NCAM1

NCAM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2E3V, 2HAZ, 2VKW, 2VKX, 3MTR, 5AEA
Ідентифікатори
Символи	NCAM1, CD56, MSK39, NCAM, neural cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 116930 MGI: 97281 HomoloGene: 40754 GeneCards: NCAM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• virus receptor activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • extracellular region; • cell surface; • anchored component of membrane; • Екзосома; • external side of plasma membrane; • гіалоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• interferon-gamma-mediated signaling pathway; • MAPK cascade; • axon guidance; • Адгезія клітин; • viral entry into host cell; • GO:0022415 viral process; • regulation of molecular function; • commissural neuron axon guidance; • regulation of semaphorin-plexin signaling pathway; • neuron projection development; • regulation of synaptic plasticity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4684
	17967
	ENSG00000149294
	ENSMUSG00000039542
	P13591
	P13595
NM_181351; NM_000615; NM_001076682; NM_001242607; NM_001242608;
	NM_001386289; NM_001386290; NM_001386291; NM_001386292
	NM_001081445; NM_001113204; NM_010875; NM_001311065
	NP_000606; NP_001070150; NP_001229536; NP_001229537; NP_851996
	NP_001074914; NP_001106675; NP_001297994; NP_035005
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCAM1 (англ. Neural cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 94 574[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLQTKDLIWT	LFFLGTAVSL	QVDIVPSQGE	ISVGESKFFL	CQVAGDAKDK
DISWFSPNGE	KLTPNQQRIS	VVWNDDSSST	LTIYNANIDD	AGIYKCVVTG
EDGSESEATV	NVKIFQKLMF	KNAPTPQEFR	EGEDAVIVCD	VVSSLPPTII
WKHKGRDVIL	KKDVRFIVLS	NNYLQIRGIK	KTDEGTYRCE	GRILARGEIN
FKDIQVIVNV	PPTIQARQNI	VNATANLGQS	VTLVCDAEGF	PEPTMSWTKD
GEQIEQEEDD	EKYIFSDDSS	QLTIKKVDKN	DEAEYICIAE	NKAGEQDATI
HLKVFAKPKI	TYVENQTAME	LEEQVTLTCE	ASGDPIPSIT	WRTSTRNISS
EEKASWTRPE	KQETLDGHMV	VRSHARVSSL	TLKSIQYTDA	GEYICTASNT
IGQDSQSMYL	EVQYAPKLQG	PVAVYTWEGN	QVNITCEVFA	YPSATISWFR
DGQLLPSSNY	SNIKIYNTPS	ASYLEVTPDS	ENDFGNYNCT	AVNRIGQESL
EFILVQADTP	SSPSIDQVEP	YSSTAQVQFD	EPEATGGVPI	LKYKAEWRAV
GEEVWHSKWY	DAKEASMEGI	VTIVGLKPET	TYAVRLAALN	GKGLGEISAA
SEFKTQPVQG	EPSAPKLEGQ	MGEDGNSIKV	NLIKQDDGGS	PIRHYLVRYR
ALSSEWKPEI	RLPSGSDHVM	LKSLDWNAEY	EVYVVAENQQ	GKSKAAHFVF
RTSAQPTAIP	ANGSPTSGLS	TGAIVGILIV	IFVLLLVVVD	ITCYFLNKCG
LFMCIAVNLC	GKAGPGAKGK	DMEEGKAAFS	KDESKEPIVE	VRTEEERTPN
HDGGKHTEPN	ETTPLTEPEK	GPVEAKPECQ	ETETKPAPAE	VKTVPNDATQ
TKENESKA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7656 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P13591 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7656 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P13591 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.