NLRP1

NLRP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PN5, 3KAT, 4IFP, 4IM6
Ідентифікатори
Символи	NLRP1, CARD7, CIDED, CLR17.1, DEFCAP, DEFCAP-L/S, NAC, NALP1, PP1044, SLEV1, VAMAS1, NLR family, pyrin domain containing 1, NLR family pyrin domain containing 1, MSPC, AIADK, JRRP
Зовнішні ІД	OMIM: 606636 MGI: 3582959 HomoloGene: 19080 GeneCards: NLRP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • nucleotide binding; • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process; • ATP binding; • enzyme binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • inflammasome complex; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинний; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • NLRP1 inflammasome complex;
Біологічний процес	• neuron apoptotic process; • regulation of apoptotic process; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • response to muramyl dipeptide; • Апоптоз; • defense response to bacterium; • regulation of inflammatory response; • immune system process; • inflammatory response; • Вроджений імунітет; • GO:0022415 viral process; • NLRP1 inflammasome complex assembly; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	22861
	637515
	ENSG00000091592
	ENSMUSG00000070390
	Q9C000
	Q2LKV5; Q2LKV2; Q2LKW6; Q0GKD5
	NM_033007; NM_001033053; NM_014922; NM_033004; NM_033006
	NM_001039680; NM_001040696; NM_001162414
	NP_001028225; NP_055737; NP_127497; NP_127499; NP_127500
	NP_001035786; NP_001155886
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLRP1 (англ. NLR family pyrin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 473 амінокислот, а молекулярна маса — 165 866[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGGAWGRLA	CYLEFLKKEE	LKEFQLLLAN	KAHSRSSSGE	TPAQPEKTSG
MEVASYLVAQ	YGEQRAWDLA	LHTWEQMGLR	SLCAQAQEGA	GHSPSFPYSP
SEPHLGSPSQ	PTSTAVLMPW	IHELPAGCTQ	GSERRVLRQL	PDTSGRRWRE
ISASLLYQAL	PSSPDHESPS	QESPNAPTST	AVLGSWGSPP	QPSLAPREQE
APGTQWPLDE	TSGIYYTEIR	EREREKSEKG	RPPWAAVVGT	PPQAHTSLQP
HHHPWEPSVR	ESLCSTWPWK	NEDFNQKFTQ	LLLLQRPHPR	SQDPLVKRSW
PDYVEENRGH	LIEIRDLFGP	GLDTQEPRIV	ILQGAAGIGK	STLARQVKEA
WGRGQLYGDR	FQHVFYFSCR	ELAQSKVVSL	AELIGKDGTA	TPAPIRQILS
RPERLLFILD	GVDEPGWVLQ	EPSSELCLHW	SQPQPADALL	GSLLGKTILP
EASFLITART	TALQNLIPSL	EQARWVEVLG	FSESSRKEYF	YRYFTDERQA
IRAFRLVKSN	KELWALCLVP	WVSWLACTCL	MQQMKRKEKL	TLTSKTTTTL
CLHYLAQALQ	AQPLGPQLRD	LCSLAAEGIW	QKKTLFSPDD	LRKHGLDGAI
ISTFLKMGIL	QEHPIPLSYS	FIHLCFQEFF	AAMSYVLEDE	KGRGKHSNCI
IDLEKTLEAY	GIHGLFGAST	TRFLLGLLSD	EGEREMENIF	HCRLSQGRNL
MQWVPSLQLL	LQPHSLESLH	CLYETRNKTF	LTQVMAHFEE	MGMCVETDME
LLVCTFCIKF	SRHVKKLQLI	EGRQHRSTWS	PTMVVLFRWV	PVTDAYWQIL
FSVLKVTRNL	KELDLSGNSL	SHSAVKSLCK	TLRRPRCLLE	TLRLAGCGLT
AEDCKDLAFG	LRANQTLTEL	DLSFNVLTDA	GAKHLCQRLR	QPSCKLQRLQ
LVSCGLTSDC	CQDLASVLSA	SPSLKELDLQ	QNNLDDVGVR	LLCEGLRHPA
CKLIRLGLDQ	TTLSDEMRQE	LRALEQEKPQ	LLIFSRRKPS	VMTPTEGLDT
GEMSNSTSSL	KRQRLGSERA	ASHVAQANLK	LLDVSKIFPI	AEIAEESSPE
VVPVELLCVP	SPASQGDLHT	KPLGTDDDFW	GPTGPVATEV	VDKEKNLYRV
HFPVAGSYRW	PNTGLCFVMR	EAVTVEIEFC	VWDQFLGEIN	PQHSWMVAGP
LLDIKAEPGA	VEAVHLPHFV	ALQGGHVDTS	LFQMAHFKEE	GMLLEKPARV
ELHHIVLENP	SFSPLGVLLK	MIHNALRFIP	VTSVVLLYHR	VHPEEVTFHL
YLIPSDCSIR	KAIDDLEMKF	QFVRIHKPPP	LTPLYMGCRY	TVSGSGSGML
EILPKELELC	YRSPGEDQLF	SEFYVGHLGS	GIRLQVKDKK	DETLVWEALV
KPGDLMPATT	LIPPARIAVP	SPLDAPQLLH	FVDQYREQLI	ARVTSVEVVL
DKLHGQVLSQ	EQYERVLAEN	TRPSQMRKLF	SLSQSWDRKC	KDGLYQALKE
THPHLIMELW	EKGSKKGLLP	LSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bertin J., DiStefano P.S. (2000). The PYRIN domain: a novel motif found in apoptosis and inflammation proteins.. Cell Death Differ. 7: 1273 — 1274. PubMed DOI:10.1038/sj.cdd.4400774
Martinon F., Hofmann K., Tschopp J. (2001). The pyrin domain: a possible member of the death domain-fold family implicated in apoptosis and inflammation.. Curr. Biol. 11: R118 — R120. PubMed DOI:10.1016/S0960-9822(01)00056-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Martinon F., Burns K., Tschopp J. (2002). The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta.. Mol. Cell 10: 417 — 426. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(02)00599-3
Liao K.C., Mogridge J. (2009). Expression of Nlrp1b inflammasome components in human fibroblasts confers susceptibility to anthrax lethal toxin.. Infect. Immun. 77: 4455 — 4462. PubMed DOI:10.1128/IAI.00276-09
Postigo A., Cross J.R., Downward J., Way M. (2006). Interaction of F1L with the BH3 domain of Bak is responsible for inhibiting vaccinia-induced apoptosis.. Cell Death Differ. 13: 1651 — 1662. PubMed DOI:10.1038/sj.cdd.4401853

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14374 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9C000 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14374 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9C000 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.