NCOA2

NCOA2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GWQ, 1GWR, 1M2Z, 1MV9, 1MVC, 1MZN, 1P93, 1T63, 1T65, 1UHL, 1YOK, 1ZDT, 1ZDU, 1ZKY, 2AO6, 2B1V, 2B1Z, 2B23, 2FAI, 2G44, 2G5O, 2P15, 2P1T, 2P1U, 2P1V, 2Q7J, 2Q7L, 2ZXZ, 2ZY0, 3A9E, 3DZU, 3DZY, 3E00, 3E7C, 3E94, 3FUG, 3GN8, 3K23, 3KWY, 3KYT, 3L0E, 3L0L, 3O1D, 3O1E, 3OAP, 3OZJ, 3PCU, 3PLZ, 3Q95, 3Q97, 3R5M, 3UP0, 3UP3, 4DOS, 4E2J, 4FHH, 4FHI, 4IA1, 4IA2, 4IA3, 4IA7, 4IQR, 4IU7, 4IUI, 4IV2, 4IV4, 4IVW, 4IVY, 4IW6, 4IW8, 4IWC, 4IWF, 2LDC, 2YJD, 3CLD, 3ERD, 3K22, 4CSJ, 4K4J, 4K6I, 4M8E, 4M8H, 4NIE, 4NQA, 4OC7, 4P6W, 4P6X, 4POH, 4POJ, 4PP3, 4PP5, 4PP6, 4PPP, 4PPS, 4PXM, 4Q0A, 4WG0, 4QE6, 4QE8, 4RFW, 4RMC, 4RMD, 4RME, 4ZN9, 4ZO1, 4RUO, 5APJ, 4UDD, 4PLD, 4PLE, 4UDC, 5APH, 5DMC, 5DKB, 5DMF, 4ZNV, 5DVS, 5DL4, 5E0W, 5E19, 4ZUC, 5DI7, 5I4V, 5E0X, 5E1C, 4ZWK, 5DYD, 5DIG, 5DKG, 5DTV, 5EC9, 5DX3, 5DRM, 5BP6, 5DYB, 5DLR, 5E14, 5DXK, 5DUH, 5DVV, 5DU5, 5DXP, 5DP0, 4ZNS, 5DZ3, 5DXR, 5DXQ, 5DZI, 4ZNT, 4ZNW, 5DID, 5DXM, 5EHJ, 5BQ4, 5DY8, 4ZSH, 5DXB, 5DUG, 5DK9, 5EIT, 5BPR, 5DWJ, 5DWI, 5HYR, 5DKS, 4ZUB, 5EI1, 5DZ0, 4ZNU, 4ZNH, 5E15, 4ZN7, 5DZ1, 5DUE, 4ZWH, 5EGV, 5BNU, 5DIE, 5DKE, 5DWG, 5DZH, 5DRJ, 5DWE
Ідентифікатори
Символи	NCOA2, GRIP1, KAT13C, NCoA-2, SRC2, TIF2, bHLHe75, nuclear receptor coactivator 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601993 MGI: 1276533 HomoloGene: 4768 GeneCards: NCOA2
Пов'язані генетичні захворювання
	недрібноклітинна карцинома легенів[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • transcription factor binding; • chromatin binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • nuclear receptor coactivator activity; • RNA polymerase II intronic transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • signaling receptor binding; • nuclear receptor binding; • aryl hydrocarbon receptor binding; • protein domain specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Ядерні тільця; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to Thyroglobulin triiodothyronine; • ритмічний процес; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • cellular response to hormone stimulus; • regulation of glucose metabolic process; • циркадний ритм; • bile acid and bile salt transport; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • locomotor rhythm; • intracellular receptor signaling pathway; • regulation of lipid metabolic process; • Регуляція експресії генів; • response to progesterone;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10499
	17978
	ENSG00000140396
	ENSMUSG00000005886
	Q15596
	Q61026
NM_006540; NM_001321703; NM_001321707; NM_001321711; NM_001321712;
	NM_001321713
	NM_001077695; NM_008678; NM_001302702
NP_001308632; NP_001308636; NP_001308640; NP_001308641; NP_001308642;
	NP_006531
	NP_001289631; NP_032704
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCOA2 (англ. Nuclear receptor coactivator 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 464 амінокислот, а молекулярна маса — 159 157[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGMGENTSD	PSRAETRKRK	ECPDQLGPSP	KRNTEKRNRE	QENKYIEELA
ELIFANFNDI	DNFNFKPDKC	AILKETVKQI	RQIKEQEKAA	AANIDEVQKS
DVSSTGQGVI	DKDALGPMML	EALDGFFFVV	NLEGNVVFVS	ENVTQYLRYN
QEELMNKSVY	SILHVGDHTE	FVKNLLPKSI	VNGGSWSGEP	PRRNSHTFNC
RMLVKPLPDS	EEEGHDNQEA	HQKYETMQCF	AVSQPKSIKE	EGEDLQSCLI
CVARRVPMKE	RPVLPSSESF	TTRQDLQGKI	TSLDTSTMRA	AMKPGWEDLV
RRCIQKFHAQ	HEGESVSYAK	RHHHEVLRQG	LAFSQIYRFS	LSDGTLVAAQ
TKSKLIRSQT	TNEPQLVISL	HMLHREQNVC	VMNPDLTGQT	MGKPLNPISS
NSPAHQALCS	GNPGQDMTLS	SNINFPINGP	KEQMGMPMGR	FGGSGGMNHV
SGMQATTPQG	SNYALKMNSP	SQSSPGMNPG	QPTSMLSPRH	RMSPGVAGSP
RIPPSQFSPA	GSLHSPVGVC	SSTGNSHSYT	NSSLNALQAL	SEGHGVSLGS
SLASPDLKMG	NLQNSPVNMN	PPPLSKMGSL	DSKDCFGLYG	EPSEGTTGQA
ESSCHPGEQK	ETNDPNLPPA	VSSERADGQS	RLHDSKGQTK	LLQLLTTKSD
QMEPSPLASS	LSDTNKDSTG	SLPGSGSTHG	TSLKEKHKIL	HRLLQDSSSP
VDLAKLTAEA	TGKDLSQESS	STAPGSEVTI	KQEPVSPKKK	ENALLRYLLD
KDDTKDIGLP	EITPKLERLD	SKTDPASNTK	LIAMKTEKEE	MSFEPGDQPG
SELDNLEEIL	DDLQNSQLPQ	LFPDTRPGAP	AGSVDKQAII	NDLMQLTAEN
SPVTPVGAQK	TALRISQSTF	NNPRPGQLGR	LLPNQNLPLD	ITLQSPTGAG
PFPPIRNSSP	YSVIPQPGMM	GNQGMIGNQG	NLGNSSTGMI	GNSASRPTMP
SGEWAPQSSA	VRVTCAATTS	AMNRPVQGGM	IRNPAASIPM	RPSSQPGQRQ
TLQSQVMNIG	PSELEMNMGG	PQYSQQQAPP	NQTAPWPESI	LPIDQASFAS
QNRQPFGSSP	DDLLCPHPAA	ESPSDEGALL	DQLYLALRNF	DGLEEIDRAL
GIPELVSQSQ	AVDPEQFSSQ	DSNIMLEQKA	PVFPQQYASQ	AQMAQGSYSP
MQDPNFHTMG	QRPSYATLRM	QPRPGLRPTG	LVQNQPNQLR	LQLQHRLQAQ
QNRQPLMNQI	SNVSNVNLTL	RPGVPTQAPI	NAQMLAQRQR	EILNQHLRQR
QMHQQQQVQQ	RTLMMRGQGL	NMTPSMVAPS	GMPATMSNPR	IPQANAQQFP
FPPNYGISQQ	PDPGFTGATT	PQSPLMSPRM	AHTQSPMMQQ	SQANPAYQAP
SDINGWAQGN	MGGNSMFSQQ	SPPHFGQQAN	TSMYSNNMNI	NVSMATNTGG
MSSMNQMTGQ	ISMTSVTSVP	TSGLSSMGPE	QVNDPALRGG	NLFPNQLPGM
DMIKQEGDTT	RKYC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fryer C.J., Archer T.K. (1998). Chromatin remodelling by the glucocorticoid receptor requires the BRG1 complex.. Nature 393: 88 — 91. PubMed DOI:10.1038/30032
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240
He Y., Simons S.S. Jr. (2007). STAMP, a novel predicted factor assisting TIF2 actions in glucocorticoid receptor-mediated induction and repression.. Mol. Cell. Biol. 27: 1467 — 1485. PubMed DOI:10.1128/MCB.01360-06
Voegel J.J., Heine M.J.S., Zechel C., Chambon P., Gronemeyer H. (1996). TIF2, a 160 kDa transcriptional mediator for the ligand-dependent activation function AF-2 of nuclear receptors.. EMBO J. 15: 3667 — 3675. PubMed
Carapeti M., Aguiar R.C.T., Goldman J.M., Cross N.C.P. (1998). A novel fusion between MOZ and the nuclear receptor coactivator TIF2 in acute myeloid leukemia.. Blood 91: 3127 — 3133. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з NCOA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7669 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, Q15596 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з NCOA2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7669 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q15596 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.