NXF1

NXF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4WYK, 1FO1, 1FT8, 1GO5, 1JKG, 1JN5, 1KOH, 1KOO, 1OAI, 2Z5K, 2Z5M, 3RW6, 3RW7
Ідентифікатори
Символи	NXF1, MEX67, TAP, nuclear RNA export factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602647 MGI: 1858330 HomoloGene: 38176 GeneCards: NXF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • single-stranded RNA binding; • mRNA binding; • GO:0005487 structural constituent of nuclear pore; • nucleic acid binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck; • transcription export complex; • Ядерна пора; • внутрішньоклітинний; • nuclear inclusion body; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • nuclear envelope;
Біологічний процес	• mRNA transport; • mRNA export from nucleus; • poly(A)+ mRNA export from nucleus; • GO:0022415 viral process; • RNA export from nucleus; • транспорт; • protein transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10482
	53319
	ENSG00000162231
	ENSMUSG00000010097
	Q9UBU9
	Q99JX7
	NM_006362; NM_001081491
	NM_001276704; NM_016813
	NP_001074960; NP_006353
	NP_001263633; NP_058093
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NXF1 (англ. Nuclear RNA export factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 70 182[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADEGKSYSE	HDDERVNFPQ	RKKKGRGPFR	WKYGEGNRRS	GRGGSGIRSS
RLEEDDGDVA	MSDAQDGPRV	RYNPYTTRPN	RRGDTWHDRD	RIHVTVRRDR
APPERGGAGT	SQDGTSKNWF	KITIPYGRKY	DKAWLLSMIQ	SKCSVPFTPI
EFHYENTRAQ	FFVEDASTAS	ALKAVNYKIL	DRENRRISII	INSSAPPHTI
LNELKPEQVE	QLKLIMSKRY	DGSQQALDLK	GLRSDPDLVA	QNIDVVLNRR
SCMAATLRII	EENIPELLSL	NLSNNRLYRL	DDMSSIVQKA	PNLKILNLSG
NELKSERELD	KIKGLKLEEL	WLDGNSLCDT	FRDQSTYISA	IRERFPKLLR
LDGHELPPPI	AFDVEAPTTL	PPCKGSYFGT	ENLKSLVLHF	LQQYYAIYDS
GDRQGLLDAY	HDGACCSLSI	PFIPQNPARS	SLAEYFKDSR	NVKKLKDPTL
RFRLLKHTRL	NVVAFLNELP	KTQHDVNSFV	VDISAQTSTL	LCFSVNGVFK
EVDGKSRDSL	RAFTRTFIAV	PASNSGLCIV	NDELFVRNAS	SEEIQRAFAM
PAPTPSSSPV	PTLSPEQQEM	LQAFSTQSGM	NLEWSQKCLQ	DNNWDYTRSA
QAFTHLKAKG	EIPEVAFMK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Braun I.C., Rohrbach E., Schmitt C., Izaurralde E. (1999). TAP binds to the constitutive transport element (CTE) through a novel RNA-binding motif that is sufficient to promote CTE-dependent RNA export from the nucleus.. EMBO J. 18: 1953 — 1965. PubMed DOI:10.1093/emboj/18.7.1953
Kang Y., Cullen B.R. (1999). The human Tap protein is a nuclear mRNA export factor that contains novel RNA-binding and nucleocytoplasmic transport sequences.. Genes Dev. 13: 1126 — 1139. PubMed DOI:10.1101/gad.13.9.1126
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Braun I.C., Herold A., Rode M., Conti E., Izaurralde E. (2001). Overexpression of TAP/p15 heterodimers bypasses nuclear retention and stimulates nuclear mRNA export.. J. Biol. Chem. 276: 20536 — 20543. PubMed DOI:10.1074/jbc.M100400200
Kataoka N., Diem M.D., Kim V.N., Yong J., Dreyfuss G. (2001). Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex.. EMBO J. 20: 6424 — 6433. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.22.6424
Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex.. Science 293: 1832 — 1836. PubMed DOI:10.1126/science.1062829

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8071 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q9UBU9 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8071 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UBU9 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.