PRX
PRX (англ. Periaxin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 154 905[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MEARSRSAEE | LRRAELVEII | VETEAQTGVS | GINVAGGGKE | GIFVRELRED | ||||
| SPAARSLSLQ | EGDQLLSARV | FFENFKYEDA | LRLLQCAEPY | KVSFCLKRTV | ||||
| PTGDLALRPG | TVSGYEIKGP | RAKVAKLNIQ | SLSPVKKKKM | VPGALGVPAD | ||||
| LAPVDVEFSF | PKFSRLRRGL | KAEAVKGPVP | AAPARRRLQL | PRLRVREVAE | ||||
| EAQAARLAAA | APPPRKAKVE | AEVAAGARFT | APQVELVGPR | LPGAEVGVPQ | ||||
| VSAPKAAPSA | EAAGGFALHL | PTLGLGAPAP | PAVEAPAVGI | QVPQVELPAL | ||||
| PSLPTLPTLP | CLETREGAVS | VVVPTLDVAA | PTVGVDLALP | GAEVEARGEA | ||||
| PEVALKMPRL | SFPRFGARAK | EVAEAKVAKV | SPEARVKGPR | LRMPTFGLSL | ||||
| LEPRPAAPEV | VESKLKLPTI | KMPSLGIGVS | GPEVKVPKGP | EVKLPKAPEV | ||||
| KLPKVPEAAL | PEVRLPEVEL | PKVSEMKLPK | VPEMAVPEVR | LPEVELPKVS | ||||
| EMKLPKVPEM | AVPEVRLPEV | QLLKVSEMKL | PKVPEMAVPE | VRLPEVQLPK | ||||
| VSEMKLPEVS | EVAVPEVRLP | EVQLPKVPEM | KVPEMKLPKV | PEMKLPEMKL | ||||
| PEVQLPKVPE | MAVPDVHLPE | VQLPKVPEMK | LPEMKLPEVK | LPKVPEMAVP | ||||
| DVHLPEVQLP | KVPEMKLPKM | PEMAVPEVRL | PEVQLPKVSE | MKLPKVPEMA | ||||
| VPDVHLPEVQ | LPKVCEMKVP | DMKLPEIKLP | KVPEMAVPDV | HLPEVQLPKV | ||||
| SEIRLPEMQV | PKVPDVHLPK | APEVKLPRAP | EVQLKATKAE | QAEGMEFGFK | ||||
| MPKMTMPKLG | RAESPSRGKP | GEAGAEVSGK | LVTLPCLQPE | VDGEAHVGVP | ||||
| SLTLPSVELD | LPGALGLQGQ | VPAAKMGKGE | RVEGPEVAAG | VREVGFRVPS | ||||
| VEIVTPQLPA | VEIEEGRLEM | IETKVKPSSK | FSLPKFGLSG | PKVAKAEAEG | ||||
| AGRATKLKVS | KFAISLPKAR | VGAEAEAKGA | GEAGLLPALD | LSIPQLSLDA | ||||
| HLPSGKVEVA | GADLKFKGPR | FALPKFGVRG | RDTEAAELVP | GVAELEGKGW | ||||
| GWDGRVKMPK | LKMPSFGLAR | GKEAEVQGDR | ASPGEKAEST | AVQLKIPEVE | ||||
| LVTLGAQEEG | RAEGAVAVSG | MQLSGLKVST | AGQVVTEGHD | AGLRMPPLGI | ||||
| SLPQVELTGF | GEAGTPGQQA | QSTVPSAEGT | AGYRVQVPQV | TLSLPGAQVA | ||||
| GGELLVGEGV | FKMPTVTVPQ | LELDVGLSRE | AQAGEAATGE | GGLRLKLPTL | ||||
| GARARVGGEG | AEEQPPGAER | TFCLSLPDVE | LSPSGGNHAE | YQVAEGEGEA | ||||
| GHKLKVRLPR | FGLVRAKEGA | EEGEKAKSPK | LRLPRVGFSQ | SEMVTGEGSP | ||||
| SPEEEEEEEE | EGSGEGASGR | RGRVRVRLPR | VGLAAPSKAS | RGQEGDAAPK | ||||
| SPVREKSPKF | RFPRVSLSPK | ARSGSGDQEE | GGLRVRLPSV | GFSETGAPGP | ||||
| ARMEGAQAAA | V |
| PRX | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | PRX, CMT4F, periaxin | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 605725 MGI: 108176 HomoloGene: 76542 GeneCards: PRX | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Шаблон експресії | |||||||||||||||||
 | |||||||||||||||||
| Більше даних | |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 19: 40.39 – 40.41 Mb | Хр. 7: 27.5 – 27.52 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro.. DNA Res. 7: 273 — 281. PubMed DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Shi Y., Zhang L., Yang T. (2014). Nuclear export of L-periaxin, mediated by its nuclear export signal in the PDZ domain.. PLoS ONE 9: E91953 — E91953. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0091953
- Han H., Kursula P. (2014). Periaxin and AHNAK nucleoprotein 2 form intertwined homodimers through domain swapping.. J. Biol. Chem. 289: 14121 — 14131. PubMed DOI:10.1074/jbc.M114.554816
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13797 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, Q9BXM0 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.