MYO1E

MYO1E
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XMF
Ідентифікатори
Символи	MYO1E, FSGS6, HuncM-IC, MYO1C, myosin IE
Зовнішні ІД	OMIM: 601479 MGI: 106621 HomoloGene: 55864 GeneCards: MYO1E
Пов'язані генетичні захворювання
	focal segmental glomerulosclerosis 6[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • calmodulin binding; • actin filament binding; • microfilament motor activity; • GO:0001948 protein binding; • phosphatidylinositol binding; • actin binding; • cytoskeletal motor activity; • ATP binding; • lipid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell-cell junction; • clathrin-coated endocytic vesicle; • Адгезивні контакти; • Міжклітинні контакти; • brush border; • actin cytoskeleton; • Екзосома; • Цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • clathrin-coated vesicle; • myosin complex;
Біологічний процес	• кровотворення; • Ендоцитоз; • glomerular visceral epithelial cell development; • glomerular basement membrane development; • kidney development; • post-embryonic hemopoiesis; • in utero embryonic development; • actin filament-based movement; • васкулогенез; • nitrogen compound metabolic process; • glomerular filtration; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • Обмін речовин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4643
	71602
	ENSG00000157483
	ENSMUSG00000032220
	Q12965
	E9Q634
	NM_004998
	NM_181072
	NP_004989
	NP_851417
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MYO1E (англ. Myosin IE) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 108 амінокислот, а молекулярна маса — 127 062[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSKGVYQYH	WQSHNVKHSG	VDDMVLLSKI	TENSIVENLK	KRYMDDYIFT
YIGSVLISVN	PFKQMPYFGE	KEIEMYQGAA	QYENPPHIYA	LADNMYRNMI
IDRENQCVII	SGESGAGKTV	AAKYIMSYIS	RVSGGGTKVQ	HVKDIILQSN
PLLEAFGNAK	TVRNNNSSRF	GKYFEIQFSP	GGEPDGGKIS	NFLLEKSRVV
MRNPGERSFH	IFYQLIEGAS	AEQKHSLGIT	SMDYYYYLSL	SGSYKVDDID
DRREFQETLH	AMNVIGIFAE	EQTLVLQIVA	GILHLGNISF	KEVGNYAAVE
SEEFLAFPAY	LLGINQDRLK	EKLTSRQMDS	KWGGKSESIH	VTLNVEQACY
TRDALAKALH	ARVFDFLVDS	INKAMEKDHE	EYNIGVLDIY	GFEIFQKNGF
EQFCINFVNE	KLQQIFIELT	LKAEQEEYVQ	EGIRWTPIEY	FNNKIVCDLI
ENKVNPPGIM	SILDDVCATM	HAVGEGADQT	LLQKLQMQIG	SHEHFNSWNQ
GFIIHHYAGK	VSYDMDGFCE	RNRDVLFMDL	IELMQSSELP	FIKSLFPENL
QADKKGRPTT	AGSKIKKQAN	DLVSTLMKCT	PHYIRCIKPN	ETKKPRDWEE
SRVKHQVEYL	GLKENIRVRR	AGYAYRRIFQ	KFLQRYAILT	KATWPSWQGE
EKQGVLHLLQ	SVNMDSDQFQ	LGRSKVFIKA	PESLFLLEEM	RERKYDGYAR
VIQKSWRKFV	ARKKYVQMRE	EASDLLLNKK	ERRRNSINRN	FIGDYIGMEE
HPELQQFVGK	REKIDFADTV	TKYDRRFKGV	KRDLLLTPKC	LYLIGREKVK
QGPDKGLVKE	VLKRKIEIER	ILSVSLSTMQ	DDIFILHEQE	YDSLLESVFK
TEFLSLLAKR	YEEKTQKQLP	LKFSNTLELK	LKKENWGPWS	AGGSRQVQFH
QGFGDLAVLK	PSNKVLQVSI	GPGLPKNSRP	TRRNTTQNTG	YSSGTQNANY
PVRAAPPPPG	YHQNGVIRNQ	YVPYPHAPGS	QRSNQKSLYT	SMARPPLPRQ
QSTSSDRVSQ	TPESLDFLKV	PDQGAAGVRR	QTTSRPPPAG	GRPKPQPKPK
PQVPQCKALY	AYDAQDTDEL	SFNANDIIDI	IKEDPSGWWT	GRLRGKQGLF
PNNYVTKI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну, ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах.

Література

Bement W.M., Wirth J.A., Mooseker M.S. (1994). Cloning and mRNA expression of human unconventional myosin-IC. A homologue of amoeboid myosins-I with a single IQ motif and an SH3 domain.. J. Mol. Biol. 243: 356 — 363. PubMed DOI:10.1006/jmbi.1994.1662
Bement W.M., Hasson T., Wirth J.A., Cheney R.E., Mooseker M.S. (1994). Identification and overlapping expression of multiple unconventional myosin genes in vertebrate cell types.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6549 — 6553. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.14.6549
Bement W.M., Hasson T., Wirth J.A., Cheney R.E., Mooseker M.S. (1994). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 11767 — 11767. PubMed DOI:10.1073/pnas.91.24.11767c
El Mezgueldi M., Tang N., Rosenfeld S.S., Ostap E.M. (2002). The kinetic mechanism of Myo1e (human myosin-IC).. J. Biol. Chem. 277: 21514 — 21521. PubMed DOI:10.1074/jbc.M200713200
Krendel M., Osterweil E.K., Mooseker M.S. (2007). Myosin 1E interacts with synaptojanin-1 and dynamin and is involved in endocytosis.. FEBS Lett. 581: 644 — 650. PubMed DOI:10.1016/j.febslet.2007.01.021
Liang Y., Niederstrasser H., Edwards M., Jackson C.E., Cooper J.A. (2009). Distinct roles for CARMIL isoforms in cell migration.. Mol. Biol. Cell 20: 5290 — 5305. PubMed DOI:10.1091/mbc.E08-10-1071

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з MYO1E переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7599 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q12965 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з MYO1E переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7599 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q12965 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.