POLR2F

POLR2F
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1QKL, 5FLM, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2F, HRBP14.4, POLRF, RPABC14.4, RPABC2, RPB14.4, RPB6, RPC15, polymerase (RNA) II subunit F, RNA polymerase II subunit F, RNA polymerase II, I and III subunit F
Зовнішні ІД	OMIM: 604414 MGI: 1349393 HomoloGene: 7178 GeneCards: POLR2F
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II activity; • RNA polymerase III activity; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • RNA polymerase I activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Нуклеоплазма; • RNA polymerase I complex; • RNA polymerase III complex; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • fibrillar center;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • mRNA splicing, via spliceosome; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • transcription by RNA polymerase III; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA; • transcription, DNA-templated; • transcription elongation from RNA polymerase I promoter; • positive regulation of type I interferon production; • somatic stem cell population maintenance; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5435
	69833
	ENSG00000100142
	ENSMUSG00000033020
	P61218
	P61219
	NM_001301129; NM_001301130; NM_001301131; NM_021974; NM_001363825
	NM_027231
	NP_001288058; NP_001288059; NP_001288060; NP_068809; NP_001350754
	NP_081507
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2F (англ. RNA polymerase II subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 127 амінокислот, а молекулярна маса — 14 478[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDNEDNFDG	DDFDDVEEDE	GLDDLENAEE	EGQENVEILP	SGERPQANQK
RITTPYMTKY	ERARVLGTRA	LQIAMCAPVM	VELEGETDPL	LIAMKELKAR
KIPIIIRRYL	PDGSYEDWGV	DELIITD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Acker J., Wintzerith M., Vigneron M., Kedinger C. (1994). A 14.4 KDa acidic subunit of human RNA polymerase II with a putative leucine-zipper.. DNA Seq. 4: 329 — 331. PubMed DOI:10.3109/10425179409020860
Pusch C., Wang Z., Roe B., Blin N. (1996). Genomic structure of the RNA polymerase II small subunit (hRPB14.4) locus (POLRF) and mapping to 22q13.1 by sequence identity.. Genomics 34: 440 — 442. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.0312
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
del Rio-Portilla F., Gaskell A., Gilbert D., Ladias J.A., Wagner G. (1999). Solution structure of the hRPABC14.4 subunit of human RNA polymerases.. Nat. Struct. Biol. 6: 1039 — 1042. PubMed DOI:10.1038/14923

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9193 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P61218 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9193 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P61218 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.