PDE4A

PDE4A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2QYK, 3I8V, 3TVX
Ідентифікатори
Символи	PDE4A, DPDE2, PDE4, PDE46, phosphodiesterase 4A
Зовнішні ІД	OMIM: 600126 MGI: 99558 HomoloGene: 4520 GeneCards: PDE4A
Реагує на сполуку
	ібуділаст, Роліпрам, YM976[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoric diester hydrolase activity; • cAMP binding; • GO:0001948 protein binding; • hydrolase activity; • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity; • зв'язування з іоном металу; • 3',5'-cyclic-AMP phosphodiesterase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ruffle membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • Нуклеоплазма; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• sensory perception of smell; • regulation of cAMP-mediated signaling; • cAMP catabolic process; • regulation of protein kinase A signaling; • Сигнальна трансдукція; • G protein-coupled receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5141
	18577
	ENSG00000065989
	ENSMUSG00000032177
	P27815
	O89084
	NM_001111307; NM_001111308; NM_001111309; NM_001243121; NM_006202
	NM_019798; NM_183408; NM_001310750
	NP_001104777; NP_001104778; NP_001104779; NP_001230050; NP_006193
	NP_001297679; NP_062772; NP_899668
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDE4A (англ. Phosphodiesterase 4A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 886 амінокислот, а молекулярна маса — 98 143[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPPTVPSER	SLSLSLPGPR	EGQATLKPPP	QHLWRQPRTP	IRIQQRGYSD
SAERAERERQ	PHRPIERADA	MDTSDRPGLR	TTRMSWPSSF	HGTGTGSGGA
GGGSSRRFEA	ENGPTPSPGR	SPLDSQASPG	LVLHAGAATS	QRRESFLYRS
DSDYDMSPKT	MSRNSSVTSE	AHAEDLIVTP	FAQVLASLRS	VRSNFSLLTN
VPVPSNKRSP	LGGPTPVCKA	TLSEETCQQL	ARETLEELDW	CLEQLETMQT
YRSVSEMASH	KFKRMLNREL	THLSEMSRSG	NQVSEYISTT	FLDKQNEVEI
PSPTMKEREK	QQAPRPRPSQ	PPPPPVPHLQ	PMSQITGLKK	LMHSNSLNNS
NIPRFGVKTD	QEELLAQELE	NLNKWGLNIF	CVSDYAGGRS	LTCIMYMIFQ
ERDLLKKFRI	PVDTMVTYML	TLEDHYHADV	AYHNSLHAAD	VLQSTHVLLA
TPALDAVFTD	LEILAALFAA	AIHDVDHPGV	SNQFLINTNS	ELALMYNDES
VLENHHLAVG	FKLLQEDNCD	IFQNLSKRQR	QSLRKMVIDM	VLATDMSKHM
TLLADLKTMV	ETKKVTSSGV	LLLDNYSDRI	QVLRNMVHCA	DLSNPTKPLE
LYRQWTDRIM	AEFFQQGDRE	RERGMEISPM	CDKHTASVEK	SQVGFIDYIV
HPLWETWADL	VHPDAQEILD	TLEDNRDWYY	SAIRQSPSPP	PEEESRGPGH
PPLPDKFQFE	LTLEEEEEEE	ISMAQIPCTA	QEALTAQGLS	GVEEALDATI
AWEASPAQES	LEVMAQEASL	EAELEAVYLT	QQAQSTGSAP	VAPDEFSSRE
EFVVAVSHSS	PSALALQSPL	LPAWRTLSVS	EHAPGLPGLP	STAAEVEAQR
EHQAAKRACS	ACAGTFGEDT	SALPAPGGGG	SGGDPT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Sullivan M., Egerton M., Shakur Y., Marquardsen A., Houslay M.D. (1994). Molecular cloning and expression, in both COS-1 cells and S. cerevisiae, of a human cytosolic type-IVA, cyclic AMP specific phosphodiesterase (hPDE-IVA-h6.1).. Cell. Signal. 6: 793 — 812. PubMed DOI:10.1016/0898-6568(94)00039-5
Horton Y.M., Sullivan M., Houslay M.D. (1995). Molecular cloning of a novel splice variant of human type IVA (PDE-IVA) cyclic AMP phosphodiesterase and localization of the gene to the p13.2-q12 region of human chromosome 19.. Biochem. J. 308: 683 — 691. PubMed DOI:10.1042/bj3080683
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8780 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P27815 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Phosphodiesterase 4A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8780 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P27815 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.