NLRP3
NLRP3 (англ. NLR family pyrin domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 118 173[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKMASTRCKL | ARYLEDLEDV | DLKKFKMHLE | DYPPQKGCIP | LPRGQTEKAD | ||||
HVDLATLMID | FNGEEKAWAM | AVWIFAAINR | RDLYEKAKRD | EPKWGSDNAR | ||||
VSNPTVICQE | DSIEEEWMGL | LEYLSRISIC | KMKKDYRKKY | RKYVRSRFQC | ||||
IEDRNARLGE | SVSLNKRYTR | LRLIKEHRSQ | QEREQELLAI | GKTKTCESPV | ||||
SPIKMELLFD | PDDEHSEPVH | TVVFQGAAGI | GKTILARKMM | LDWASGTLYQ | ||||
DRFDYLFYIH | CREVSLVTQR | SLGDLIMSCC | PDPNPPIHKI | VRKPSRILFL | ||||
MDGFDELQGA | FDEHIGPLCT | DWQKAERGDI | LLSSLIRKKL | LPEASLLITT | ||||
RPVALEKLQH | LLDHPRHVEI | LGFSEAKRKE | YFFKYFSDEA | QARAAFSLIQ | ||||
ENEVLFTMCF | IPLVCWIVCT | GLKQQMESGK | SLAQTSKTTT | AVYVFFLSSL | ||||
LQPRGGSQEH | GLCAHLWGLC | SLAADGIWNQ | KILFEESDLR | NHGLQKADVS | ||||
AFLRMNLFQK | EVDCEKFYSF | IHMTFQEFFA | AMYYLLEEEK | EGRTNVPGSR | ||||
LKLPSRDVTV | LLENYGKFEK | GYLIFVVRFL | FGLVNQERTS | YLEKKLSCKI | ||||
SQQIRLELLK | WIEVKAKAKK | LQIQPSQLEL | FYCLYEMQEE | DFVQRAMDYF | ||||
PKIEINLSTR | MDHMVSSFCI | ENCHRVESLS | LGFLHNMPKE | EEEEEKEGRH | ||||
LDMVQCVLPS | SSHAACSHGL | VNSHLTSSFC | RGLFSVLSTS | QSLTELDLSD | ||||
NSLGDPGMRV | LCETLQHPGC | NIRRLWLGRC | GLSHECCFDI | SLVLSSNQKL | ||||
VELDLSDNAL | GDFGIRLLCV | GLKHLLCNLK | KLWLVSCCLT | SACCQDLASV | ||||
LSTSHSLTRL | YVGENALGDS | GVAILCEKAK | NPQCNLQKLG | LVNSGLTSVC | ||||
CSALSSVLST | NQNLTHLYLR | GNTLGDKGIK | LLCEGLLHPD | CKLQVLELDN | ||||
CNLTSHCCWD | LSTLLTSSQS | LRKLSLGNND | LGDLGVMMFC | EVLKQQSCLL | ||||
QNLGLSEMYF | NYETKSALET | LQEEKPELTV | VFEPSW |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.
Література
- Hoffman H.M., Mueller J.L., Broide D.H., Wanderer A.A., Kolodner R.D. (2001). Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome.. Nat. Genet. 29: 301 — 305. PubMed DOI:10.1038/ng756
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- O'Connor W. Jr., Harton J.A., Zhu X., Linhoff M.W., Ting J.-P. (2003). CIAS1/cryopyrin/PYPAF1/NALP3/CATERPILLER 1.1 is an inducible inflammatory mediator with NF-kappa B suppressive properties.. J. Immunol. 171: 6329 — 6333. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.171.12.6329
- Haneklaus M., O'Neill L.A., Coll R.C. (2013). Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation: recent developments.. Curr. Opin. Immunol. 25: 40 — 45. PubMed DOI:10.1016/j.coi.2012.12.004
- Lu A., Wu H. (2015). Structural mechanisms of inflammasome assembly.. FEBS J. 282: 435 — 444. PubMed DOI:10.1111/febs.13133
- Bae J.Y., Park H.H. (2011). Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain (PYD) and its implications in inflammasome assembly.. J. Biol. Chem. 286: 39528 — 39536. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111.278812
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NLRP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16400 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
- UniProt, Q96P20 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.