NLRP3

NLRP3 (англ. NLR family pyrin domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 118 173[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKAD
HVDLATLMIDFNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNAR
VSNPTVICQEDSIEEEWMGLLEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQC
IEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQQEREQELLAIGKTKTCESPV
SPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMMLDWASGTLYQ
DRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL
MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITT
RPVALEKLQHLLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQ
ENEVLFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSL
LQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQKILFEESDLRNHGLQKADVS
AFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEKEGRTNVPGSR
LKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI
SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYF
PKIEINLSTRMDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRH
LDMVQCVLPSSSHAACSHGLVNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSD
NSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLSHECCFDISLVLSSNQKL
VELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVSCCLTSACCQDLASV
LSTSHSLTRLYVGENALGDSGVAILCEKAKNPQCNLQKLGLVNSGLTSVC
CSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDN
CNLTSHCCWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLL
QNLGLSEMYFNYETKSALETLQEEKPELTVVFEPSW
NLRP3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NLRP3, AGTAVPRL, AII, AVP, C1orf7, CIAS1, CLR1.1, FCAS, FCAS1, FCU, MWS, NALP3, PYPAF1, NLR family, pyrin domain containing 3, NLR family pyrin domain containing 3, DFNA34, KEFH
Зовнішні ІД OMIM: 606416 MGI: 2653833 HomoloGene: 3600 GeneCards: NLRP3
Пов'язані генетичні захворювання
Muckle-Wells syndrome, CINCA syndrome, autosomal dominant nonsyndromic deafness 34[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
114548
216799
Ensembl
ENSG00000162711
ENSMUSG00000032691
UniProt
Q96P20
Q8R4B8
RefSeq (мРНК)
NM_145827
NM_001359638
RefSeq (білок)
NP_665826
NP_001346567
Локус (UCSC) Хр. 1: 247.42 – 247.45 Mb Хр. 11: 59.54 – 59.57 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

  • Hoffman H.M., Mueller J.L., Broide D.H., Wanderer A.A., Kolodner R.D. (2001). Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome.. Nat. Genet. 29: 301 — 305. PubMed DOI:10.1038/ng756
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • O'Connor W. Jr., Harton J.A., Zhu X., Linhoff M.W., Ting J.-P. (2003). CIAS1/cryopyrin/PYPAF1/NALP3/CATERPILLER 1.1 is an inducible inflammatory mediator with NF-kappa B suppressive properties.. J. Immunol. 171: 6329 — 6333. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.171.12.6329
  • Haneklaus M., O'Neill L.A., Coll R.C. (2013). Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation: recent developments.. Curr. Opin. Immunol. 25: 40 — 45. PubMed DOI:10.1016/j.coi.2012.12.004
  • Lu A., Wu H. (2015). Structural mechanisms of inflammasome assembly.. FEBS J. 282: 435 — 444. PubMed DOI:10.1111/febs.13133
  • Bae J.Y., Park H.H. (2011). Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain (PYD) and its implications in inflammasome assembly.. J. Biol. Chem. 286: 39528 — 39536. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.278812

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.