NTRK1

NTRK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1HE7, 1SHC, 1WWA, 1WWW, 2IFG, 4AOJ, 4F0I, 4GT5, 4CRP, 4PMM, 4PMP, 4PMS, 4PMT, 4YNE, 4YPS
Ідентифікатори
Символи	NTRK1, MTC, TRK, TRK1, TRKA, Trk-A, p140-TrkA, neurotrophic receptor tyrosine kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 191315 MGI: 97383 HomoloGene: 1898 GeneCards: NTRK1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• neurotrophin binding; • GPI-linked ephrin receptor activity; • neurotrophin receptor activity; • kinase activity; • ATP binding; • protein kinase activity; • kinase binding; • transferase activity; • protein homodimerization activity; • GO:0001948 protein binding; • nucleotide binding; • nerve growth factor binding; • neurotrophin p75 receptor binding; • protein tyrosine kinase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • nerve growth factor receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • мембрана; • late endosome membrane; • cell surface; • integral component of membrane; • late endosome; • early endosome membrane; • receptor complex; • клітинна мембрана; • Аксон; • neuronal cell body; • early endosome; • integral component of plasma membrane; • Дендрит (нейробіологія); • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • Golgi membrane; • endosome membrane; • protein-containing complex; • recycling endosome; • recycling endosome membrane;
Біологічний процес	• negative regulation of neuron apoptotic process; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of Ras protein signal transduction; • positive regulation of programmed cell death; • behavioral response to formalin induced pain; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • protein phosphorylation; • циркадний ритм; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • B cell differentiation; • response to ethanol; • іннервація; • negative regulation of cell population proliferation; • response to nicotine; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • response to nutrient levels; • learning or memory; • protein autophosphorylation; • negative regulation of neuron death; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • Диференціація клітин; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • фосфорилювання; • cellular response to nicotine; • olfactory nerve development; • response to electrical stimulus; • Sertoli cell development; • mechanoreceptor differentiation; • нейробіологія розвитку; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • response to axon injury; • sensory perception of pain; • response to radiation; • phosphatidylinositol-mediated signaling; • sympathetic nervous system development; • ephrin receptor signaling pathway; • cellular response to growth factor stimulus; • старіння людини; • response to hydrostatic pressure; • response to activity; • axon guidance; • multicellular organism development; • axonogenesis involved in innervation; • positive regulation of neuron projection development; • programmed cell death involved in cell development; • positive regulation of synapse assembly; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • microtubule-based movement; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • peptidyl-tyrosine autophosphorylation; • nerve growth factor signaling pathway; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • negative regulation of apoptotic process; • regulation of MAPK cascade; • positive regulation of MAPK cascade; • cellular response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4914
	18211
	ENSG00000198400
	ENSMUSG00000028072
	P04629
	Q3UFB7
	NM_002529; NM_001007792; NM_001012331
	NM_001033124
	NP_001007793; NP_001012331; NP_002520
	NP_001028296
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NTRK1 (англ. Neurotrophic receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 87 497[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLRGGRRGQL	GWHSWAAGPG	SLLAWLILAS	AGAAPCPDAC	CPHGSSGLRC
TRDGALDSLH	HLPGAENLTE	LYIENQQHLQ	HLELRDLRGL	GELRNLTIVK
SGLRFVAPDA	FHFTPRLSRL	NLSFNALESL	SWKTVQGLSL	QELVLSGNPL
HCSCALRWLQ	RWEEEGLGGV	PEQKLQCHGQ	GPLAHMPNAS	CGVPTLKVQV
PNASVDVGDD	VLLRCQVEGR	GLEQAGWILT	ELEQSATVMK	SGGLPSLGLT
LANVTSDLNR	KNVTCWAEND	VGRAEVSVQV	NVSFPASVQL	HTAVEMHHWC
IPFSVDGQPA	PSLRWLFNGS	VLNETSFIFT	EFLEPAANET	VRHGCLRLNQ
PTHVNNGNYT	LLAANPFGQA	SASIMAAFMD	NPFEFNPEDP	IPVSFSPVDT
NSTSGDPVEK	KDETPFGVSV	AVGLAVFACL	FLSTLLLVLN	KCGRRNKFGI
NRPAVLAPED	GLAMSLHFMT	LGGSSLSPTE	GKGSGLQGHI	IENPQYFSDA
CVHHIKRRDI	VLKWELGEGA	FGKVFLAECH	NLLPEQDKML	VAVKALKEAS
ESARQDFQRE	AELLTMLQHQ	HIVRFFGVCT	EGRPLLMVFE	YMRHGDLNRF
LRSHGPDAKL	LAGGEDVAPG	PLGLGQLLAV	ASQVAAGMVY	LAGLHFVHRD
LATRNCLVGQ	GLVVKIGDFG	MSRDIYSTDY	YRVGGRTMLP	IRWMPPESIL
YRKFTTESDV	WSFGVVLWEI	FTYGKQPWYQ	LSNTEAIDCI	TQGRELERPR
ACPPEVYAIM	RGCWQREPQQ	RHSIKDVHAR	LQALAQAPPV	YLDVLG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, нейрогенез. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах.

Література

Martin-Zanca D., Oskam R., Mitra G., Copeland T.D., Barbacid M. (1989). Molecular and biochemical characterization of the human trk proto-oncogene.. Mol. Cell. Biol. 9: 24 — 33. PubMed DOI:10.1128/MCB.9.1.24
Indo Y., Mardy S., Tsuruta M., Karim M.A., Matsuda I. (1997). Structure and organization of the human TRKA gene encoding a high affinity receptor for nerve growth factor.. Jpn. J. Hum. Genet. 42: 343 — 351. PubMed DOI:10.1007/BF02766957
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Fujimoto M., Kitazawa R., Maeda S., Kitazawa S. (2005). Methylation adjacent to negatively regulating AP-1 site reactivates TrkA gene expression during cancer progression.. Oncogene 24: 5108 — 5118. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1208697
Martin-Zanca D., Hughes S.H., Barbacid M. (1986). A human oncogene formed by the fusion of truncated tropomyosin and protein tyrosine kinase sequences.. Nature 319: 743 — 748. PubMed DOI:10.1038/319743a0
Hempstead B.L., Martin-Zanca D., Kaplan D.R., Parada L.F., Chao M.V. (1991). High-affinity NGF binding requires coexpression of the trk proto-oncogene and the low-affinity NGF receptor.. Nature 350: 678 — 683. PubMed DOI:10.1038/350678a0

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8031 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.
UniProt, P04629 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8031 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P04629 (англ.). Процитовано 25 серпня 2017.