PTGDS

PTGDS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4OS8, 2WWP, 3O19, 3O22, 3O2Y, 4IMN, 4IMO, 4ORR, 4ORS, 4ORU, 4ORW, 4ORX, 4ORY, 4OS0, 4OS3
Ідентифікатори
Символи	PTGDS, L-PGDS, LPGDS, PDS, PGD2, PGDS, PGDS2, prostaglandin D2 synthase
Зовнішні ІД	OMIM: 176803 MGI: 99261 HomoloGene: 737 GeneCards: PTGDS
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transporter activity; • isomerase activity; • fatty acid binding; • prostaglandin-D synthase activity; • GO:0001948 protein binding; • small molecule binding; • retinoid binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • комплекс Ґольджі; • rough endoplasmic reticulum; • Ядерна мембрана; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • extracellular region; • Ендоплазматичний ретикулум; • perinuclear region of cytoplasm; • Екзосома; • клітинне ядро; • extracellular space;
Біологічний процес	• prostaglandin metabolic process; • lipid metabolism; • cyclooxygenase pathway; • fatty acid metabolic process; • fatty acid biosynthetic process; • prostaglandin biosynthetic process; • regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep; • транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5730
	19215
	ENSG00000107317
	ENSMUSG00000015090
	P41222; Q5SQ11
	O09114
	NM_000954
	NM_008963
	NP_000945
	NP_032989
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTGDS (англ. Prostaglandin D2 synthase) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 029[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATHHTLWMG	LALLGVLGDL	QAAPEAQVSV	QPNFQQDKFL	GRWFSAGLAS
NSSWLREKKA	ALSMCKSVVA	PATDGGLNLT	STFLRKNQCE	TRTMLLQPAG
SLGSYSYRSP	HWGSTYSVSV	VETDYDQYAL	LYSQGSKGPG	EDFRMATLYS
RTQTPRAELK	EKFTAFCKAQ	GFTEDTIVFL	PQTDKCMTEQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ізомераз. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів, біосинтез простагландинів, метаболізм простагландинів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті Гольджі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zahn M., Maeder M., Schmidt B., Bollensen E., Felgenhauer K. (1993). Purification and N-terminal sequence of beta-trace, a protein abundant in human cerebrospinal fluid.. Neurosci. Lett. 154: 93 — 95. PubMed DOI:10.1016/0304-3940(93)90179-O
Giacomelli S., Leone M.-G., Grima J., Silvestrini B., Cheng C.Y. (1996). Astrocytes synthesize and secrete prostaglandin D synthetase in vitro.. Biochim. Biophys. Acta 1310: 269 — 276. PubMed DOI:10.1016/0167-4889(95)00182-4
White D.M., Takeda T., DeGroot L.J., Stefansson K., Arnason B.G.W. (1997). Beta-trace gene expression is regulated by a core promoter and a distal thyroid hormone response element.. J. Biol. Chem. 272: 14387 — 14393. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.22.14387
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD.. Mol. Cell. Proteomics: —. PubMed DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins.. J. Proteome Res. 12: 573 — 584. PubMed DOI:10.1021/pr300963h

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9592 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.
UniProt, P41222 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 9

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9592 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P41222 (англ.). Процитовано 21 серпня 2017.