia[1]
Реагує на сполуку
	cabozantinib, crizotinib, tivantinib[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • hepatocyte growth factor-activated receptor activity; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase activity; • protein phosphatase binding; • ATP binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity; • identical protein binding; • Wnt-protein binding; • semaphorin receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • cell surface; • basal plasma membrane; • внутрішньоклітинний; • receptor complex;
Біологічний процес	• negative regulation of hydrogen peroxide-mediated programmed cell death; • фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • positive regulation of endothelial cell chemotaxis; • endothelial cell morphogenesis; • protein phosphorylation; • cell surface receptor signaling pathway; • positive chemotaxis; • проліферація; • negative regulation of autophagy; • branching morphogenesis of an epithelial tube; • semaphorin-plexin signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • hepatocyte growth factor receptor signaling pathway; • MAPK cascade; • entry of bacterium into host cell; • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; • positive regulation of microtubule polymerization; • negative regulation of Rho protein signal transduction; • negative regulation of stress fiber assembly; • establishment of skin barrier; • negative regulation of thrombin-activated receptor signaling pathway; • negative regulation of guanyl-nucleotide exchange factor activity; • positive regulation of protein kinase B signaling; • liver development; • Фагоцитоз; • нейробіологія розвитку; • Wnt signaling pathway; • cell migration; • neuron differentiation; • pancreas development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4233
	17295
	ENSG00000105976
	ENSMUSG00000009376
	P08581
	P16056
	NM_000245; NM_001127500; NM_001324401; NM_001324402
	NM_008591
	NP_000236; NP_001120972; NP_001311330; NP_001311331
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MET (англ. MET proto-oncogene, receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 390 амінокислот, а молекулярна маса — 155 541[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAPAVLAPG	ILVLLFTLVQ	RSNGECKEAL	AKSEMNVNMK	YQLPNFTAET
PIQNVILHEH	HIFLGATNYI	YVLNEEDLQK	VAEYKTGPVL	EHPDCFPCQD
CSSKANLSGG	VWKDNINMAL	VVDTYYDDQL	ISCGSVNRGT	CQRHVFPHNH
TADIQSEVHC	IFSPQIEEPS	QCPDCVVSAL	GAKVLSSVKD	RFINFFVGNT
INSSYFPDHP	LHSISVRRLK	ETKDGFMFLT	DQSYIDVLPE	FRDSYPIKYV
HAFESNNFIY	FLTVQRETLD	AQTFHTRIIR	FCSINSGLHS	YMEMPLECIL
TEKRKKRSTK	KEVFNILQAA	YVSKPGAQLA	RQIGASLNDD	ILFGVFAQSK
PDSAEPMDRS	AMCAFPIKYV	NDFFNKIVNK	NNVRCLQHFY	GPNHEHCFNR
TLLRNSSGCE	ARRDEYRTEF	TTALQRVDLF	MGQFSEVLLT	SISTFIKGDL
TIANLGTSEG	RFMQVVVSRS	GPSTPHVNFL	LDSHPVSPEV	IVEHTLNQNG
YTLVITGKKI	TKIPLNGLGC	RHFQSCSQCL	SAPPFVQCGW	CHDKCVRSEE
CLSGTWTQQI	CLPAIYKVFP	NSAPLEGGTR	LTICGWDFGF	RRNNKFDLKK
TRVLLGNESC	TLTLSESTMN	TLKCTVGPAM	NKHFNMSIII	SNGHGTTQYS
TFSYVDPVIT	SISPKYGPMA	GGTLLTLTGN	YLNSGNSRHI	SIGGKTCTLK
SVSNSILECY	TPAQTISTEF	AVKLKIDLAN	RETSIFSYRE	DPIVYEIHPT
KSFISGGSTI	TGVGKNLNSV	SVPRMVINVH	EAGRNFTVAC	QHRSNSEIIC
CTTPSLQQLN	LQLPLKTKAF	FMLDGILSKY	FDLIYVHNPV	FKPFEKPVMI
SMGNENVLEI	KGNDIDPEAV	KGEVLKVGNK	SCENIHLHSE	AVLCTVPNDL
LKLNSELNIE	WKQAISSTVL	GKVIVQPDQN	FTGLIAGVVS	ISTALLLLLG
FFLWLKKRKQ	IKDLGSELVR	YDARVHTPHL	DRLVSARSVS	PTTEMVSNES
VDYRATFPED	QFPNSSQNGS	CRQVQYPLTD	MSPILTSGDS	DISSPLLQNT
VHIDLSALNP	ELVQAVQHVV	IGPSSLIVHF	NEVIGRGHFG	CVYHGTLLDN
DGKKIHCAVK	SLNRITDIGE	VSQFLTEGII	MKDFSHPNVL	SLLGICLRSE
GSPLVVLPYM	KHGDLRNFIR	NETHNPTVKD	LIGFGLQVAK	GMKYLASKKF
VHRDLAARNC	MLDEKFTVKV	ADFGLARDMY	DKEYYSVHNK	TGAKLPVKWM
ALESLQTQKF	TTKSDVWSFG	VLLWELMTRG	APPYPDVNTF	DITVYLLQGR
RLLQPEYCPD	PLYEVMLKCW	HPKAEMRPSF	SELVSRISAI	FSTFIGEHYV
HVNATYVNVK	CVAPYPSLLS	SEDNADDEVD	TRPASFWETS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Wang D., Li Z., Messing E.M., Wu G. (2002). Activation of Ras/Erk pathway by a novel MET-interacting protein RanBPM.. J. Biol. Chem. 277: 36216 — 36222. PubMed DOI:10.1074/jbc.M205111200
Palka H.L., Park M., Tonks N.K. (2003). Hepatocyte growth factor receptor tyrosine kinase met is a substrate of the receptor protein-tyrosine phosphatase DEP-1.. J. Biol. Chem. 278: 5728 — 5735. PubMed DOI:10.1074/jbc.M210656200
Wang D., Li Z., Schoen S.R., Messing E.M., Wu G. (2004). A novel MET-interacting protein shares high sequence similarity with RanBPM, but fails to stimulate MET-induced Ras/Erk signaling.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 313: 320 — 326. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.124
Koch A., Mancini A., El Bounkari O., Tamura T. (2005). The SH2-domain-containing inositol 5-phosphatase (SHIP)-2 binds to c-Met directly via tyrosine residue 1356 and involves hepatocyte growth factor (HGF)-induced lamellipodium formation, cell scattering and cell spreading.. Oncogene 24: 3436 — 3447. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1208558
Boccaccio C., Comoglio P.M. (2006). Invasive growth: a MET-driven genetic programme for cancer and stem cells.. Nat. Rev. Cancer 6: 637 — 645. PubMed DOI:10.1038/nrc1912

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з MET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з MET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7029 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P08581 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з MET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з MET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7029 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P08581 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.