OPN1SW

OPN1SW
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1KPN
Ідентифікатори
Символи	OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive
Зовнішні ІД	OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW
Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity; • photoreceptor activity; • signal transducer activity; • G protein-coupled photoreceptor activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • мембрана; • photoreceptor outer segment; • photoreceptor disc membrane;
Біологічний процес	• response to stimulus; • protein-chromophore linkage; • Сигнальна трансдукція; • зір; • retinoid metabolic process; • phototransduction; • detection of visible light; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • cellular response to light stimulus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	611
	12057
	ENSG00000128617
	ENSMUSG00000058831
	P03999
	P51491
	NM_001708; NM_001385125
	NM_007538
	NP_001699
	NP_031564
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRKMSEEEFY	LFKNISSVGP	WDGPQYHIAP	VWAFYLQAAF	MGTVFLIGFP
LNAMVLVATL	RYKKLRQPLN	YILVNVSFGG	FLLCIFSVFP	VFVASCNGYF
VFGRHVCALE	GFLGTVAGLV	TGWSLAFLAF	ERYIVICKPF	GNFRFSSKHA
LTVVLATWTI	GIGVSIPPFF	GWSRFIPEGL	QCSCGPDWYT	VGTKYRSESY
TWFLFIFCFI	VPLSLICFSY	TQLLRALKAV	AAQQQESATT	QKAEREVSRM
VVVMVGSFCV	CYVPYAAFAM	YMVNNRNHGL	DLRLVTIPSF	FSKSACIYNP
IIYCFMNKQF	QACIMKMVCG	KAMTDESDTC	SSQKTEVSTV	SSTQVGPN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments.. Science 232: 193 — 202. PubMed DOI:10.1126/science.2937147
Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes.. J. Mol. Evol. 44: 378 — 382. PubMed DOI:10.1007/PL00006157
Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity.. Science 244: 331 — 334. PubMed DOI:10.1126/science.2565599
Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments.. Vision Res. 26: 1881 — 1895. PubMed DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment.. Am. J. Hum. Genet. 51: 444 — 446. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P03999 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P03999 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.