RANBP2

RANBP2
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RRP, 1XKE, 1Z5S, 3UIN, 3UIO, 3UIP, 4I9Y, 4L6E, 4LQW, 5CLL, 5CLQ, 2LAS
Ідентифікатори
Символи	RANBP2, ADANE, ANE1, IIAE3, NUP358, TRP1, TRP2, RAN binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 601181 HomoloGene: 136803 GeneCards: RANBP2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; • зв'язування з іоном металу; • ligase activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • SUMO transferase activity; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • cyclosporin A binding; • transferase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • Ядерна мембрана; • мембрана; • Ядерна пора; • nuclear inclusion body; • nuclear pore nuclear basket; • клітинне ядро; • nuclear envelope; • annulate lamellae; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • цитоплазма; • центросома; • мітохондрія; • nuclear pore cytoplasmic filaments; • cytoplasmic periphery of the nuclear pore complex; • host cell;
Біологічний процес	• mRNA transport; • viral transcription; • intracellular transport; • protein sumoylation; • protein peptidyl-prolyl isomerization; • mitotic nuclear membrane disassembly; • Згортання білків; • regulation of cellular response to heat; • protein transport; • GO:0022415 viral process; • NLS-bearing protein import into nucleus; • GO:0046795 intracellular transport of virus; • mRNA export from nucleus; • tRNA export from nucleus; • sister chromatid cohesion; • centrosome localization; • G1 phase; • RNA export from nucleus; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0043146 spindle organization; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of mitotic centrosome separation; • response to amphetamine; • positive regulation of glucokinase activity; • regulation of gene silencing by miRNA; • regulation of glycolytic process; • транспорт; • regulation of gluconeogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5903
	н/д
	ENSG00000153201
	н/д
	P49792
	н/д
	NM_006267
	н/д
	NP_006258
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

RANBP2 (англ. RAN binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 224 амінокислот, а молекулярна маса — 358 199[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRSKADVER	YIASVQGSTP	SPRQKSMKGF	YFAKLYYEAK	EYDLAKKYIC
TYINVQERDP	KAHRFLGLLY	ELEENTDKAV	ECYRRSVELN	PTQKDLVLKI
AELLCKNDVT	DGRAKYWLER	AAKLFPGSPA	IYKLKEQLLD	CEGEDGWNKL
FDLIQSELYV	RPDDVHVNIR	LVEVYRSTKR	LKDAVAHCHE	AERNIALRSS
LEWNSCVVQT	LKEYLESLQC	LESDKSDWRA	TNTDLLLAYA	NLMLLTLSTR
DVQESRELLQ	SFDSALQSVK	SLGGNDELSA	TFLEMKGHFY	MHAGSLLLKM
GQHSSNVQWR	ALSELAALCY	LIAFQVPRPK	IKLIKGEAGQ	NLLEMMACDR
LSQSGHMLLN	LSRGKQDFLK	EIVETFANKS	GQSALYDALF	SSQSPKDTSF
LGSDDIGNID	VREPELEDLT	RYDVGAIRAH	NGSLQHLTWL	GLQWNSLPAL
PGIRKWLKQL	FHHLPHETSR	LETNAPESIC	ILDLEVFLLG	VVYTSHLQLK
EKCNSHHSSY	QPLCLPLPVC	KQLCTERQKS	WWDAVCTLIH	RKAVPGNVAK
LRLLVQHEIN	TLRAQEKHGL	QPALLVHWAE	CLQKTGSGLN	SFYDQREYIG
RSVHYWKKVL	PLLKIIKKKN	SIPEPIDPLF	KHFHSVDIQA	SEIVEYEEDA
HITFAILDAV	NGNIEDAVTA	FESIKSVVSY	WNLALIFHRK	AEDIENDALS
PEEQEECKNY	LRKTRDYLIK	IIDDSDSNLS	VVKKLPVPLE	SVKEMLNSVM
QELEDYSEGG	PLYKNGSLRN	ADSEIKHSTP	SPTRYSLSPS	KSYKYSPKTP
PRWAEDQNSL	LKMICQQVEA	IKKEMQELKL	NSSNSASPHR	WPTENYGPDS
VPDGYQGSQT	FHGAPLTVAT	TGPSVYYSQS	PAYNSQYLLR	PAANVTPTKG
PVYGMNRLPP	QQHIYAYPQQ	MHTPPVQSSS	ACMFSQEMYG	PPALRFESPA
TGILSPRGDD	YFNYNVQQTS	TNPPLPEPGY	FTKPPIAAHA	SRSAESKTIE
FGKTNFVQPM	PGEGLRPSLP	TQAHTTQPTP	FKFNSNFKSN	DGDFTFSSPQ
VVTQPPPAAY	SNSESLLGLL	TSDKPLQGDG	YSGAKPIPGG	QTIGPRNTFN
FGSKNVSGIS	FTENMGSSQQ	KNSGFRRSDD	MFTFHGPGKS	VFGTPTLETA
NKNHETDGGS	AHGDDDDDGP	HFEPVVPLPD	KIEVKTGEED	EEEFFCNRAK
LFRFDVESKE	WKERGIGNVK	ILRHKTSGKI	RLLMRREQVL	KICANHYISP
DMKLTPNAGS	DRSFVWHALD	YADELPKPEQ	LAIRFKTPEE	AALFKCKFEE
AQSILKAPGT	NVAMASNQAV	RIVKEPTSHD	NKDICKSDAG	NLNFEFQVAK
KEGSWWHCNS	CSLKNASTAK	KCVSCQNLNP	SNKELVGPPL	AETVFTPKTS
PENVQDRFAL	VTPKKEGHWD	CSICLVRNEP	TVSRCIACQN	TKSANKSGSS
FVHQASFKFG	QGDLPKPINS	DFRSVFSTKE	GQWDCSACLV	QNEGSSTKCA
ACQNPRKQSL	PATSIPTPAS	FKFGTSETSK	TLKSGFEDMF	AKKEGQWDCS
SCLVRNEANA	TRCVACQNPD	KPSPSTSVPA	PASFKFGTSE	TSKAPKSGFE
GMFTKKEGQW	DCSVCLVRNE	ASATKCIACQ	NPGKQNQTTS	AVSTPASSET
SKAPKSGFEG	MFTKKEGQWD	CSVCLVRNEA	SATKCIACQN	PGKQNQTTSA
VSTPASSETS	KAPKSGFEGM	FTKKEGQWDC	SVCLVRNEAS	ATKCIACQCP
SKQNQTTAIS	TPASSEISKA	PKSGFEGMFI	RKGQWDCSVC	CVQNESSSLK
CVACDASKPT	HKPIAEAPSA	FTLGSEMKLH	DSSGSQVGTG	FKSNFSEKAS
KFGNTEQGFK	FGHVDQENSP	SFMFQGSSNT	EFKSTKEGFS	IPVSADGFKF
GISEPGNQEK	KSEKPLENGT	GFQAQDISGQ	KNGRGVIFGQ	TSSTFTFADL
AKSTSGEGFQ	FGKKDPNFKG	FSGAGEKLFS	SQYGKMANKA	NTSGDFEKDD
DAYKTEDSDD	IHFEPVVQMP	EKVELVTGEE	DEKVLYSQRV	KLFRFDAEVS
QWKERGLGNL	KILKNEVNGK	LRMLMRREQV	LKVCANHWIT	TTMNLKPLSG
SDRAWMWLAS	DFSDGDAKLE	QLAAKFKTPE	LAEEFKQKFE	ECQRLLLDIP
LQTPHKLVDT	GRAAKLIQRA	EEMKSGLKDF	KTFLTNDQTK	VTEEENKGSG
TGAAGASDTT	IKPNPENTGP	TLEWDNYDLR	EDALDDSVSS	SSVHASPLAS
SPVRKNLFRF	GESTTGFNFS	FKSALSPSKS	PAKLNQSGTS	VGTDEESDVT
QEEERDGQYF	EPVVPLPDLV	EVSSGEENEQ	VVFSHRAKLY	RYDKDVGQWK
ERGIGDIKIL	QNYDNKQVRI	VMRRDQVLKL	CANHRITPDM	TLQNMKGTER
VWLWTACDFA	DGERKVEHLA	VRFKLQDVAD	SFKKIFDEAK	TAQEKDSLIT
PHVSRSSTPR	ESPCGKIAVA	VLEETTRERT	DVIQGDDVAD	ATSEVEVSST
SETTPKAVVS	PPKFVFGSES	VKSIFSSEKS	KPFAFGNSSA	TGSLFGFSFN
APLKSNNSET	SSVAQSGSES	KVEPKKCELS	KNSDIEQSSD	SKVKNLFASF
PTEESSINYT	FKTPEKAKEK	KKPEDSPSDD	DVLIVYELTP	TAEQKALATK
LKLPPTFFCY	KNRPDYVSEE	EEDDEDFETA	VKKLNGKLYL	DGSEKCRPLE
ENTADNEKEC	IIVWEKKPTV	EEKAKADTLK	LPPTFFCGVC	SDTDEDNGNG
EDFQSELQKV	QEAQKSQTEE	ITSTTDSVYT	GGTEVMVPSF	CKSEEPDSIT
KSISSPSVSS	ETMDKPVDLS	TRKEIDTDST	SQGESKIVSF	GFGSSTGLSF
ADLASSNSGD	FAFGSKDKNF	QWANTGAAVF	GTQSVGTQSA	GKVGEDEDGS
DEEVVHNEDI	HFEPIVSLPE	VEVKSGEEDE	EILFKERAKL	YRWDRDVSQW
KERGVGDIKI	LWHTMKNYYR	ILMRRDQVFK	VCANHVITKT	MELKPLNVSN
NALVWTASDY	ADGEAKVEQL	AVRFKTKEVA	DCFKKTFEEC	QQNLMKLQKG
HVSLAAELSK	ETNPVVFFDV	CADGEPLGRI	TMELFSNIVP	RTAENFRALC
TGEKGFGFKN	SIFHRVIPDF	VCQGGDITKH	DGTGGQSIYG	DKFEDENFDV
KHTGPGLLSM	ANQGQNTNNS	QFVITLKKAE	HLDFKHVVFG	FVKDGMDTVK
KIESFGSPKG	SVCRRITITE	CGQI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, транспорт мРНК, транслокація, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

Wu J., Matunis M.J., Kraemer D., Blobel G., Coutavas E. (1995). Nup358, a cytoplasmically exposed nucleoporin with peptide repeats, Ran-GTP binding sites, zinc fingers, a cyclophilin A homologous domain, and a leucine-rich region.. J. Biol. Chem. 270: 14209 — 14213. PubMed DOI:10.1074/jbc.270.23.14209
Beddow A.L., Richards S.A., Orem N.R., Macara I.G. (1995). The Ran/TC4 GTPase-binding domain: identification by expression cloning and characterization of a conserved sequence motif.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 3328 — 3332. PubMed DOI:10.1073/pnas.92.8.3328
Pichler A., Gast A., Seeler J.S., Dejean A., Melchior F. (2002). The nucleoporin RanBP2 has SUMO1 E3 ligase activity.. Cell 108: 109 — 120. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(01)00633-X
Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export.. J. Cell Biol. 156: 617 — 630. PubMed DOI:10.1083/jcb.200106046
Pichler A., Knipscheer P., Saitoh H., Sixma T.K., Melchior F. (2004). The RanBP2 SUMO E3 ligase is neither HECT- nor RING-type.. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 984 — 991. PubMed DOI:10.1038/nsmb834
Song J., Durrin L.K., Wilkinson T.A., Krontiris T.G., Chen Y. (2004). Identification of a SUMO-binding motif that recognizes SUMO-modified proteins.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 14373 — 14378. PubMed DOI:10.1073/pnas.0403498101

Примітки

Human PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9848 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, P49792 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9848 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-3] UniProt, P49792 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.