PSMA7

PSMA7
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4R3O, 4R67, 1IRU, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMA7, C6, HSPC, RC6-1, XAPC7, HEL-S-276, proteasome subunit alpha 7, proteasome 20S subunit alpha 7
Зовнішні ІД	OMIM: 606607 MGI: 1347070 HomoloGene: 105299 GeneCards: PSMA7
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • threonine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Нуклеоплазма; • Протеасома; • Екзосома; • клітинне ядро; • proteasome core complex; • postsynapse; • proteasome core complex, alpha-subunit complex;
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of mRNA stability; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • protein polyubiquitination; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • Протеоліз; • MAPK cascade; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • NIK/NF-kappaB signaling; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • T cell receptor signaling pathway; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0022415 viral process; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • protein deubiquitination; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • transmembrane transport; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • посттрансляційна модифікація; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • proteasomal protein catabolic process; • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5688
	26444
	ENSG00000101182
	ENSMUSG00000027566
	O14818
	Q9Z2U0
	NM_152255; NM_002792
	NM_001289476; NM_011969
	NP_002783
	NP_001276405; NP_036099
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSMA7 (англ. Proteasome subunit alpha 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 27 887[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYDRAITVF	SPDGHLFQVE	YAQEAVKKGS	TAVGVRGRDI	VVLGVEKKSV
AKLQDERTVR	KICALDDNVC	MAFAGLTADA	RIVINRARVE	CQSHRLTVED
PVTVEYITRY	IASLKQRYTQ	SNGRRPFGIS	ALIVGFDFDG	TPRLYQTDPS
GTYHAWKANA	IGRGAKSVRE	FLEKNYTDEA	IETDDLTIKL	VIKALLEVVQ
SGGKNIELAV	MRRDQSLKIL	NPEEIEKYVA	EIEKEKEENE	KKKQKKAS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone.. Biomacromolecules 5: 1465 — 1469. PubMed DOI:10.1021/bm049957a
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance.. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PubMed DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Dong J., Chen W., Welford A., Wandinger-Ness A. (2004). The proteasome alpha-subunit XAPC7 interacts specifically with Rab7 and late endosomes.. J. Biol. Chem. 279: 21334 — 21342. PubMed DOI:10.1074/jbc.M401022200
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths.. Biol. Chem. 397: 921 — 926. PubMed DOI:10.1515/hsz-2016-0176
da Fonseca P.C., Morris E.P. (2015). Cryo-EM reveals the conformation of a substrate analogue in the human 20S proteasome core.. Nat. Commun. 6: 7573 — 7573. PubMed DOI:10.1038/ncomms8573

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9536 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, O14818 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9536 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O14818 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.