PTPRM

PTPRM
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RPM, 2C9A, 2V5Y
Ідентифікатори
Символи	PTPRM, PTPRL1, R-PTP-MU, RPTPM, RPTPU, hR-PTPu, protein tyrosine phosphatase, receptor type M, protein tyrosine phosphatase receptor type M
Зовнішні ІД	OMIM: 176888 MGI: 102694 HomoloGene: 37694 GeneCards: PTPRM
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • phosphatase activity; • cadherin binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • protein tyrosine phosphatase activity; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • integral component of plasma membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • lamellipodium; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• дефосфорилювання; • retina layer formation; • protein dephosphorylation; • negative regulation of endothelial cell migration; • negative regulation of endothelial cell proliferation; • Адгезія клітин; • negative regulation of angiogenesis; • neuron projection development; • Сигнальна трансдукція; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • retinal ganglion cell axon guidance; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5797
	19274
	ENSG00000173482
	ENSMUSG00000033278
	P28827
	P28828
NM_001105244; NM_002845; NM_001378142; NM_001378143; NM_001378144;
	NM_001378145; NM_001378146; NM_001378147
	NM_008984; NM_001357625
NP_001098714; NP_002836; NP_001365071; NP_001365072; NP_001365073;
	NP_001365074; NP_001365075; NP_001365076
	NP_033010; NP_001344554
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRM (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 452 амінокислот, а молекулярна маса — 163 682[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGLGTCLAT	LAGLLLTAAG	ETFSGGCLFD	EPYSTCGYSQ	SEGDDFNWEQ
VNTLTKPTSD	PWMPSGSFML	VNASGRPEGQ	RAHLLLPQLK	ENDTHCIDFH
YFVSSKSNSP	PGLLNVYVKV	NNGPLGNPIW	NISGDPTRTW	NRAELAISTF
WPNFYQVIFE	VITSGHQGYL	AIDEVKVLGH	PCTRTPHFLR	IQNVEVNAGQ
FATFQCSAIG	RTVAGDRLWL	QGIDVRDAPL	KEIKVTSSRR	FIASFNVVNT
TKRDAGKYRC	MIRTEGGVGI	SNYAELVVKE	PPVPIAPPQL	ASVGATYLWI
QLNANSINGD	GPIVAREVEY	CTASGSWNDR	QPVDSTSYKI	GHLDPDTEYE
ISVLLTRPGE	GGTGSPGPAL	RTRTKCADPM	RGPRKLEVVE	VKSRQITIRW
EPFGYNVTRC	HSYNLTVHYC	YQVGGQEQVR	EEVSWDTENS	HPQHTITNLS
PYTNVSVKLI	LMNPEGRKES	QELIVQTDED	LPGAVPTESI	QGSTFEEKIF
LQWREPTQTY	GVITLYEITY	KAVSSFDPEI	DLSNQSGRVS	KLGNETHFLF
FGLYPGTTYS	FTIRASTAKG	FGPPATNQFT	TKISAPSMPA	YELETPLNQT
DNTVTVMLKP	AHSRGAPVSV	YQIVVEEERP	RRTKKTTEIL	KCYPVPIHFQ
NASLLNSQYY	FAAEFPADSL	QAAQPFTIGD	NKTYNGYWNT	PLLPYKSYRI
YFQAASRANG	ETKIDCVQVA	TKGAATPKPV	PEPEKQTDHT	VKIAGVIAGI
LLFVIIFLGV	VLVMKKRKLA	KKRKETMSST	RQEMTVMVNS	MDKSYAEQGT
NCDEAFSFMD	THNLNGRSVS	SPSSFTMKTN	TLSTSVPNSY	YPDETHTMAS
DTSSLVQSHT	YKKREPADVP	YQTGQLHPAI	RVADLLQHIT	QMKCAEGYGF
KEEYESFFEG	QSAPWDSAKK	DENRMKNRYG	NIIAYDHSRV	RLQTIEGDTN
SDYINGNYID	GYHRPNHYIA	TQGPMQETIY	DFWRMVWHEN	TASIIMVTNL
VEVGRVKCCK	YWPDDTEIYK	DIKVTLIETE	LLAEYVIRTF	AVEKRGVHEI
REIRQFHFTG	WPDHGVPYHA	TGLLGFVRQV	KSKSPPSAGP	LVVHCSAGAG
RTGCFIVIDI	MLDMAEREGV	VDIYNCVREL	RSRRVNMVQT	EEQYVFIHDA
ILEACLCGDT	SVPASQVRSL	YYDMNKLDPQ	TNSSQIKEEF	RTLNMVTPTL
RVEDCSIALL	PRNHEKNRCM	DILPPDRCLP	FLITIDGESS	NYINAALMDS
YKQPSAFIVT	QHPLPNTVKD	FWRLVLDYHC	TSVVMLNDVD	PAQLCPQYWP
ENGVHRHGPI	QVEFVSADLE	EDIISRIFRI	YNAARPQDGY	RMVQQFQFLG
WPMYRDTPVS	KRSFLKLIRQ	VDKWQEEYNG	GEGRTVVHCL	NGGGRSGTFC
AISIVCEMLR	HQRTVDVFHA	VKTLRNNKPN	MVDLLDQYKF	CYEVALEYLN
SG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hoffmann K.M., Tonks N.K., Barford D. (1997). The crystal structure of domain 1 of receptor protein-tyrosine phosphatase mu.. J. Biol. Chem. 272: 27505 — 27508. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.44.27505

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9675 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P28827 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9675 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P28827 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.