NELFCD

NELFCD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5L3X
Ідентифікатори
Символи	NELFCD, NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, negative elongation factor complex member C/D
Зовнішні ІД	OMIM: 605297 MGI: 1926424 HomoloGene: 9496 GeneCards: NELFCD
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • NELF complex; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • positive regulation of viral transcription; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51497
	57314
	ENSG00000101158
	ENSMUSG00000016253
	Q8IXH7
	Q922L6
	NM_016397; NM_198976
	NM_020580
	NP_945327
	NP_065605
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NELFCD (англ. Negative elongation factor complex member C/D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 66 247[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGAVPGAIM	DEDYYGSAAE	WGDEADGGQQ	EDDSGEGEDD	AEVQQECLHK
FSTRDYIMEP	SIFNTLKRYF	QAGGSPENVI	QLLSENYTAV	AQTVNLLAEW
LIQTGVEPVQ	VQETVENHLK	SLLIKHFDPR	KADSIFTEEG	ETPAWLEQMI
AHTTWRDLFY	KLAEAHPDCL	MLNFTVKLIS	DAGYQGEITS	VSTACQQLEV
FSRVLRTSLA	TILDGGEENL	EKNLPEFAKM	VCHGEHTYLF	AQAMMSVLAQ
EEQGGSAVRR	IAQEVQRFAQ	EKGHDASQIT	LALGTAASYP	RACQALGAML
SKGALNPADI	TVLFKMFTSM	DPPPVELIRV	PAFLDLFMQS	LFKPGARINQ
DHKHKYIHIL	AYAASVVETW	KKNKRVSINK	DELKSTSKAV	ETVHNLCCNE
NKGASELVAE	LSTLYQCIRF	PVVAMGVLKW	VDWTVSEPRY	FQLQTDHTPV
HLALLDEIST	CHQLLHPQVL	QLLVKLFETE	HSQLDVMEQL	ELKKTLLDRM
VHLLSRGYVL	PVVSYIRKCL	EKLDTDISLI	RYFVTEVLDV	IAPPYTSDFV
QLFLPILEND	SIAGTIKTEG	EHDPVTEFIA	HCKSNFIMVN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Bonthron D.T., Hayward B.E., Moran V., Strain L. (2000). Characterization of TH1 and CTSZ, two non-imprinted genes downstream of GNAS1 in chromosome 20q13.. Hum. Genet. 107: 165 — 175. PubMed DOI:10.1007/s004390000344
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yin X.L., Chen S., Gu J.X. (2002). Identification of TH1 as an interaction partner of A-Raf kinase.. Mol. Cell. Biochem. 231: 69 — 74. PubMed DOI:10.1023/A:1014437024129

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15934 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q8IXH7 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15934 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8IXH7 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.