OPN1LW

OPN1LW
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4ZWJ, 5DGY
Ідентифікатори
Символи	OPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive, opsin 1, long wave sensitive
Зовнішні ІД	OMIM: 300822 MGI: 1097692 HomoloGene: 68064 GeneCards: OPN1LW
Пов'язані генетичні захворювання
	blue cone monochromacy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • photoreceptor activity; • GO:0001948 protein binding; • G protein-coupled receptor activity; • 11-cis retinal binding; • G protein-coupled photoreceptor activity;
Клітинна компонента	• Golgi-associated vesicle membrane; • комплекс Ґольджі; • Golgi membrane; • photoreceptor outer segment; • cell-cell junction; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • photoreceptor inner segment; • ciliary membrane; • клітинна мембрана; • photoreceptor inner segment membrane; • photoreceptor outer segment membrane; • integral component of membrane; • photoreceptor disc membrane; • cell projection;
Біологічний процес	• retina development in camera-type eye; • sensory perception of light stimulus; • Сигнальна трансдукція; • response to stimulus; • detection of light stimulus; • absorption of visible light; • cellular response to light stimulus; • protein phosphorylation; • response to light stimulus; • regulation of rhodopsin mediated signaling pathway; • retinoid metabolic process; • phototransduction; • phototransduction, visible light; • photoreceptor cell maintenance; • зір; • protein-chromophore linkage; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • rhodopsin mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5956
	14539
	ENSG00000102076
	ENSMUSG00000031394
	P08100
	O35599
	NM_020061
	NM_008106
	NP_000530
	NP_032132
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OPN1LW (англ. Opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 218[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQRLTGEQT	LDHYEDSTHA	SIFTYTNSNS	TKGPFEGPNY	HIAPRWVYHL
TSTWMILVVV	ASVFTNGLVL	AATMRFKKLR	HPLNWILVNL	AVADLAETII
ASTISVVNQI	YGYFVLGHPL	CVIEGYIVSL	CGITGLWSLA	IISWERWLVV
CKPFGNVRFD	AKLATVGIVF	SWVWAAIWTA	PPIFGWSRYW	PYGLKTSCGP
DVFSGTSYPG	VQSYMMVLMV	TCCIFPLSII	VLCYLQVWLA	IRAVAKQQKE
SESTQKAEKE	VTRMVVVMVF	AYCLCWGPYT	FFACFATAHP	GYAFHPLVAS
LPSYFAKSAT	IYNPIIYVFM	NRQFRNCILH	LFGKKVDDSS	ELSSTSKTEV
SSVSSVSPA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

Sun H., Macke J.P., Nathans J. (1997). Mechanisms of spectral tuning in the mouse green cone pigment.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8860 — 8865. PubMed DOI:10.1073/pnas.94.16.8860
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з OPN1LW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, (англ.). Процитовано 13 лютого 2018.
UniProt, O35599 (англ.). Процитовано 13 лютого 2018.

Див. також

Хромосома X

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з OPN1LW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, (англ.). Процитовано 13 лютого 2018.

[UniProt-5] UniProt, O35599 (англ.). Процитовано 13 лютого 2018.