NLRX1

NLRX1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3UN9
Ідентифікатори
Символи	NLRX1, CLR11.3, DLNB26, NOD26, NOD5, NOD9, NLR family member X1
Зовнішні ІД	OMIM: 611947 MGI: 2429611 HomoloGene: 11623 GeneCards: NLRX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding;
Клітинна компонента	• мітохондріальна зовнішня мембрана; • мембрана; • мітохондрія; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти; • цитоплазма;
Біологічний процес	• negative regulation of interleukin-6 production; • negative regulation of type I interferon production; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of inflammatory response; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of RIG-I signaling pathway; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • immune system process; • negative regulation of innate immune response; • Вроджений імунітет; • GO:0007243 intracellular signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	79671
	270151
	ENSG00000160703
	ENSMUSG00000032109
	Q86UT6
	Q3TL44
	NM_001282143; NM_001282144; NM_001282358; NM_024618; NM_170722
	NM_001163742; NM_001163743; NM_178420
	NP_001269072; NP_001269073; NP_001269287; NP_078894
	NP_001157214; NP_001157215; NP_848507
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLRX1 (англ. NLR family member X1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 975 амінокислот, а молекулярна маса — 107 616[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRWGHHLPRA	SWGSGFRRAL	QRPDDRIPFL	IHWSWPLQGE	RPFGPPRAFI
RHHGSSVDSA	PPPGRHGRLF	PSASATEAIQ	RHRRNLAEWF	SRLPREERQF
GPTFALDTVH	VDPVIRESTP	DELLRPPAEL	ALEHQPPQAG	LPPLALSQLF
NPDACGRRVQ	TVVLYGTVGT	GKSTLVRKMV	LDWCYGRLPA	FELLIPFSCE
DLSSLGPAPA	SLCQLVAQRY	TPLKEVLPLM	AAAGSHLLFV	LHGLEHLNLD
FRLAGTGLCS	DPEEPQEPAA	IIVNLLRKYM	LPQASILVTT	RPSAIGRIPS
KYVGRYGEIC	GFSDTNLQKL	YFQLRLNQPY	CGYAVGGSGV	SATPAQRDHL
VQMLSRNLEG	HHQIAAACFL	PSYCWLVCAT	LHFLHAPTPA	GQTLTSIYTS
FLRLNFSGET	LDSTDPSNLS	LMAYAARTMG	KLAYEGVSSR	KTYFSEEDVC
GCLEAGIRTE	EEFQLLHIFR	RDALRFFLAP	CVEPGRAGTF	VFTVPAMQEY
LAALYIVLGL	RKTTLQKVGK	EVAELVGRVG	EDVSLVLGIM	AKLLPLRALP
LLFNLIKVVP	RVFGRMVGKS	REAVAQAMVL	EMFREEDYYN	DDVLDQMGAS
ILGVEGPRRH	PDEPPEDEVF	ELFPMFMGGL	LSAHNRAVLA	QLGCPIKNLD
ALENAQAIKK	KLGKLGRQVL	PPSELLDHLF	FHYEFQNQRF	SAEVLSSLRQ
LNLAGVRMTP	VKCTVVAAVL	GSGRHALDEV	NLASCQLDPA	GLRTLLPVFL
RARKLGLQLN	SLGPEACKDL	RDLLLHDQCQ	ITTLRLSNNP	LTAAGVAVLM
EGLAGNTSVT	HLSLLHTGLG	DEGLELLAAQ	LDRNRQLQEL	NVAYNGAGDT
AALALARAAR	EHPSLELLHL	YFNELSSEGR	QVLRDLGGAA	EGGARVVVSL
TEGTAVSEYW	SVILSEVQRN	LNSWDRARVQ	RHLELLLRDL	EDSRGATLNP
WRKAQLLRVE	GEVRALLEQL	GSSGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Inohara N., Nunez G. (2003). NODs: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis.. Nat. Rev. Immunol. 3: 371 — 382. PubMed DOI:10.1038/nri1086
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Inohara N., Chamaillard M., McDonald C., Nunez G. (2005). NOD-LRR proteins: role in host-microbial interactions and inflammatory disease.. Annu. Rev. Biochem. 74: 355 — 383. PubMed DOI:10.1146/annurev.biochem.74.082803.133347
Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases.. Annu. Rev. Immunol. 23: 387 — 414. PubMed DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616
Hong M., Yoon S.I., Wilson I.A. (2012). Structure and functional characterization of the RNA-binding element of the NLRX1 innate immune modulator.. Immunity 36: 337 — 347. PubMed DOI:10.1016/j.immuni.2011.12.018

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29890 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q86UT6 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29890 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86UT6 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.