NLRP6

NLRP6
Ідентифікатори
Символи	NLRP6, AVR, CLR11.4, NALP6, NAVR, NAVR/AVR, PAN3, PYPAF5, NLR family, pyrin domain containing 6, NLR family pyrin domain containing 6
Зовнішні ІД	OMIM: 609650 MGI: 2141990 HomoloGene: 15881 GeneCards: NLRP6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • vasopressin receptor activity; • ATP binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Ядерна мембрана; • мембрана; • клітинна мембрана; • inflammasome complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to bacterium; • immune system process; • Загоєння ран; • regulation of mucus secretion; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of immune response; • regulation of autophagy; • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway; • negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus; • regulation of inflammatory response; • negative regulation of MAPK cascade; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • Вроджений імунітет; • inflammatory response; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	171389
	101613
	ENSG00000174885
	ENSMUSG00000038745
	P59044
	Q91WS2
	NM_001276700; NM_138329
	NM_001081389; NM_133946
	NP_001263629; NP_612202
	NP_598707
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLRP6 (англ. NLR family pyrin domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 892 амінокислот, а молекулярна маса — 98 768[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDQPEAPCSS	TGPRLAVARE	LLLAALEELS	QEQLKRFRHK	LRDVGPDGRS
IPWGRLERAD	AVDLAEQLAQ	FYGPEPALEV	ARKTLKRADA	RDVAAQLQER
RLQRLGLGSG	TLLSVSEYKK	KYREHVLQLH	ARVKERNARS	VKITKRFTKL
LIAPESAAPE	EAMGPAEEPE	PGRARRSDTH	TFNRLFRRDE	EGRRPLTVVL
QGPAGIGKTM	AAKKILYDWA	AGKLYQGQVD	FAFFMPCGEL	LERPGTRSLA
DLILDQCPDR	GAPVPQMLAQ	PQRLLFILDG	ADELPALGGP	EAAPCTDPFE
AASGARVLGG	LLSKALLPTA	LLLVTTRAAA	PGRLQGRLCS	PQCAEVRGFS
DKDKKKYFYK	YFRDERRAER	AYRFVKENET	LFALCFVPFV	CWIVCTVLRQ
QLELGRDLSR	TSKTTTSVYL	LFITSVLSSA	PVADGPRLQG	DLRNLCRLAR
EGVLGRRAQF	AEKELEQLEL	RGSKVQTLFL	SKKELPGVLE	TEVTYQFIDQ
SFQEFLAALS	YLLEDGGVPR	TAAGGVGTLL	RGDAQPHSHL	VLTTRFLFGL
LSAERMRDIE	RHFGCMVSER	VKQEALRWVQ	GQGQGCPGVA	PEVTEGAKGL
EDTEEPEEEE	EGEEPNYPLE	LLYCLYETQE	DAFVRQALCR	FPELALQRVR
FCRMDVAVLS	YCVRCCPAGQ	ALRLISCRLV	AAQEKKKKSL	GKRLQASLGG
GSSSQGTTKQ	LPASLLHPLF	QAMTDPLCHL	SSLTLSHCKL	PDAVCRDLSE
ALRAAPALTE	LGLLHNRLSE	AGLRMLSEGL	AWPQCRVQTV	RVQLPDPQRG
LQYLVGMLRQ	SPALTTLDLS	GCQLPAPMVT	YLCAVLQHQG	CGLQTLSLAS
VELSEQSLQE	LQAVKRAKPD	LVITHPALDG	HPQPPKELIS	TF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Tschopp J., Martinon F., Burns K. (2003). NALPs: a novel protein family involved in inflammation.. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4: 95 — 104. PubMed DOI:10.1038/nrm1019

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22944 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P59044 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22944 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P59044 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.